RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.02■■□□□ 1.43
SSR4-201ENST00000320857 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24■■□□□ 1.43
SSR4-201ENST00000320857 NEO1Q92859 1461 aa24■■□□□ 1.43
SSR4-201ENST00000320857 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SSR4-201ENST00000320857 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
SSR4-201ENST00000320857 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.96■■□□□ 1.43
SSR4-201ENST00000320857 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
SSR4-201ENST00000320857 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.95■■□□□ 1.43
SSR4-201ENST00000320857 KDM5CP41229 1560 aa23.95■■□□□ 1.42
SSR4-201ENST00000320857 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.94■■□□□ 1.42
SSR4-201ENST00000320857 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
SSR4-201ENST00000320857 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SSR4-201ENST00000320857 DEPDC5O75140 1603 aa23.92■■□□□ 1.42
SSR4-201ENST00000320857 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SSR4-201ENST00000320857 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SSR4-201ENST00000320857 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.9■■□□□ 1.42
SSR4-201ENST00000320857 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.89■■□□□ 1.42
SSR4-201ENST00000320857 RAPGEF3O95398 923 aa23.89■■□□□ 1.41
SSR4-201ENST00000320857 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SSR4-201ENST00000320857 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.88■■□□□ 1.41
SSR4-201ENST00000320857 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.87■■□□□ 1.41
SSR4-201ENST00000320857 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.86■■□□□ 1.41
SSR4-201ENST00000320857 ATP10AO60312 1499 aa23.85■■□□□ 1.41
SSR4-201ENST00000320857 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.83■■□□□ 1.41
SSR4-201ENST00000320857 PLA2R1Q13018 1463 aa23.83■■□□□ 1.41
SSR4-201ENST00000320857 A2MP01023 1474 aa23.83■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 KANK1Q14678 1352 aa23.81■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.8■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 KIF3BO15066 747 aa23.8■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 ANP32CO43423 234 aa23.8■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.79■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 RICTORQ6R327 1708 aa23.79■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.79■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.79■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 TET3O43151 1660 aa23.79■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 E9PCH4 1651 aa23.78■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 ABCA6Q8N139 1617 aa23.77■■□□□ 1.4
SSR4-201ENST00000320857 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.76■■□□□ 1.39
SSR4-201ENST00000320857 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SSR4-201ENST00000320857 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.76■■□□□ 1.39
SSR4-201ENST00000320857 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.75■■□□□ 1.39
SSR4-201ENST00000320857 CCDC7Q96M83 1385 aa23.74■■□□□ 1.39
SSR4-201ENST00000320857 CCER2I3L3R5 266 aa23.73■■□□□ 1.39
SSR4-201ENST00000320857 USP47Q96K76 1375 aa23.73■■□□□ 1.39
SSR4-201ENST00000320857 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.73■■□□□ 1.39
SSR4-201ENST00000320857 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SSR4-201ENST00000320857 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.71■■□□□ 1.39
SSR4-201ENST00000320857 PTPRTO14522 1441 aa23.71■■□□□ 1.39
SSR4-201ENST00000320857 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.7■■□□□ 1.38
SSR4-201ENST00000320857 TRPM2O94759 1503 aa23.69■■□□□ 1.38
SSR4-201ENST00000320857 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.69■■□□□ 1.38
SSR4-201ENST00000320857 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.67■■□□□ 1.38
SSR4-201ENST00000320857 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.67■■□□□ 1.38
SSR4-201ENST00000320857 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.67■■□□□ 1.38
SSR4-201ENST00000320857 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.67■■□□□ 1.38
SSR4-201ENST00000320857 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SSR4-201ENST00000320857 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SSR4-201ENST00000320857 RGL3Q3MIN7 710 aa23.66■■□□□ 1.38
SSR4-201ENST00000320857 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.66■■□□□ 1.38
SSR4-201ENST00000320857 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.64■■□□□ 1.38
SSR4-201ENST00000320857 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.64■■□□□ 1.37
SSR4-201ENST00000320857 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SSR4-201ENST00000320857 CEP152O94986 1710 aa23.62■■□□□ 1.37
SSR4-201ENST00000320857 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SSR4-201ENST00000320857 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.6■■□□□ 1.37
SSR4-201ENST00000320857 CLTCL1P53675 1640 aa23.59■■□□□ 1.37
SSR4-201ENST00000320857 GGT6Q6P531 493 aa23.57■■□□□ 1.36
SSR4-201ENST00000320857 STAC3Q96MF2 364 aa23.57■■□□□ 1.36
SSR4-201ENST00000320857 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.57■■□□□ 1.36
SSR4-201ENST00000320857 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.56■■□□□ 1.36
SSR4-201ENST00000320857 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.56■■□□□ 1.36
SSR4-201ENST00000320857 ABCC3O15438 1527 aa23.55■■□□□ 1.36
SSR4-201ENST00000320857 LAMC1P11047 1609 aa23.54■■□□□ 1.36
SSR4-201ENST00000320857 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.54■■□□□ 1.36
SSR4-201ENST00000320857 REREQ9P2R6 1566 aa23.52■■□□□ 1.36
SSR4-201ENST00000320857 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.52■■□□□ 1.36
SSR4-201ENST00000320857 NPATQ14207 1427 aa23.51■■□□□ 1.35
SSR4-201ENST00000320857 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SSR4-201ENST00000320857 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.51■■□□□ 1.35
SSR4-201ENST00000320857 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.5■■□□□ 1.35
SSR4-201ENST00000320857 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.48■■□□□ 1.35
SSR4-201ENST00000320857 KIF1BO60333 1816 aa23.47■■□□□ 1.35
SSR4-201ENST00000320857 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.46■■□□□ 1.35
SSR4-201ENST00000320857 AGLP35573 1532 aa23.46■■□□□ 1.35
SSR4-201ENST00000320857 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.46■■□□□ 1.35
SSR4-201ENST00000320857 MLECQ14165 292 aa23.45■■□□□ 1.34
SSR4-201ENST00000320857 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.45■■□□□ 1.34
SSR4-201ENST00000320857 MADDQ8WXG6 1647 aa23.45■■□□□ 1.34
SSR4-201ENST00000320857 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.44■■□□□ 1.34
SSR4-201ENST00000320857 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SSR4-201ENST00000320857 NOS1P29475 1434 aa23.42■■□□□ 1.34
SSR4-201ENST00000320857 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SSR4-201ENST00000320857 ADGRB3O60242 1522 aa23.39■■□□□ 1.33
SSR4-201ENST00000320857 MROH2AA6NES4 1674 aa23.39■■□□□ 1.33
SSR4-201ENST00000320857 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.38■■□□□ 1.33
SSR4-201ENST00000320857 MYOM2P54296 1465 aa23.37■■□□□ 1.33
SSR4-201ENST00000320857 IFT172Q9UG01 1749 aa23.37■■□□□ 1.33
SSR4-201ENST00000320857 PIK3C2BO00750 1634 aa23.35■■□□□ 1.33
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