RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FLNCQ14315 2725 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBLP22087 321 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATRQ13535 2644 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSPNO60542 156 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NOVP48745 357 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP10-3P60369 221 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCRT2Q9NQ03 307 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE3AQ5TA76 89 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SERINC5Q86VE9 423 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT35Q92764 455 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NTN4Q9HB63 628 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TGP01266 2768 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP10-2P60368 255 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF292O60281 2723 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BAHCC1Q9P281 2608 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EGFRP00533 1210 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC4A5Q9BY07 1137 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POTEHQ6S545 545 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP10-11P60412 298 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POU4F1Q01851 419 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATG9BQ674R7 924 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT77Q7Z794 578 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGF2RP11717 2491 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAV3Q8IVL0 2385 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP10-8P60410 259 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LAMA5O15230 3695 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CACNA1EQ15878 2313 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARID1AO14497 2285 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HSPG2P98160 4391 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POTEB3A0JP26 581 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POTEB2H3BUK9 544 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POTEBQ6S5H4 581 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APCP25054 2843 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHD9Q3L8U1 2897 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AKAP13Q12802 2813 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTGS2P35354 604 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRIPAKQ8N1N5 446 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CACNA1HO95180 2353 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LPAP08519 4548 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITPR1Q14643 2758 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADAMTS4O75173 837 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAA40Q86UY6 237 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MPNDQ8N594 471 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSRNP2Q9H175 543 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM208BQ5VWN6 2430 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SHISA5Q8N114 240 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRR13Q9NZ81 148 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LYSTQ99698 3801 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SDK1Q7Z5N4 2213 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MED26O95402 600 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NF1P21359 2839 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM151BQ8IW70 566 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LAMA1P25391 3075 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNCP24821 2201 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MXRA5Q9NR99 2828 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STAG1Q8WVM7 1258 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP10-10P60014 251 aa-1.16□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP-1.16□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-1.16□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP-1.16□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa-1.17□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CEP295Q9C0D2 2601 aa-1.17□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITPR2Q14571 2701 aa-1.17□□□□□ -2.6
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