RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 DEPDC5O75140 1603 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTB-201ENST00000331789 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ACTB-201ENST00000331789 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ACTB-201ENST00000331789 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-201ENST00000331789 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-201ENST00000331789 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTB-201ENST00000331789 KIF3BO15066 747 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTB-201ENST00000331789 KDM5CP41229 1560 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTB-201ENST00000331789 NEO1Q92859 1461 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTB-201ENST00000331789 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ACTB-201ENST00000331789 E9PCH4 1651 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTB-201ENST00000331789 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 GLI2P10070 1586 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 ATP10AO60312 1499 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 KANK1Q14678 1352 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 A2MP01023 1474 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 RAPGEF3O95398 923 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 TET3O43151 1660 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 RGL3Q3MIN7 710 aa25.14■■□□□ 1.62
ACTB-201ENST00000331789 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ACTB-201ENST00000331789 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ACTB-201ENST00000331789 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTB-201ENST00000331789 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ACTB-201ENST00000331789 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTB-201ENST00000331789 DIP2BQ9P265 1576 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTB-201ENST00000331789 ABCA6Q8N139 1617 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTB-201ENST00000331789 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTB-201ENST00000331789 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTB-201ENST00000331789 RICTORQ6R327 1708 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTB-201ENST00000331789 USP47Q96K76 1375 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-201ENST00000331789 PTPRTO14522 1441 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-201ENST00000331789 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ACTB-201ENST00000331789 TRPM2O94759 1503 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-201ENST00000331789 TSPOAP1O95153 1857 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-201ENST00000331789 CCDC7Q96M83 1385 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTB-201ENST00000331789 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTB-201ENST00000331789 CEP152O94986 1710 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTB-201ENST00000331789 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTB-201ENST00000331789 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ACTB-201ENST00000331789 CLTCL1P53675 1640 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTB-201ENST00000331789 ANP32CO43423 234 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-201ENST00000331789 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-201ENST00000331789 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTB-201ENST00000331789 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTB-201ENST00000331789 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ACTB-201ENST00000331789 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-201ENST00000331789 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-201ENST00000331789 GGT6Q6P531 493 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-201ENST00000331789 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-201ENST00000331789 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ACTB-201ENST00000331789 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-201ENST00000331789 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-201ENST00000331789 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-201ENST00000331789 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
ACTB-201ENST00000331789 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-201ENST00000331789 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-201ENST00000331789 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTB-201ENST00000331789 CCER2I3L3R5 266 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTB-201ENST00000331789 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
ACTB-201ENST00000331789 ABCC3O15438 1527 aa24.89■■□□□ 1.57
ACTB-201ENST00000331789 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTB-201ENST00000331789 KIF1BO60333 1816 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTB-201ENST00000331789 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTB-201ENST00000331789 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTB-201ENST00000331789 LAMC1P11047 1609 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTB-201ENST00000331789 MADDQ8WXG6 1647 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTB-201ENST00000331789 NPATQ14207 1427 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTB-201ENST00000331789 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTB-201ENST00000331789 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTB-201ENST00000331789 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTB-201ENST00000331789 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ACTB-201ENST00000331789 MROH2AA6NES4 1674 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTB-201ENST00000331789 STAC3Q96MF2 364 aa24.8■■□□□ 1.56
ACTB-201ENST00000331789 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-201ENST00000331789 IFT172Q9UG01 1749 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTB-201ENST00000331789 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ACTB-201ENST00000331789 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ACTB-201ENST00000331789 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ACTB-201ENST00000331789 ADGRB3O60242 1522 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-201ENST00000331789 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ACTB-201ENST00000331789 NOS1P29475 1434 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-201ENST00000331789 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-201ENST00000331789 MYOM2P54296 1465 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-201ENST00000331789 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-201ENST00000331789 TESK2Q96S53 571 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-201ENST00000331789 IQGAP1P46940 1657 aa24.7■■□□□ 1.55
ACTB-201ENST00000331789 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-201ENST00000331789 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-201ENST00000331789 SYNMO15061 1565 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-201ENST00000331789 REREQ9P2R6 1566 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-201ENST00000331789 PIK3C2BO00750 1634 aa24.67■■□□□ 1.54
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