RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378858.4

LRRN4-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN4, Length 2,692 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4-201ENST00000378858 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.35■■□□□ 1.17
LRRN4-201ENST00000378858 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.35■■□□□ 1.17
LRRN4-201ENST00000378858 PDE3BQ13370 1112 aa22.34■■□□□ 1.17
LRRN4-201ENST00000378858 IFT140Q96RY7 1462 aa22.34■■□□□ 1.17
LRRN4-201ENST00000378858 TSPY4P0CV99 314 aa22.34■■□□□ 1.17
LRRN4-201ENST00000378858 TSPY10P0CW01 314 aa22.34■■□□□ 1.17
LRRN4-201ENST00000378858 BACH2Q9BYV9 841 aa22.34■■□□□ 1.17
LRRN4-201ENST00000378858 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.32■■□□□ 1.16
LRRN4-201ENST00000378858 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.32■■□□□ 1.16
LRRN4-201ENST00000378858 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.31■■□□□ 1.16
LRRN4-201ENST00000378858 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
LRRN4-201ENST00000378858 E9PCH4 1651 aa22.3■■□□□ 1.16
LRRN4-201ENST00000378858 PLIN1O60240 522 aa22.3■■□□□ 1.16
LRRN4-201ENST00000378858 MS4A1P11836 297 aa22.3■■□□□ 1.16
LRRN4-201ENST00000378858 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
LRRN4-201ENST00000378858 CEP170Q5SW79 1584 aa22.28■■□□□ 1.16
LRRN4-201ENST00000378858 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
LRRN4-201ENST00000378858 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.27■■□□□ 1.16
LRRN4-201ENST00000378858 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
LRRN4-201ENST00000378858 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.26■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.26■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 NEFMP07197 916 aa22.26■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 RGL3Q3MIN7 710 aa22.25■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 FBLN2P98095 1184 aa22.25■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.25■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 PTPRGP23470 1445 aa22.24■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 SKAP1Q86WV1 359 aa22.24■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 JPH4Q96JJ6 628 aa22.23■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 CRBNQ96SW2 442 aa22.22■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.22■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.22■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.21■■□□□ 1.15
LRRN4-201ENST00000378858 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 USP35Q9P2H5 1018 aa22.2■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.18■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 PANK3Q9H999 370 aa22.18■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.17■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 ATP10BO94823 1461 aa22.17■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 IL27Q8NEV9 243 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 TESK2Q96S53 571 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
LRRN4-201ENST00000378858 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.14■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 SYNJ2O15056 1496 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 INSRP06213 1382 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 ABCA8O94911 1581 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 A2MP01023 1474 aa22.09■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 ERBINQ96RT1 1412 aa22.09■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.09■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 PLA2R1Q13018 1463 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 TMF1P82094 1093 aa22.08■■□□□ 1.13
LRRN4-201ENST00000378858 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRN4-201ENST00000378858 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.07■■□□□ 1.12
LRRN4-201ENST00000378858 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LRRN4-201ENST00000378858 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRN4-201ENST00000378858 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRN4-201ENST00000378858 SLC4A3P48751 1232 aa22.05■■□□□ 1.12
LRRN4-201ENST00000378858 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LRRN4-201ENST00000378858 NUP160Q12769 1436 aa22.04■■□□□ 1.12
LRRN4-201ENST00000378858 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.03■■□□□ 1.12
LRRN4-201ENST00000378858 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LRRN4-201ENST00000378858 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.02■■□□□ 1.12
LRRN4-201ENST00000378858 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
LRRN4-201ENST00000378858 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.01■■□□□ 1.11
LRRN4-201ENST00000378858 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.01■■□□□ 1.11
LRRN4-201ENST00000378858 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
LRRN4-201ENST00000378858 LAMC1P11047 1609 aa21.99■■□□□ 1.11
LRRN4-201ENST00000378858 NFKBIBQ15653 356 aa21.99■■□□□ 1.11
LRRN4-201ENST00000378858 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
LRRN4-201ENST00000378858 PPP2R1AP30153 589 aa21.98■■□□□ 1.11
LRRN4-201ENST00000378858 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.98■■□□□ 1.11
LRRN4-201ENST00000378858 GSE1Q14687 1217 aa21.96■■□□□ 1.11
LRRN4-201ENST00000378858 GOLGA2Q08379 1002 aa21.96■■□□□ 1.11
LRRN4-201ENST00000378858 FAM161AQ3B820 660 aa21.96■■□□□ 1.11
LRRN4-201ENST00000378858 C8orf34Q49A92 452 aa21.95■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.95■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.95■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 ZNF521Q96K83 1311 aa21.94■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.93■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 UNC13BO14795 1591 aa21.93■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.92■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 PREX2Q70Z35 1606 aa21.92■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.91■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 RGS3P49796 1198 aa21.91■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.9■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 SLFN5Q08AF3 891 aa21.89■■□□□ 1.1
LRRN4-201ENST00000378858 ERCC6Q03468 1493 aa21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms