RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380305.4

PSMG4-202, Transcript of proteasome assembly chaperone 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PSMG4, Length 489 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG4-202ENST00000380305 NCOA1Q15788 1441 aa40.61■■■■■ 4.09
PSMG4-202ENST00000380305 ADGRL2O95490 1459 aa40.59■■■■■ 4.09
PSMG4-202ENST00000380305 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.58■■■■■ 4.095e-7■■■■□ 20.6
PSMG4-202ENST00000380305 ERBINQ96RT1 1412 aa40.58■■■■■ 4.09
PSMG4-202ENST00000380305 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
PSMG4-202ENST00000380305 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.57■■■■■ 4.08
PSMG4-202ENST00000380305 PTPRKQ15262 1439 aa40.56■■■■■ 4.08
PSMG4-202ENST00000380305 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.54■■■■■ 4.08
PSMG4-202ENST00000380305 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.54■■■■■ 4.08
PSMG4-202ENST00000380305 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.53■■■■■ 4.08
PSMG4-202ENST00000380305 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
PSMG4-202ENST00000380305 ITGAEP38570 1179 aa40.51■■■■■ 4.08
PSMG4-202ENST00000380305 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.49■■■■■ 4.07
PSMG4-202ENST00000380305 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
PSMG4-202ENST00000380305 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.46■■■■■ 4.07
PSMG4-202ENST00000380305 NPATQ14207 1427 aa40.46■■■■■ 4.07
PSMG4-202ENST00000380305 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.43■■■■■ 4.06
PSMG4-202ENST00000380305 ROCK1Q13464 1354 aa40.41■■■■■ 4.06
PSMG4-202ENST00000380305 HSPA2P54652 639 aa40.41■■■■■ 4.06
PSMG4-202ENST00000380305 ABCC3O15438 1527 aa40.41■■■■■ 4.06
PSMG4-202ENST00000380305 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.06
PSMG4-202ENST00000380305 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
PSMG4-202ENST00000380305 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.38■■■■■ 4.054e-6■■■■□ 23.5
PSMG4-202ENST00000380305 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.38■■■■■ 4.05
PSMG4-202ENST00000380305 DEPDC5O75140 1603 aa40.36■■■■■ 4.05
PSMG4-202ENST00000380305 PZPP20742 1482 aa40.35■■■■■ 4.05
PSMG4-202ENST00000380305 CEP152O94986 1710 aa40.32■■■■■ 4.05
PSMG4-202ENST00000380305 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
PSMG4-202ENST00000380305 KANK1Q14678 1352 aa40.31■■■■■ 4.04
PSMG4-202ENST00000380305 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.25■■■■■ 4.03
PSMG4-202ENST00000380305 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.24■■■■■ 4.03
PSMG4-202ENST00000380305 TNRQ92752 1358 aa40.23■■■■■ 4.03
PSMG4-202ENST00000380305 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.2■■■■■ 4.03
PSMG4-202ENST00000380305 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.16■■■■■ 4.02
PSMG4-202ENST00000380305 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.15■■■■■ 4.02
PSMG4-202ENST00000380305 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
PSMG4-202ENST00000380305 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
PSMG4-202ENST00000380305 ERVK-7P63135 1459 aa40.13■■■■■ 4.01
PSMG4-202ENST00000380305 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.12■■■■■ 4.01
PSMG4-202ENST00000380305 UNC13BO14795 1591 aa40.11■■■■■ 4.01
PSMG4-202ENST00000380305 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.1■■■■■ 4.01
PSMG4-202ENST00000380305 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
PSMG4-202ENST00000380305 NAIPQ13075 1403 aa40.05■■■■■ 4
PSMG4-202ENST00000380305 NLRP1Q9C000 1473 aa40.05■■■■■ 4
PSMG4-202ENST00000380305 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.04■■■■■ 4
PSMG4-202ENST00000380305 STRCQ7RTU9 1775 aa40.02■■■■■ 4
PSMG4-202ENST00000380305 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40■■■■□ 3.99
PSMG4-202ENST00000380305 HFM1A2PYH4 1435 aa39.99■■■■□ 3.99
PSMG4-202ENST00000380305 NUP155O75694 1391 aa39.98■■■■□ 3.99
PSMG4-202ENST00000380305 TET3O43151 1660 aa39.97■■■■□ 3.99
PSMG4-202ENST00000380305 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.95■■■■□ 3.99
PSMG4-202ENST00000380305 PLA2R1Q13018 1463 aa39.94■■■■□ 3.98
PSMG4-202ENST00000380305 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.93■■■■□ 3.98
PSMG4-202ENST00000380305 UGGT1Q9NYU2 1555 aa39.93■■■■□ 3.98
PSMG4-202ENST00000380305 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
PSMG4-202ENST00000380305 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
PSMG4-202ENST00000380305 NOS1P29475 1434 aa39.88■■■■□ 3.97
PSMG4-202ENST00000380305 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.88■■■■□ 3.97
PSMG4-202ENST00000380305 PKD2Q13563 968 aa39.84■■■■□ 3.97
PSMG4-202ENST00000380305 SYNMO15061 1565 aa39.84■■■■□ 3.97
PSMG4-202ENST00000380305 PTPRTO14522 1441 aa39.83■■■■□ 3.97
PSMG4-202ENST00000380305 E9PCH4 1651 aa39.81■■■■□ 3.96
PSMG4-202ENST00000380305 IDI1Q13907 227 aa39.78■■■■□ 3.96
PSMG4-202ENST00000380305 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.78■■■■□ 3.96
PSMG4-202ENST00000380305 TRIM52Q96A61 297 aa39.77■■■■□ 3.96
PSMG4-202ENST00000380305 PIK3C2BO00750 1634 aa39.76■■■■□ 3.96
PSMG4-202ENST00000380305 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.74■■■■□ 3.95
PSMG4-202ENST00000380305 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.74■■■■□ 3.95
PSMG4-202ENST00000380305 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.74■■■■□ 3.95
PSMG4-202ENST00000380305 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
PSMG4-202ENST00000380305 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.66■■■■□ 3.94
PSMG4-202ENST00000380305 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
PSMG4-202ENST00000380305 ADGRB3O60242 1522 aa39.63■■■■□ 3.93
PSMG4-202ENST00000380305 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.63■■■■□ 3.93
PSMG4-202ENST00000380305 SLIT1O75093 1534 aa39.61■■■■□ 3.93
PSMG4-202ENST00000380305 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.61■■■■□ 3.93
PSMG4-202ENST00000380305 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
PSMG4-202ENST00000380305 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.59■■■■□ 3.93
PSMG4-202ENST00000380305 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
PSMG4-202ENST00000380305 MED14O60244 1454 aa39.57■■■■□ 3.93
PSMG4-202ENST00000380305 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
PSMG4-202ENST00000380305 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.56■■■■□ 3.92
PSMG4-202ENST00000380305 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa39.56■■■■□ 3.92
PSMG4-202ENST00000380305 EID1Q9Y6B2 187 aa39.55■■■■□ 3.92
PSMG4-202ENST00000380305 LTKP29376 864 aa39.54■■■■□ 3.92
PSMG4-202ENST00000380305 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
PSMG4-202ENST00000380305 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.51■■■■□ 3.91
PSMG4-202ENST00000380305 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.49■■■■□ 3.91
PSMG4-202ENST00000380305 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
PSMG4-202ENST00000380305 IQGAP1P46940 1657 aa39.49■■■■□ 3.91
PSMG4-202ENST00000380305 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
PSMG4-202ENST00000380305 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.47■■■■□ 3.91
PSMG4-202ENST00000380305 CERKQ8TCT0 537 aa39.47■■■■□ 3.91
PSMG4-202ENST00000380305 TRPM2O94759 1503 aa39.45■■■■□ 3.91
PSMG4-202ENST00000380305 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.44■■■■□ 3.9
PSMG4-202ENST00000380305 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.43■■■■□ 3.9
PSMG4-202ENST00000380305 FOXD1Q16676 465 aa39.39■■■■□ 3.9
PSMG4-202ENST00000380305 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.39■■■■□ 3.9
PSMG4-202ENST00000380305 CLTCL1P53675 1640 aa39.38■■■■□ 3.89
PSMG4-202ENST00000380305 ZFYVE9O95405 1425 aa39.38■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms