RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.11■■■□□ 2.41
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AGLP35573 1532 aa30.11■■■□□ 2.41
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM52Q96A61 297 aa30.06■■■□□ 2.4
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUP155O75694 1391 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DEPDC5O75140 1603 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UNC13BO14795 1591 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KANK1Q14678 1352 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PZPP20742 1482 aa29.89■■■□□ 2.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.89■■■□□ 2.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCC3O15438 1527 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.86■■■□□ 2.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.86■■■□□ 2.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.85■■■□□ 2.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEP152O94986 1710 aa29.85■■■□□ 2.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FOXD1Q16676 465 aa29.82■■■□□ 2.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MADDQ8WXG6 1647 aa29.81■■■□□ 2.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.81■■■□□ 2.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PKD2Q13563 968 aa29.81■■■□□ 2.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.79■■■□□ 2.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.79■■■□□ 2.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZMYM3Q14202 1370 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TET3O43151 1660 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.73■■■□□ 2.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPATQ14207 1427 aa29.73■■■□□ 2.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
SH3BGRL3-201ENST00000270792 E9PCH4 1651 aa29.69■■■□□ 2.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.67■■■□□ 2.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MROH2AA6NES4 1674 aa29.64■■■□□ 2.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPRMP28827 1452 aa29.64■■■□□ 2.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C3P01024 1663 aa29.63■■■□□ 2.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLA2R1Q13018 1463 aa29.6■■■□□ 2.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERVK-7P63135 1459 aa29.59■■■□□ 2.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.57■■■□□ 2.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOS1P29475 1434 aa29.56■■■□□ 2.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPRTO14522 1441 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.52■■■□□ 2.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYNMO15061 1565 aa29.52■■■□□ 2.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.52■■■□□ 2.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNRQ92752 1358 aa29.51■■■□□ 2.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.5■■■□□ 2.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.5■■■□□ 2.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRPM2O94759 1503 aa29.48■■■□□ 2.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IDI1Q13907 227 aa29.47■■■□□ 2.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.45■■■□□ 2.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NEUROD1Q13562 356 aa29.44■■■□□ 2.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.43■■■□□ 2.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLTCL1P53675 1640 aa29.43■■■□□ 2.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.41■■■□□ 2.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIK3C2BO00750 1634 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NLRP1Q9C000 1473 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RGL3Q3MIN7 710 aa29.32■■■□□ 2.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TONSLQ96HA7 1378 aa29.31■■■□□ 2.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.29■■■□□ 2.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.27■■■□□ 2.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.27■■■□□ 2.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.25■■■□□ 2.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADGRB3O60242 1522 aa29.25■■■□□ 2.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF1BO60333 1816 aa29.24■■■□□ 2.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.22■■■□□ 2.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.21■■■□□ 2.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.19■■■□□ 2.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HSPA2P54652 639 aa29.18■■■□□ 2.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.17■■■□□ 2.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.15■■■□□ 2.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.15■■■□□ 2.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms