RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.29■■■□□ 2.28
TMEM200B-201ENST00000420504 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.28■■■□□ 2.28
TMEM200B-201ENST00000420504 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM200B-201ENST00000420504 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
TMEM200B-201ENST00000420504 TMC1Q8TDI8 760 aa29.25■■■□□ 2.27
TMEM200B-201ENST00000420504 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TMEM200B-201ENST00000420504 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.23■■■□□ 2.27
TMEM200B-201ENST00000420504 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
TMEM200B-201ENST00000420504 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
TMEM200B-201ENST00000420504 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.19■■■□□ 2.26
TMEM200B-201ENST00000420504 RALBP1Q15311 655 aa29.18■■■□□ 2.26
TMEM200B-201ENST00000420504 BCL11AQ9H165 835 aa29.18■■■□□ 2.26
TMEM200B-201ENST00000420504 UNC13BO14795 1591 aa29.18■■■□□ 2.26
TMEM200B-201ENST00000420504 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.17■■■□□ 2.26
TMEM200B-201ENST00000420504 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.17■■■□□ 2.26
TMEM200B-201ENST00000420504 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.15■■■□□ 2.26
TMEM200B-201ENST00000420504 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.14■■■□□ 2.26
TMEM200B-201ENST00000420504 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.14■■■□□ 2.26
TMEM200B-201ENST00000420504 PLA2R1Q13018 1463 aa29.13■■■□□ 2.25
TMEM200B-201ENST00000420504 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.12■■■□□ 2.25
TMEM200B-201ENST00000420504 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.1■■■□□ 2.25
TMEM200B-201ENST00000420504 LAMC1P11047 1609 aa29.09■■■□□ 2.25
TMEM200B-201ENST00000420504 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.09■■■□□ 2.25
TMEM200B-201ENST00000420504 A2MP01023 1474 aa29.08■■■□□ 2.25
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.08■■■□□ 2.25
TMEM200B-201ENST00000420504 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.07■■■□□ 2.24
TMEM200B-201ENST00000420504 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
TMEM200B-201ENST00000420504 PLXNC1O60486 1568 aa29.06■■■□□ 2.24
TMEM200B-201ENST00000420504 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.06■■■□□ 2.24
TMEM200B-201ENST00000420504 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.05■■■□□ 2.24
TMEM200B-201ENST00000420504 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.05■■■□□ 2.24
TMEM200B-201ENST00000420504 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
TMEM200B-201ENST00000420504 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
TMEM200B-201ENST00000420504 NLRP13Q86W25 1043 aa29.03■■■□□ 2.24
TMEM200B-201ENST00000420504 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
TMEM200B-201ENST00000420504 CHD1O14646 1710 aa29.01■■■□□ 2.23
TMEM200B-201ENST00000420504 RGL3Q3MIN7 710 aa29.01■■■□□ 2.23
TMEM200B-201ENST00000420504 SHROOM2Q13796 1616 aa29.01■■■□□ 2.23
TMEM200B-201ENST00000420504 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.99■■■□□ 2.23
TMEM200B-201ENST00000420504 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
TMEM200B-201ENST00000420504 ATP10AO60312 1499 aa28.97■■■□□ 2.23
TMEM200B-201ENST00000420504 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.97■■■□□ 2.23
TMEM200B-201ENST00000420504 TESK2Q96S53 571 aa28.97■■■□□ 2.23
TMEM200B-201ENST00000420504 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.95■■■□□ 2.23
TMEM200B-201ENST00000420504 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.23
TMEM200B-201ENST00000420504 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
TMEM200B-201ENST00000420504 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.94■■■□□ 2.22
TMEM200B-201ENST00000420504 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.93■■■□□ 2.22
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCC2Q92887 1545 aa28.92■■■□□ 2.22
TMEM200B-201ENST00000420504 PDE3BQ13370 1112 aa28.9■■■□□ 2.22
TMEM200B-201ENST00000420504 ERBINQ96RT1 1412 aa28.9■■■□□ 2.22
TMEM200B-201ENST00000420504 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
TMEM200B-201ENST00000420504 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.89■■■□□ 2.22
TMEM200B-201ENST00000420504 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.88■■■□□ 2.21
TMEM200B-201ENST00000420504 INSRP06213 1382 aa28.87■■■□□ 2.21
TMEM200B-201ENST00000420504 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.87■■■□□ 2.21
TMEM200B-201ENST00000420504 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
TMEM200B-201ENST00000420504 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
TMEM200B-201ENST00000420504 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
TMEM200B-201ENST00000420504 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
TMEM200B-201ENST00000420504 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.83■■■□□ 2.21
TMEM200B-201ENST00000420504 PANK3Q9H999 370 aa28.83■■■□□ 2.21
TMEM200B-201ENST00000420504 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
TMEM200B-201ENST00000420504 PLCH2O75038 1416 aa28.8■■■□□ 2.2
TMEM200B-201ENST00000420504 TMF1P82094 1093 aa28.8■■■□□ 2.2
TMEM200B-201ENST00000420504 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.79■■■□□ 2.2
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCC1P33527 1531 aa28.78■■■□□ 2.2
TMEM200B-201ENST00000420504 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.76■■■□□ 2.2
TMEM200B-201ENST00000420504 MADDQ8WXG6 1647 aa28.76■■■□□ 2.19
TMEM200B-201ENST00000420504 IQGAP1P46940 1657 aa28.75■■■□□ 2.19
TMEM200B-201ENST00000420504 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
TMEM200B-201ENST00000420504 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
TMEM200B-201ENST00000420504 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
TMEM200B-201ENST00000420504 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.73■■■□□ 2.19
TMEM200B-201ENST00000420504 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.72■■■□□ 2.19
TMEM200B-201ENST00000420504 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.7■■■□□ 2.19
TMEM200B-201ENST00000420504 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.7■■■□□ 2.18
TMEM200B-201ENST00000420504 NBR1Q14596 966 aa28.68■■■□□ 2.18
TMEM200B-201ENST00000420504 CEP152O94986 1710 aa28.68■■■□□ 2.18
TMEM200B-201ENST00000420504 TRPM2O94759 1503 aa28.68■■■□□ 2.18
TMEM200B-201ENST00000420504 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
TMEM200B-201ENST00000420504 DEKP35659 375 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
TMEM200B-201ENST00000420504 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.65■■■□□ 2.18
TMEM200B-201ENST00000420504 SYNMO15061 1565 aa28.62■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.62■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 DEPDC5O75140 1603 aa28.62■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 PTPRTO14522 1441 aa28.62■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 CLTCL1P53675 1640 aa28.61■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.61■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.61■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 PLIN1O60240 522 aa28.6■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.6■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 PPP2R1AP30153 589 aa28.58■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.58■■■□□ 2.17
TMEM200B-201ENST00000420504 MS4A1P11836 297 aa28.57■■■□□ 2.16
TMEM200B-201ENST00000420504 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
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