RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281456.10

SLC25A4-201, Transcript of solute carrier family 25 member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A4, Length 4,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A4-201ENST00000281456 CD109Q6YHK3 1445 aa20.72■□□□□ 0.91
SLC25A4-201ENST00000281456 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.72■□□□□ 0.91
SLC25A4-201ENST00000281456 PANK3Q9H999 370 aa20.69■□□□□ 0.9
SLC25A4-201ENST00000281456 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SLC25A4-201ENST00000281456 RALBP1Q15311 655 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC25A4-201ENST00000281456 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC25A4-201ENST00000281456 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.67■□□□□ 0.9
SLC25A4-201ENST00000281456 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
SLC25A4-201ENST00000281456 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.67■□□□□ 0.9
SLC25A4-201ENST00000281456 SOX12O15370 315 aa20.67■□□□□ 0.9
SLC25A4-201ENST00000281456 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SLC25A4-201ENST00000281456 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SLC25A4-201ENST00000281456 NUDCQ9Y266 331 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC25A4-201ENST00000281456 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC25A4-201ENST00000281456 EID1Q9Y6B2 187 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC25A4-201ENST00000281456 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 CEP170Q5SW79 1584 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 ADGRL1O94910 1474 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 CCDC7Q96M83 1385 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 WDR97A6NE52 1622 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 SAMD9Q5K651 1589 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 NUTM2FA1L443 756 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 STAC3Q96MF2 364 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 NLRP13Q86W25 1043 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 FANCAO15360 1455 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC25A4-201ENST00000281456 ASXL2Q76L83 1435 aa20.58■□□□□ 0.88
SLC25A4-201ENST00000281456 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SLC25A4-201ENST00000281456 PLCH2O75038 1416 aa20.56■□□□□ 0.88
SLC25A4-201ENST00000281456 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC25A4-201ENST00000281456 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SLC25A4-201ENST00000281456 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SLC25A4-201ENST00000281456 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 EVC2Q86UK5 1308 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 ABCC2Q92887 1545 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 MAPKBP1O60336 1514 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC25A4-201ENST00000281456 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC25A4-201ENST00000281456 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC25A4-201ENST00000281456 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SLC25A4-201ENST00000281456 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SLC25A4-201ENST00000281456 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SLC25A4-201ENST00000281456 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC25A4-201ENST00000281456 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SLC25A4-201ENST00000281456 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SLC25A4-201ENST00000281456 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
SLC25A4-201ENST00000281456 ERBINQ96RT1 1412 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC25A4-201ENST00000281456 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SLC25A4-201ENST00000281456 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A4-201ENST00000281456 CABP2Q9NPB3 220 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A4-201ENST00000281456 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SLC25A4-201ENST00000281456 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A4-201ENST00000281456 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SLC25A4-201ENST00000281456 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A4-201ENST00000281456 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SLC25A4-201ENST00000281456 A0A0G2JS52 829 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A4-201ENST00000281456 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A4-201ENST00000281456 IDI1Q13907 227 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC25A4-201ENST00000281456 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SLC25A4-201ENST00000281456 PRAM1Q96QH2 718 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A4-201ENST00000281456 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC25A4-201ENST00000281456 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 GOLGA2Q08379 1002 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 ABCA8O94911 1581 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 CCDC184Q52MB2 194 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SLC25A4-201ENST00000281456 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.26■□□□□ 0.83
SLC25A4-201ENST00000281456 CHD1O14646 1710 aa20.26■□□□□ 0.83
SLC25A4-201ENST00000281456 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.26■□□□□ 0.83
SLC25A4-201ENST00000281456 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.26■□□□□ 0.83
SLC25A4-201ENST00000281456 APAF1O14727 1248 aa20.26■□□□□ 0.83
SLC25A4-201ENST00000281456 COG3Q96JB2 828 aa20.26■□□□□ 0.83
SLC25A4-201ENST00000281456 A2MP01023 1474 aa20.25■□□□□ 0.83
SLC25A4-201ENST00000281456 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SLC25A4-201ENST00000281456 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.25■□□□□ 0.83
SLC25A4-201ENST00000281456 AMPHP49418 695 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms