RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
GIPC1-201ENST00000345425 DEPDC5O75140 1603 aa41.35■■■■■ 4.21
GIPC1-201ENST00000345425 UNC13BO14795 1591 aa41.34■■■■■ 4.21
GIPC1-201ENST00000345425 GGT6Q6P531 493 aa41.3■■■■■ 4.2
GIPC1-201ENST00000345425 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
GIPC1-201ENST00000345425 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.27■■■■■ 4.2
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM52Q96A61 297 aa41.25■■■■■ 4.19
GIPC1-201ENST00000345425 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.25■■■■■ 4.19
GIPC1-201ENST00000345425 KANK1Q14678 1352 aa41.25■■■■■ 4.19
GIPC1-201ENST00000345425 MLECQ14165 292 aa41.22■■■■■ 4.19
GIPC1-201ENST00000345425 NUP155O75694 1391 aa41.22■■■■■ 4.19
GIPC1-201ENST00000345425 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.22■■■■■ 4.19
GIPC1-201ENST00000345425 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.2■■■■■ 4.19
GIPC1-201ENST00000345425 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.18■■■■■ 4.18
GIPC1-201ENST00000345425 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.18■■■■■ 4.18
GIPC1-201ENST00000345425 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.17■■■■■ 4.18
GIPC1-201ENST00000345425 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
GIPC1-201ENST00000345425 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.13■■■■■ 4.17
GIPC1-201ENST00000345425 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
GIPC1-201ENST00000345425 ABCC3O15438 1527 aa41.09■■■■■ 4.17
GIPC1-201ENST00000345425 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.08■■■■■ 4.17
GIPC1-201ENST00000345425 CEP152O94986 1710 aa41.08■■■■■ 4.17
GIPC1-201ENST00000345425 PZPP20742 1482 aa41.07■■■■■ 4.17
GIPC1-201ENST00000345425 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
GIPC1-201ENST00000345425 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.04■■■■■ 4.16
GIPC1-201ENST00000345425 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.04■■■■■ 4.16
GIPC1-201ENST00000345425 TET3O43151 1660 aa41.03■■■■■ 4.16
GIPC1-201ENST00000345425 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.02■■■■■ 4.16
GIPC1-201ENST00000345425 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
GIPC1-201ENST00000345425 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.02■■■■■ 4.16
GIPC1-201ENST00000345425 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.98■■■■■ 4.15
GIPC1-201ENST00000345425 MADDQ8WXG6 1647 aa40.97■■■■■ 4.15
GIPC1-201ENST00000345425 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.96■■■■■ 4.15
GIPC1-201ENST00000345425 MROH2AA6NES4 1674 aa40.95■■■■■ 4.15
GIPC1-201ENST00000345425 PKD2Q13563 968 aa40.91■■■■■ 4.14
GIPC1-201ENST00000345425 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.9■■■■■ 4.14
GIPC1-201ENST00000345425 E9PCH4 1651 aa40.88■■■■■ 4.14
GIPC1-201ENST00000345425 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
GIPC1-201ENST00000345425 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
GIPC1-201ENST00000345425 ZMYM3Q14202 1370 aa40.87■■■■■ 4.13
GIPC1-201ENST00000345425 NPATQ14207 1427 aa40.85■■■■■ 4.13
GIPC1-201ENST00000345425 C3P01024 1663 aa40.77■■■■■ 4.12
GIPC1-201ENST00000345425 FOXD1Q16676 465 aa40.76■■■■■ 4.12
GIPC1-201ENST00000345425 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
GIPC1-201ENST00000345425 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.71■■■■■ 4.11
GIPC1-201ENST00000345425 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.71■■■■■ 4.11
GIPC1-201ENST00000345425 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.71■■■■■ 4.11
GIPC1-201ENST00000345425 PTPRMP28827 1452 aa40.7■■■■■ 4.11
GIPC1-201ENST00000345425 ERVK-7P63135 1459 aa40.69■■■■■ 4.1
GIPC1-201ENST00000345425 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
GIPC1-201ENST00000345425 PTPRTO14522 1441 aa40.68■■■■■ 4.1
GIPC1-201ENST00000345425 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
GIPC1-201ENST00000345425 NOS1P29475 1434 aa40.67■■■■■ 4.1
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.67■■■■■ 4.1
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.64■■■■■ 4.1
GIPC1-201ENST00000345425 TRPM2O94759 1503 aa40.63■■■■■ 4.1
GIPC1-201ENST00000345425 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.61■■■■■ 4.09
GIPC1-201ENST00000345425 PLA2R1Q13018 1463 aa40.61■■■■■ 4.09
GIPC1-201ENST00000345425 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.6■■■■■ 4.09
GIPC1-201ENST00000345425 SYNMO15061 1565 aa40.58■■■■■ 4.09
GIPC1-201ENST00000345425 TNRQ92752 1358 aa40.56■■■■■ 4.08
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.54■■■■■ 4.08
GIPC1-201ENST00000345425 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.51■■■■■ 4.08
GIPC1-201ENST00000345425 PIK3C2BO00750 1634 aa40.49■■■■■ 4.07
GIPC1-201ENST00000345425 CLTCL1P53675 1640 aa40.48■■■■■ 4.07
GIPC1-201ENST00000345425 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.47■■■■■ 4.07
GIPC1-201ENST00000345425 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
GIPC1-201ENST00000345425 NLRP1Q9C000 1473 aa40.44■■■■■ 4.06
GIPC1-201ENST00000345425 IDI1Q13907 227 aa40.41■■■■■ 4.06
GIPC1-201ENST00000345425 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.4■■■■■ 4.06
GIPC1-201ENST00000345425 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.38■■■■■ 4.06
GIPC1-201ENST00000345425 KIF1BO60333 1816 aa40.37■■■■■ 4.05
GIPC1-201ENST00000345425 NEUROD1Q13562 356 aa40.33■■■■■ 4.05
GIPC1-201ENST00000345425 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.3■■■■■ 4.04
GIPC1-201ENST00000345425 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.3■■■■■ 4.04
GIPC1-201ENST00000345425 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.3■■■■■ 4.04
GIPC1-201ENST00000345425 ADGRB3O60242 1522 aa40.3■■■■■ 4.04
GIPC1-201ENST00000345425 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
GIPC1-201ENST00000345425 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
GIPC1-201ENST00000345425 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.29■■■■■ 4.04
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
GIPC1-201ENST00000345425 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.27■■■■■ 4.04
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.25■■■■■ 4.03
GIPC1-201ENST00000345425 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.24■■■■■ 4.03
GIPC1-201ENST00000345425 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.2■■■■■ 4.03
GIPC1-201ENST00000345425 RGL3Q3MIN7 710 aa40.18■■■■■ 4.02
GIPC1-201ENST00000345425 TONSLQ96HA7 1378 aa40.17■■■■■ 4.02
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
GIPC1-201ENST00000345425 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
GIPC1-201ENST00000345425 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.12■■■■■ 4.01
GIPC1-201ENST00000345425 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.1■■■■■ 4.01
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.06■■■■■ 4
GIPC1-201ENST00000345425 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.05■■■■■ 4
GIPC1-201ENST00000345425 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.04■■■■■ 4
GIPC1-201ENST00000345425 SLIT1O75093 1534 aa40.03■■■■■ 4
GIPC1-201ENST00000345425 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.03■■■■■ 4
GIPC1-201ENST00000345425 PPLO60437 1756 aa40.02■■■■■ 4
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