RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.78■■□□□ 1.88
SYNE4-201ENST00000324444 NAIPQ13075 1403 aa26.78■■□□□ 1.88
SYNE4-201ENST00000324444 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.78■■□□□ 1.88
SYNE4-201ENST00000324444 A2MP01023 1474 aa26.77■■□□□ 1.88
SYNE4-201ENST00000324444 KIF15Q9NS87 1388 aa26.72■■□□□ 1.87
SYNE4-201ENST00000324444 C3P01024 1663 aa26.72■■□□□ 1.87
SYNE4-201ENST00000324444 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.72■■□□□ 1.87
SYNE4-201ENST00000324444 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.71■■□□□ 1.87
SYNE4-201ENST00000324444 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.71■■□□□ 1.87
SYNE4-201ENST00000324444 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.7■■□□□ 1.86
SYNE4-201ENST00000324444 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.69■■□□□ 1.86
SYNE4-201ENST00000324444 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SYNE4-201ENST00000324444 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SYNE4-201ENST00000324444 GGT6Q6P531 493 aa26.66■■□□□ 1.86
SYNE4-201ENST00000324444 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.66■■□□□ 1.86
SYNE4-201ENST00000324444 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SYNE4-201ENST00000324444 ERBINQ96RT1 1412 aa26.64■■□□□ 1.86
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.63■■□□□ 1.85
SYNE4-201ENST00000324444 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SYNE4-201ENST00000324444 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SYNE4-201ENST00000324444 ZMYM3Q14202 1370 aa26.62■■□□□ 1.85
SYNE4-201ENST00000324444 MROH2AA6NES4 1674 aa26.62■■□□□ 1.85
SYNE4-201ENST00000324444 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SYNE4-201ENST00000324444 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SYNE4-201ENST00000324444 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.58■■□□□ 1.85
SYNE4-201ENST00000324444 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.57■■□□□ 1.84
SYNE4-201ENST00000324444 KIF3BO15066 747 aa26.56■■□□□ 1.84
SYNE4-201ENST00000324444 NPATQ14207 1427 aa26.55■■□□□ 1.84
SYNE4-201ENST00000324444 UNC13BO14795 1591 aa26.54■■□□□ 1.84
SYNE4-201ENST00000324444 DEPDC5O75140 1603 aa26.54■■□□□ 1.84
SYNE4-201ENST00000324444 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SYNE4-201ENST00000324444 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SYNE4-201ENST00000324444 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.49■■□□□ 1.83
SYNE4-201ENST00000324444 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.49■■□□□ 1.83
SYNE4-201ENST00000324444 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.48■■□□□ 1.83
SYNE4-201ENST00000324444 STRCQ7RTU9 1775 aa26.47■■□□□ 1.83
SYNE4-201ENST00000324444 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM52Q96A61 297 aa26.44■■□□□ 1.82
SYNE4-201ENST00000324444 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.44■■□□□ 1.82
SYNE4-201ENST00000324444 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.43■■□□□ 1.82
SYNE4-201ENST00000324444 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.42■■□□□ 1.82
SYNE4-201ENST00000324444 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.42■■□□□ 1.82
SYNE4-201ENST00000324444 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.41■■□□□ 1.82
SYNE4-201ENST00000324444 FBXO41Q8TF61 875 aa26.41■■□□□ 1.82
SYNE4-201ENST00000324444 PZPP20742 1482 aa26.39■■□□□ 1.82
SYNE4-201ENST00000324444 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.37■■□□□ 1.81
SYNE4-201ENST00000324444 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SYNE4-201ENST00000324444 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SYNE4-201ENST00000324444 PTPRTO14522 1441 aa26.34■■□□□ 1.81
SYNE4-201ENST00000324444 NUP155O75694 1391 aa26.34■■□□□ 1.81
SYNE4-201ENST00000324444 CERKQ8TCT0 537 aa26.33■■□□□ 1.8
SYNE4-201ENST00000324444 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SYNE4-201ENST00000324444 TNRQ92752 1358 aa26.32■■□□□ 1.8
SYNE4-201ENST00000324444 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.32■■□□□ 1.8
SYNE4-201ENST00000324444 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.31■■□□□ 1.8
SYNE4-201ENST00000324444 CEP152O94986 1710 aa26.3■■□□□ 1.8
SYNE4-201ENST00000324444 TET3O43151 1660 aa26.3■■□□□ 1.8
SYNE4-201ENST00000324444 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.3■■□□□ 1.8
SYNE4-201ENST00000324444 ABCC3O15438 1527 aa26.3■■□□□ 1.8
SYNE4-201ENST00000324444 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.29■■□□□ 1.8
SYNE4-201ENST00000324444 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SYNE4-201ENST00000324444 PLA2R1Q13018 1463 aa26.27■■□□□ 1.8
SYNE4-201ENST00000324444 KANK1Q14678 1352 aa26.26■■□□□ 1.79
SYNE4-201ENST00000324444 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.24■■□□□ 1.79
SYNE4-201ENST00000324444 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
SYNE4-201ENST00000324444 PKD2Q13563 968 aa26.23■■□□□ 1.79
SYNE4-201ENST00000324444 E9PCH4 1651 aa26.22■■□□□ 1.79
SYNE4-201ENST00000324444 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.2■■□□□ 1.79
SYNE4-201ENST00000324444 NLRP1Q9C000 1473 aa26.19■■□□□ 1.78
SYNE4-201ENST00000324444 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.18■■□□□ 1.78
SYNE4-201ENST00000324444 ERVK-7P63135 1459 aa26.17■■□□□ 1.78
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.15■■□□□ 1.78
SYNE4-201ENST00000324444 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.15■■□□□ 1.78
SYNE4-201ENST00000324444 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SYNE4-201ENST00000324444 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.14■■□□□ 1.77
SYNE4-201ENST00000324444 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SYNE4-201ENST00000324444 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SYNE4-201ENST00000324444 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.11■■□□□ 1.77
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.1■■□□□ 1.77
SYNE4-201ENST00000324444 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SYNE4-201ENST00000324444 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.08■■□□□ 1.77
SYNE4-201ENST00000324444 FOXD1Q16676 465 aa26.07■■□□□ 1.76
SYNE4-201ENST00000324444 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.07■■□□□ 1.76
SYNE4-201ENST00000324444 TRPM2O94759 1503 aa26.06■■□□□ 1.76
SYNE4-201ENST00000324444 NEUROD1Q13562 356 aa26.03■■□□□ 1.76
SYNE4-201ENST00000324444 NOS1P29475 1434 aa26.03■■□□□ 1.76
SYNE4-201ENST00000324444 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.01■■□□□ 1.75
SYNE4-201ENST00000324444 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26■■□□□ 1.75
SYNE4-201ENST00000324444 TONSLQ96HA7 1378 aa26■■□□□ 1.75
SYNE4-201ENST00000324444 SYNMO15061 1565 aa26■■□□□ 1.75
SYNE4-201ENST00000324444 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.99■■□□□ 1.75
SYNE4-201ENST00000324444 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SYNE4-201ENST00000324444 PIK3C2BO00750 1634 aa25.97■■□□□ 1.75
SYNE4-201ENST00000324444 CLTCL1P53675 1640 aa25.97■■□□□ 1.75
SYNE4-201ENST00000324444 MED14O60244 1454 aa25.97■■□□□ 1.75
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.92■■□□□ 1.74
SYNE4-201ENST00000324444 IQGAP1P46940 1657 aa25.92■■□□□ 1.74
SYNE4-201ENST00000324444 IDI1Q13907 227 aa25.91■■□□□ 1.74
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