RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377095.9

SLC25A39-202, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-202ENST00000377095 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.13■■■□□ 2.25
SLC25A39-202ENST00000377095 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.1■■■□□ 2.25
SLC25A39-202ENST00000377095 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.1■■■□□ 2.25
SLC25A39-202ENST00000377095 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.1■■■□□ 2.25
SLC25A39-202ENST00000377095 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SLC25A39-202ENST00000377095 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SLC25A39-202ENST00000377095 DEPDC5O75140 1603 aa29.07■■■□□ 2.24
SLC25A39-202ENST00000377095 MROH2AA6NES4 1674 aa29.06■■■□□ 2.24
SLC25A39-202ENST00000377095 C3P01024 1663 aa29.05■■■□□ 2.24
SLC25A39-202ENST00000377095 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.04■■■□□ 2.24
SLC25A39-202ENST00000377095 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SLC25A39-202ENST00000377095 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.03■■■□□ 2.24
SLC25A39-202ENST00000377095 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
SLC25A39-202ENST00000377095 ZMYM3Q14202 1370 aa29.02■■■□□ 2.24
SLC25A39-202ENST00000377095 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.01■■■□□ 2.23
SLC25A39-202ENST00000377095 NAIPQ13075 1403 aa29■■■□□ 2.23
SLC25A39-202ENST00000377095 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29■■■□□ 2.23
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCC3O15438 1527 aa28.99■■■□□ 2.23
SLC25A39-202ENST00000377095 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
SLC25A39-202ENST00000377095 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.97■■■□□ 2.23
SLC25A39-202ENST00000377095 CEP152O94986 1710 aa28.97■■■□□ 2.23
SLC25A39-202ENST00000377095 HFM1A2PYH4 1435 aa28.97■■■□□ 2.23
SLC25A39-202ENST00000377095 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.232e-8■□□□□ 10.4
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SLC25A39-202ENST00000377095 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
SLC25A39-202ENST00000377095 UNC13BO14795 1591 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC25A39-202ENST00000377095 KANK1Q14678 1352 aa28.9■■■□□ 2.22
SLC25A39-202ENST00000377095 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.89■■■□□ 2.21
SLC25A39-202ENST00000377095 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.89■■■□□ 2.21
SLC25A39-202ENST00000377095 PZPP20742 1482 aa28.88■■■□□ 2.21
SLC25A39-202ENST00000377095 NPATQ14207 1427 aa28.86■■■□□ 2.21
SLC25A39-202ENST00000377095 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
SLC25A39-202ENST00000377095 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
SLC25A39-202ENST00000377095 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.83■■■□□ 2.21
SLC25A39-202ENST00000377095 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.82■■■□□ 2.2
SLC25A39-202ENST00000377095 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.81■■■□□ 2.2
SLC25A39-202ENST00000377095 NUP155O75694 1391 aa28.8■■■□□ 2.2
SLC25A39-202ENST00000377095 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.79■■■□□ 2.2
SLC25A39-202ENST00000377095 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.78■■■□□ 2.2
SLC25A39-202ENST00000377095 TET3O43151 1660 aa28.78■■■□□ 2.2
SLC25A39-202ENST00000377095 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.76■■■□□ 2.19
SLC25A39-202ENST00000377095 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.76■■■□□ 2.19
SLC25A39-202ENST00000377095 ERVK-7P63135 1459 aa28.75■■■□□ 2.19
SLC25A39-202ENST00000377095 TNRQ92752 1358 aa28.73■■■□□ 2.19
SLC25A39-202ENST00000377095 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.73■■■□□ 2.19
SLC25A39-202ENST00000377095 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.72■■■□□ 2.19
SLC25A39-202ENST00000377095 E9PCH4 1651 aa28.7■■■□□ 2.18
SLC25A39-202ENST00000377095 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
SLC25A39-202ENST00000377095 TRIM52Q96A61 297 aa28.67■■■□□ 2.18
SLC25A39-202ENST00000377095 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.67■■■□□ 2.18
SLC25A39-202ENST00000377095 NOS1P29475 1434 aa28.66■■■□□ 2.18
SLC25A39-202ENST00000377095 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
SLC25A39-202ENST00000377095 HSPA2P54652 639 aa28.64■■■□□ 2.18
SLC25A39-202ENST00000377095 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
SLC25A39-202ENST00000377095 NLRP1Q9C000 1473 aa28.63■■■□□ 2.17
SLC25A39-202ENST00000377095 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.62■■■□□ 2.17
SLC25A39-202ENST00000377095 SYNMO15061 1565 aa28.62■■■□□ 2.17
SLC25A39-202ENST00000377095 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SLC25A39-202ENST00000377095 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
SLC25A39-202ENST00000377095 HRCP23327 699 aa28.58■■■□□ 2.17
SLC25A39-202ENST00000377095 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
SLC25A39-202ENST00000377095 PKD2Q13563 968 aa28.54■■■□□ 2.16
SLC25A39-202ENST00000377095 IDI1Q13907 227 aa28.54■■■□□ 2.16
SLC25A39-202ENST00000377095 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.53■■■□□ 2.16
SLC25A39-202ENST00000377095 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.53■■■□□ 2.16
SLC25A39-202ENST00000377095 PTPRTO14522 1441 aa28.52■■■□□ 2.16
SLC25A39-202ENST00000377095 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.52■■■□□ 2.16
SLC25A39-202ENST00000377095 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.52■■■□□ 2.16
SLC25A39-202ENST00000377095 PIK3C2BO00750 1634 aa28.51■■■□□ 2.15
SLC25A39-202ENST00000377095 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.51■■■□□ 2.15
SLC25A39-202ENST00000377095 STRCQ7RTU9 1775 aa28.5■■■□□ 2.15
SLC25A39-202ENST00000377095 PLA2R1Q13018 1463 aa28.47■■■□□ 2.15
SLC25A39-202ENST00000377095 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SLC25A39-202ENST00000377095 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
SLC25A39-202ENST00000377095 FOXD1Q16676 465 aa28.45■■■□□ 2.14
SLC25A39-202ENST00000377095 TRPM2O94759 1503 aa28.43■■■□□ 2.14
SLC25A39-202ENST00000377095 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.41■■■□□ 2.14
SLC25A39-202ENST00000377095 ADGRB3O60242 1522 aa28.41■■■□□ 2.14
SLC25A39-202ENST00000377095 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.39■■■□□ 2.14
SLC25A39-202ENST00000377095 CLTCL1P53675 1640 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC25A39-202ENST00000377095 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC25A39-202ENST00000377095 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC25A39-202ENST00000377095 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC25A39-202ENST00000377095 SLIT1O75093 1534 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC25A39-202ENST00000377095 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SLC25A39-202ENST00000377095 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC25A39-202ENST00000377095 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.33■■■□□ 2.12
SLC25A39-202ENST00000377095 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.32■■■□□ 2.12
SLC25A39-202ENST00000377095 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SLC25A39-202ENST00000377095 LTKP29376 864 aa28.3■■■□□ 2.12
SLC25A39-202ENST00000377095 KIF1BO60333 1816 aa28.3■■■□□ 2.12
SLC25A39-202ENST00000377095 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.29■■■□□ 2.12
SLC25A39-202ENST00000377095 MED14O60244 1454 aa28.27■■■□□ 2.12
SLC25A39-202ENST00000377095 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.26■■■□□ 2.11
SLC25A39-202ENST00000377095 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
SLC25A39-202ENST00000377095 ZFYVE9O95405 1425 aa28.26■■■□□ 2.11
SLC25A39-202ENST00000377095 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.25■■■□□ 2.11
SLC25A39-202ENST00000377095 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.24■■■□□ 2.11
SLC25A39-202ENST00000377095 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.23■■■□□ 2.11
SLC25A39-202ENST00000377095 EID1Q9Y6B2 187 aa28.23■■■□□ 2.11
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