RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295767.9

CHCHD4-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHCHD4, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-201ENST00000295767 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.49■■■■■ 4.23
CHCHD4-201ENST00000295767 UNC13BO14795 1591 aa41.48■■■■■ 4.23
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CHCHD4-201ENST00000295767 GGT6Q6P531 493 aa41.4■■■■■ 4.22
CHCHD4-201ENST00000295767 MLECQ14165 292 aa41.39■■■■■ 4.22
CHCHD4-201ENST00000295767 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.212e-7■■□□□ 13.3
CHCHD4-201ENST00000295767 CEP152O94986 1710 aa41.33■■■■■ 4.21
CHCHD4-201ENST00000295767 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.32■■■■■ 4.21
CHCHD4-201ENST00000295767 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.31■■■■■ 4.2
CHCHD4-201ENST00000295767 HRCP23327 699 aa41.3■■■■■ 4.2
CHCHD4-201ENST00000295767 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.3■■■■■ 4.2
CHCHD4-201ENST00000295767 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.29■■■■■ 4.2
CHCHD4-201ENST00000295767 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
CHCHD4-201ENST00000295767 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.28■■■■■ 4.2
CHCHD4-201ENST00000295767 NUP155O75694 1391 aa41.27■■■■■ 4.2
CHCHD4-201ENST00000295767 TRIM52Q96A61 297 aa41.27■■■■■ 4.2
CHCHD4-201ENST00000295767 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
CHCHD4-201ENST00000295767 KANK1Q14678 1352 aa41.26■■■■■ 4.2
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.25■■■■■ 4.19
CHCHD4-201ENST00000295767 ABCC3O15438 1527 aa41.24■■■■■ 4.19
CHCHD4-201ENST00000295767 MADDQ8WXG6 1647 aa41.23■■■■■ 4.19
CHCHD4-201ENST00000295767 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
CHCHD4-201ENST00000295767 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.22■■■■■ 4.19
CHCHD4-201ENST00000295767 PZPP20742 1482 aa41.2■■■■■ 4.19
CHCHD4-201ENST00000295767 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.19■■■■■ 4.18
CHCHD4-201ENST00000295767 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.18■■■■■ 4.18
CHCHD4-201ENST00000295767 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.18■■■■■ 4.18
CHCHD4-201ENST00000295767 TET3O43151 1660 aa41.17■■■■■ 4.18
CHCHD4-201ENST00000295767 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
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CHCHD4-201ENST00000295767 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.11■■■■■ 4.17
CHCHD4-201ENST00000295767 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.1■■■■■ 4.17
CHCHD4-201ENST00000295767 E9PCH4 1651 aa41.08■■■■■ 4.17
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CHCHD4-201ENST00000295767 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.04■■■■■ 4.16
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CHCHD4-201ENST00000295767 ZMYM3Q14202 1370 aa40.99■■■■■ 4.15
CHCHD4-201ENST00000295767 NPATQ14207 1427 aa40.98■■■■■ 4.15
CHCHD4-201ENST00000295767 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.98■■■■■ 4.15
CHCHD4-201ENST00000295767 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.97■■■■■ 4.15
CHCHD4-201ENST00000295767 PKD2Q13563 968 aa40.96■■■■■ 4.15
CHCHD4-201ENST00000295767 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
CHCHD4-201ENST00000295767 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
CHCHD4-201ENST00000295767 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.92■■■■■ 4.14
CHCHD4-201ENST00000295767 PTPRMP28827 1452 aa40.9■■■■■ 4.14
CHCHD4-201ENST00000295767 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.88■■■■■ 4.13
CHCHD4-201ENST00000295767 FOXD1Q16676 465 aa40.88■■■■■ 4.13
CHCHD4-201ENST00000295767 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
CHCHD4-201ENST00000295767 ERVK-7P63135 1459 aa40.83■■■■■ 4.13
CHCHD4-201ENST00000295767 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
CHCHD4-201ENST00000295767 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.82■■■■■ 4.13
CHCHD4-201ENST00000295767 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.82■■■■■ 4.12
CHCHD4-201ENST00000295767 NOS1P29475 1434 aa40.79■■■■■ 4.12
CHCHD4-201ENST00000295767 SYNMO15061 1565 aa40.77■■■■■ 4.12
CHCHD4-201ENST00000295767 PTPRTO14522 1441 aa40.76■■■■■ 4.12
CHCHD4-201ENST00000295767 PLA2R1Q13018 1463 aa40.75■■■■■ 4.11
CHCHD4-201ENST00000295767 TRPM2O94759 1503 aa40.74■■■■■ 4.11
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CHCHD4-201ENST00000295767 TNRQ92752 1358 aa40.67■■■■■ 4.1
CHCHD4-201ENST00000295767 PIK3C2BO00750 1634 aa40.66■■■■■ 4.1
CHCHD4-201ENST00000295767 CLTCL1P53675 1640 aa40.66■■■■■ 4.1
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CHCHD4-201ENST00000295767 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.57■■■■■ 4.09
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CHCHD4-201ENST00000295767 NLRP1Q9C000 1473 aa40.53■■■■■ 4.08
CHCHD4-201ENST00000295767 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.53■■■■■ 4.08
CHCHD4-201ENST00000295767 IDI1Q13907 227 aa40.51■■■■■ 4.08
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.07
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CHCHD4-201ENST00000295767 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.35■■■■■ 4.05
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CHCHD4-201ENST00000295767 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.33■■■■■ 4.05
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CHCHD4-201ENST00000295767 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.19■■■■■ 4.02
CHCHD4-201ENST00000295767 SLIT1O75093 1534 aa40.17■■■■■ 4.02
CHCHD4-201ENST00000295767 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.16■■■■■ 4.02
CHCHD4-201ENST00000295767 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.16■■■■■ 4.02
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CHCHD4-201ENST00000295767 TONSLQ96HA7 1378 aa40.13■■■■■ 4.01
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