RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396914.3

CHCHD4-202, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD4, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-202ENST00000396914 ROCK1Q13464 1354 aa44.5■■■■■ 4.71
CHCHD4-202ENST00000396914 PPP6R1Q9UPN7 881 aa44.43■■■■■ 4.7
CHCHD4-202ENST00000396914 CNTLNQ9NXG0 1405 aa44.42■■■■■ 4.7
CHCHD4-202ENST00000396914 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa44.41■■■■■ 4.7
CHCHD4-202ENST00000396914 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
CHCHD4-202ENST00000396914 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
CHCHD4-202ENST00000396914 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP44.39■■■■■ 4.72e-7■■□□□ 13.3
CHCHD4-202ENST00000396914 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa44.38■■■■■ 4.7
CHCHD4-202ENST00000396914 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
CHCHD4-202ENST00000396914 KDM5DQ9BY66 1539 aa44.32■■■■■ 4.68
CHCHD4-202ENST00000396914 ZMYM3Q14202 1370 aa44.29■■■■■ 4.68
CHCHD4-202ENST00000396914 MROH2AA6NES4 1674 aa44.28■■■■■ 4.68
CHCHD4-202ENST00000396914 C3P01024 1663 aa44.28■■■■■ 4.68
CHCHD4-202ENST00000396914 MROH1Q8NDA8 1641 aa44.27■■■■■ 4.68
CHCHD4-202ENST00000396914 KANK1Q14678 1352 aa44.26■■■■■ 4.68
CHCHD4-202ENST00000396914 FAM135AQ9P2D6 1515 aa44.25■■■■■ 4.67
CHCHD4-202ENST00000396914 DEPDC5O75140 1603 aa44.23■■■■■ 4.67
CHCHD4-202ENST00000396914 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP44.23■■■■■ 4.67
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCC3O15438 1527 aa44.19■■■■■ 4.66
CHCHD4-202ENST00000396914 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
CHCHD4-202ENST00000396914 NAIPQ13075 1403 aa44.18■■■■■ 4.66
CHCHD4-202ENST00000396914 CEP152O94986 1710 aa44.18■■■■■ 4.66
CHCHD4-202ENST00000396914 GCC2Q8IWJ2 1684 aa44.16■■■■■ 4.66
CHCHD4-202ENST00000396914 HFM1A2PYH4 1435 aa44.14■■■■■ 4.66
CHCHD4-202ENST00000396914 UNC13BO14795 1591 aa44.07■■■■■ 4.65
CHCHD4-202ENST00000396914 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa44.07■■■■■ 4.65
CHCHD4-202ENST00000396914 PZPP20742 1482 aa44.04■■■■■ 4.64
CHCHD4-202ENST00000396914 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP44.03■■■■■ 4.64
CHCHD4-202ENST00000396914 VWDEQ8N2E2 1590 aa44.02■■■■■ 4.64
CHCHD4-202ENST00000396914 NPATQ14207 1427 aa44.02■■■■■ 4.64
CHCHD4-202ENST00000396914 NUP155O75694 1391 aa44.02■■■■■ 4.64
CHCHD4-202ENST00000396914 LMTK2Q8IWU2 1503 aa43.97■■■■■ 4.63
CHCHD4-202ENST00000396914 TRIM52Q96A61 297 aa43.97■■■■■ 4.63
CHCHD4-202ENST00000396914 PREX1Q8TCU6 1659 aa43.96■■■■■ 4.63
CHCHD4-202ENST00000396914 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
CHCHD4-202ENST00000396914 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa43.94■■■■■ 4.62
CHCHD4-202ENST00000396914 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
CHCHD4-202ENST00000396914 IQGAP3Q86VI3 1631 aa43.9■■■■■ 4.62
CHCHD4-202ENST00000396914 TNRQ92752 1358 aa43.9■■■■■ 4.62
CHCHD4-202ENST00000396914 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa43.89■■■■■ 4.62
CHCHD4-202ENST00000396914 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.89■■■■■ 4.62
CHCHD4-202ENST00000396914 LMTK3Q96Q04 1460 aa43.88■■■■■ 4.62
CHCHD4-202ENST00000396914 EFCAB6Q5THR3 1501 aa43.88■■■■■ 4.62
CHCHD4-202ENST00000396914 TET3O43151 1660 aa43.87■■■■■ 4.61
CHCHD4-202ENST00000396914 ERVK-7P63135 1459 aa43.85■■■■■ 4.61
CHCHD4-202ENST00000396914 MYO3AQ8NEV4 1616 aa43.83■■■■■ 4.61
CHCHD4-202ENST00000396914 HSPA2P54652 639 aa43.81■■■■■ 4.6
CHCHD4-202ENST00000396914 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa43.8■■■■■ 4.6
CHCHD4-202ENST00000396914 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa43.76■■■■■ 4.6
CHCHD4-202ENST00000396914 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
CHCHD4-202ENST00000396914 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
CHCHD4-202ENST00000396914 E9PCH4 1651 aa43.72■■■■■ 4.59
CHCHD4-202ENST00000396914 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
CHCHD4-202ENST00000396914 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
CHCHD4-202ENST00000396914 NLRP1Q9C000 1473 aa43.68■■■■■ 4.58
CHCHD4-202ENST00000396914 A2ML1A8K2U0 1454 aa43.67■■■■■ 4.58
CHCHD4-202ENST00000396914 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
CHCHD4-202ENST00000396914 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
CHCHD4-202ENST00000396914 NOS1P29475 1434 aa43.63■■■■■ 4.58
CHCHD4-202ENST00000396914 PKD2Q13563 968 aa43.62■■■■■ 4.57
CHCHD4-202ENST00000396914 SYNMO15061 1565 aa43.6■■■■■ 4.57
CHCHD4-202ENST00000396914 UGGT1Q9NYU2 1555 aa43.57■■■■■ 4.56
CHCHD4-202ENST00000396914 STAG3Q9UJ98 1225 aa43.56■■■■■ 4.56
CHCHD4-202ENST00000396914 MPHOSPH9Q99550 1183 aa43.56■■■■■ 4.56
CHCHD4-202ENST00000396914 IDI1Q13907 227 aa43.53■■■■■ 4.56
CHCHD4-202ENST00000396914 SLC52A1Q9NWF4 448 aa43.53■■■■■ 4.56
CHCHD4-202ENST00000396914 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
CHCHD4-202ENST00000396914 PIK3C2BO00750 1634 aa43.5■■■■■ 4.55
CHCHD4-202ENST00000396914 HRCP23327 699 aa43.49■■■■■ 4.55
CHCHD4-202ENST00000396914 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa43.48■■■■■ 4.55
CHCHD4-202ENST00000396914 FOXD1Q16676 465 aa43.48■■■■■ 4.55
CHCHD4-202ENST00000396914 CHGAP10645 457 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
CHCHD4-202ENST00000396914 UBR1Q8IWV7 1749 aa43.44■■■■■ 4.54
CHCHD4-202ENST00000396914 PTPRTO14522 1441 aa43.41■■■■■ 4.54
CHCHD4-202ENST00000396914 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa43.38■■■■■ 4.54
CHCHD4-202ENST00000396914 PLA2R1Q13018 1463 aa43.38■■■■■ 4.54
CHCHD4-202ENST00000396914 STRCQ7RTU9 1775 aa43.36■■■■■ 4.53
CHCHD4-202ENST00000396914 ADGRB3O60242 1522 aa43.35■■■■■ 4.53
CHCHD4-202ENST00000396914 TRPM2O94759 1503 aa43.34■■■■■ 4.53
CHCHD4-202ENST00000396914 ANKLE2Q86XL3 938 aa43.33■■■■■ 4.53
CHCHD4-202ENST00000396914 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
CHCHD4-202ENST00000396914 DMRT2Q9Y5R5 561 aa43.3■■■■■ 4.52
CHCHD4-202ENST00000396914 CLTCL1P53675 1640 aa43.27■■■■■ 4.52
CHCHD4-202ENST00000396914 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa43.25■■■■■ 4.51
CHCHD4-202ENST00000396914 EID1Q9Y6B2 187 aa43.24■■■■■ 4.51
CHCHD4-202ENST00000396914 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
CHCHD4-202ENST00000396914 MYO5BQ9ULV0 1848 aa43.24■■■■■ 4.51
CHCHD4-202ENST00000396914 TMEM2Q9UHN6 1383 aa43.23■■■■■ 4.51
CHCHD4-202ENST00000396914 TXNDC2Q86VQ3 553 aa43.22■■■■■ 4.51
CHCHD4-202ENST00000396914 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.21■■■■■ 4.51
CHCHD4-202ENST00000396914 SLIT1O75093 1534 aa43.2■■■■■ 4.51
CHCHD4-202ENST00000396914 CCDC144AA2RUR9 1427 aa43.19■■■■■ 4.5
CHCHD4-202ENST00000396914 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
CHCHD4-202ENST00000396914 ARHGAP23Q9P227 1491 aa43.17■■■■■ 4.5
CHCHD4-202ENST00000396914 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
CHCHD4-202ENST00000396914 KIF1BO60333 1816 aa43.16■■■■■ 4.5
CHCHD4-202ENST00000396914 LTKP29376 864 aa43.14■■■■■ 4.5
CHCHD4-202ENST00000396914 HDGFP51858 240 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
CHCHD4-202ENST00000396914 NEURL4Q96JN8 1562 aa43.11■■■■■ 4.49
CHCHD4-202ENST00000396914 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms