RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
USP12-201ENST00000282344 COG6Q9Y2V7 657 aa27.49■■□□□ 1.99
USP12-201ENST00000282344 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.48■■□□□ 1.99
USP12-201ENST00000282344 NCAPD3P42695 1498 aa27.48■■□□□ 1.99
USP12-201ENST00000282344 WDR97A6NE52 1622 aa27.47■■□□□ 1.99
USP12-201ENST00000282344 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.44■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 GBP4Q96PP9 640 aa27.43■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 CFTRP13569 1480 aa27.43■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.42■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 CUX1P39880 1505 aa27.42■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 A0A0G2JS52 829 aa27.41■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 E9PSI1 815 aa27.4■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 GSE1Q14687 1217 aa27.4■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 KCNJ4P48050 445 aa27.4■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.39■■□□□ 1.98
USP12-201ENST00000282344 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa27.39■■□□□ 1.97
USP12-201ENST00000282344 MSNP26038 577 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
USP12-201ENST00000282344 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
USP12-201ENST00000282344 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.36■■□□□ 1.97
USP12-201ENST00000282344 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.36■■□□□ 1.97
USP12-201ENST00000282344 AKNAQ7Z591 1439 aa27.35■■□□□ 1.97
USP12-201ENST00000282344 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.34■■□□□ 1.97
USP12-201ENST00000282344 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.34■■□□□ 1.97
USP12-201ENST00000282344 TOP2BQ02880 1626 aa27.34■■□□□ 1.97
USP12-201ENST00000282344 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
USP12-201ENST00000282344 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
USP12-201ENST00000282344 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
USP12-201ENST00000282344 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 HFM1A2PYH4 1435 aa27.32■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 PTPRGP23470 1445 aa27.32■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 TAOK2Q9UL54 1235 aa27.31■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.31■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.31■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 MCCP23508 829 aa27.31■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 FGD1P98174 961 aa27.3■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 TIAM1Q13009 1591 aa27.3■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 CFAP44Q96MT7 982 aa27.28■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
USP12-201ENST00000282344 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.26■■□□□ 1.95
USP12-201ENST00000282344 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.25■■□□□ 1.95
USP12-201ENST00000282344 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa27.24■■□□□ 1.95
USP12-201ENST00000282344 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
USP12-201ENST00000282344 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.21■■□□□ 1.95
USP12-201ENST00000282344 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
USP12-201ENST00000282344 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
USP12-201ENST00000282344 NFKBIBQ15653 356 aa27.19■■□□□ 1.94
USP12-201ENST00000282344 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.19■■□□□ 1.94
USP12-201ENST00000282344 PANK1Q8TE04 598 aa27.19■■□□□ 1.94
USP12-201ENST00000282344 MIA2Q96PC5 1412 aa27.19■■□□□ 1.94
USP12-201ENST00000282344 NAIPQ13075 1403 aa27.18■■□□□ 1.94
USP12-201ENST00000282344 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
USP12-201ENST00000282344 NUTM2FA1L443 756 aa27.15■■□□□ 1.94
USP12-201ENST00000282344 PTMSP20962 102 aa27.15■■□□□ 1.94
USP12-201ENST00000282344 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa27.15■■□□□ 1.94
USP12-201ENST00000282344 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.13■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 MSH5O43196 834 aa27.13■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 STK31Q9BXU1 1019 aa27.13■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 ARID3AQ99856 593 aa27.12■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 EVC2Q86UK5 1308 aa27.1■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 NGEFQ8N5V2 710 aa27.1■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 HMMRO75330 724 aa27.1■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 PRDM2Q13029 1718 aa27.09■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 PPP2R1AP30153 589 aa27.08■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 RUNDC1Q96C34 613 aa27.08■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.08■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 NESP48681 1621 aa27.08■■□□□ 1.93
USP12-201ENST00000282344 BACH2Q9BYV9 841 aa27.08■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.923e-7■■■■□ 21.4
USP12-201ENST00000282344 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.07■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.07■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.06■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.06■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 RIPK4P57078 832 aa27.04■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 DRC7Q8IY82 874 aa27.04■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.04■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 LNPKQ9C0E8 428 aa27.02■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 ST18O60284 1047 aa27.02■■□□□ 1.92
USP12-201ENST00000282344 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.01■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.01■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 KIAA2012Q0VF49 1180 aa27.01■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 BCAR3O75815 825 aa27■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 AFAP1Q8N556 730 aa27■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 MTHFSP49914 203 aa26.99■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms