RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRL2O95490 1459 aa41.48■■■■■ 4.23
TPGS1-201ENST00000359315 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.48■■■■■ 4.23
TPGS1-201ENST00000359315 MROH2AA6NES4 1674 aa41.48■■■■■ 4.23
TPGS1-201ENST00000359315 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
TPGS1-201ENST00000359315 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
TPGS1-201ENST00000359315 ERBINQ96RT1 1412 aa41.44■■■■■ 4.22
TPGS1-201ENST00000359315 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.43■■■■■ 4.22
TPGS1-201ENST00000359315 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.43■■■■■ 4.22
TPGS1-201ENST00000359315 HSPA2P54652 639 aa41.4■■■■■ 4.22
TPGS1-201ENST00000359315 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
TPGS1-201ENST00000359315 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.38■■■■■ 4.22
TPGS1-201ENST00000359315 ITGAEP38570 1179 aa41.37■■■■■ 4.21
TPGS1-201ENST00000359315 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.37■■■■■ 4.21
TPGS1-201ENST00000359315 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.36■■■■■ 4.21
TPGS1-201ENST00000359315 NPATQ14207 1427 aa41.34■■■■■ 4.21
TPGS1-201ENST00000359315 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.33■■■■■ 4.21
TPGS1-201ENST00000359315 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.32■■■■■ 4.21
TPGS1-201ENST00000359315 ABCC3O15438 1527 aa41.32■■■■■ 4.2
TPGS1-201ENST00000359315 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
TPGS1-201ENST00000359315 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
TPGS1-201ENST00000359315 PZPP20742 1482 aa41.25■■■■■ 4.19
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.25■■■■■ 4.19
TPGS1-201ENST00000359315 ROCK1Q13464 1354 aa41.25■■■■■ 4.19
TPGS1-201ENST00000359315 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.19
TPGS1-201ENST00000359315 DEPDC5O75140 1603 aa41.22■■■■■ 4.19
TPGS1-201ENST00000359315 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
TPGS1-201ENST00000359315 CEP152O94986 1710 aa41.18■■■■■ 4.18
TPGS1-201ENST00000359315 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.15■■■■■ 4.18
TPGS1-201ENST00000359315 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
TPGS1-201ENST00000359315 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.12■■■■■ 4.17
TPGS1-201ENST00000359315 TNRQ92752 1358 aa41.12■■■■■ 4.17
TPGS1-201ENST00000359315 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.11■■■■■ 4.17
TPGS1-201ENST00000359315 KANK1Q14678 1352 aa41.08■■■■■ 4.17
TPGS1-201ENST00000359315 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
TPGS1-201ENST00000359315 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.04■■■■■ 4.16
TPGS1-201ENST00000359315 ERVK-7P63135 1459 aa41.04■■■■■ 4.16
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.02■■■■■ 4.16
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.01■■■■■ 4.16
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
TPGS1-201ENST00000359315 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.98■■■■■ 4.15
TPGS1-201ENST00000359315 UNC13BO14795 1591 aa40.98■■■■■ 4.15
TPGS1-201ENST00000359315 NAIPQ13075 1403 aa40.93■■■■■ 4.14
TPGS1-201ENST00000359315 STRCQ7RTU9 1775 aa40.93■■■■■ 4.14
TPGS1-201ENST00000359315 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.93■■■■■ 4.14
TPGS1-201ENST00000359315 NLRP1Q9C000 1473 aa40.9■■■■■ 4.14
TPGS1-201ENST00000359315 HFM1A2PYH4 1435 aa40.84■■■■■ 4.13
TPGS1-201ENST00000359315 PLA2R1Q13018 1463 aa40.83■■■■■ 4.13
TPGS1-201ENST00000359315 NUP155O75694 1391 aa40.82■■■■■ 4.12
TPGS1-201ENST00000359315 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.81■■■■■ 4.12
TPGS1-201ENST00000359315 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.81■■■■■ 4.12
TPGS1-201ENST00000359315 TET3O43151 1660 aa40.79■■■■■ 4.12
TPGS1-201ENST00000359315 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.79■■■■■ 4.12
TPGS1-201ENST00000359315 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.78■■■■■ 4.12
TPGS1-201ENST00000359315 NOS1P29475 1434 aa40.78■■■■■ 4.12
TPGS1-201ENST00000359315 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
TPGS1-201ENST00000359315 SYNMO15061 1565 aa40.76■■■■■ 4.12
TPGS1-201ENST00000359315 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
TPGS1-201ENST00000359315 PTPRTO14522 1441 aa40.72■■■■■ 4.11
TPGS1-201ENST00000359315 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.7■■■■■ 4.11
TPGS1-201ENST00000359315 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
TPGS1-201ENST00000359315 PKD2Q13563 968 aa40.67■■■■■ 4.1
TPGS1-201ENST00000359315 E9PCH4 1651 aa40.66■■■■■ 4.1
TPGS1-201ENST00000359315 IDI1Q13907 227 aa40.66■■■■■ 4.1
TPGS1-201ENST00000359315 PIK3C2BO00750 1634 aa40.64■■■■■ 4.1
TPGS1-201ENST00000359315 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.63■■■■■ 4.09
TPGS1-201ENST00000359315 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.62■■■■■ 4.09
TPGS1-201ENST00000359315 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.55■■■■■ 4.08
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM52Q96A61 297 aa40.55■■■■■ 4.08
TPGS1-201ENST00000359315 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.53■■■■■ 4.08
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.52■■■■■ 4.08
TPGS1-201ENST00000359315 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRB3O60242 1522 aa40.51■■■■■ 4.08
TPGS1-201ENST00000359315 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.5■■■■■ 4.07
TPGS1-201ENST00000359315 SLIT1O75093 1534 aa40.5■■■■■ 4.07
TPGS1-201ENST00000359315 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.47■■■■■ 4.07
TPGS1-201ENST00000359315 MED14O60244 1454 aa40.46■■■■■ 4.07
TPGS1-201ENST00000359315 LTKP29376 864 aa40.46■■■■■ 4.07
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
TPGS1-201ENST00000359315 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
TPGS1-201ENST00000359315 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.42■■■■■ 4.06
TPGS1-201ENST00000359315 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
TPGS1-201ENST00000359315 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.41■■■■■ 4.06
TPGS1-201ENST00000359315 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.41■■■■■ 4.06
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TPGS1-201ENST00000359315 CERKQ8TCT0 537 aa40.38■■■■■ 4.05
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.37■■■■■ 4.05
TPGS1-201ENST00000359315 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.35■■■■■ 4.05
TPGS1-201ENST00000359315 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
TPGS1-201ENST00000359315 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.34■■■■■ 4.05
TPGS1-201ENST00000359315 IQGAP1P46940 1657 aa40.34■■■■■ 4.05
TPGS1-201ENST00000359315 EID1Q9Y6B2 187 aa40.31■■■■■ 4.04
TPGS1-201ENST00000359315 FOXD1Q16676 465 aa40.3■■■■■ 4.04
TPGS1-201ENST00000359315 TRPM2O94759 1503 aa40.3■■■■■ 4.04
TPGS1-201ENST00000359315 ZFYVE9O95405 1425 aa40.29■■■■■ 4.04
TPGS1-201ENST00000359315 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
TPGS1-201ENST00000359315 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.26■■■■■ 4.04
TPGS1-201ENST00000359315 CLTCL1P53675 1640 aa40.26■■■■■ 4.04
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TPGS1-201ENST00000359315 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.25■■■■■ 4.03
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