RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.87■■□□□ 1.73
SRSF1-201ENST00000258962 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.87■■□□□ 1.73
SRSF1-201ENST00000258962 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.87■■□□□ 1.73
SRSF1-201ENST00000258962 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.84■■□□□ 1.73
SRSF1-201ENST00000258962 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.83■■□□□ 1.73
SRSF1-201ENST00000258962 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.82■■□□□ 1.72
SRSF1-201ENST00000258962 ROCK1Q13464 1354 aa25.81■■□□□ 1.72
SRSF1-201ENST00000258962 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.81■■□□□ 1.72
SRSF1-201ENST00000258962 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SRSF1-201ENST00000258962 KIF15Q9NS87 1388 aa25.8■■□□□ 1.72
SRSF1-201ENST00000258962 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.77■■□□□ 1.72
SRSF1-201ENST00000258962 ADGRL2O95490 1459 aa25.76■■□□□ 1.71
SRSF1-201ENST00000258962 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.74■■□□□ 1.71
SRSF1-201ENST00000258962 NCOA1Q15788 1441 aa25.74■■□□□ 1.71
SRSF1-201ENST00000258962 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.73■■□□□ 1.71
SRSF1-201ENST00000258962 ZMYM3Q14202 1370 aa25.72■■□□□ 1.71
SRSF1-201ENST00000258962 ERBINQ96RT1 1412 aa25.69■■□□□ 1.7
SRSF1-201ENST00000258962 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SRSF1-201ENST00000258962 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SRSF1-201ENST00000258962 MROH2AA6NES4 1674 aa25.65■■□□□ 1.7
SRSF1-201ENST00000258962 C3P01024 1663 aa25.65■■□□□ 1.7
SRSF1-201ENST00000258962 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.71e-15■■□□□ 13.7
SRSF1-201ENST00000258962 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SRSF1-201ENST00000258962 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.63■■□□□ 1.69
SRSF1-201ENST00000258962 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SRSF1-201ENST00000258962 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.62■■□□□ 1.69
SRSF1-201ENST00000258962 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.61■■□□□ 1.69
SRSF1-201ENST00000258962 KANK1Q14678 1352 aa25.59■■□□□ 1.69
SRSF1-201ENST00000258962 NPATQ14207 1427 aa25.59■■□□□ 1.69
SRSF1-201ENST00000258962 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.57■■□□□ 1.68
SRSF1-201ENST00000258962 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.57■■□□□ 1.68
SRSF1-201ENST00000258962 HSPA2P54652 639 aa25.54■■□□□ 1.68
SRSF1-201ENST00000258962 ABCC3O15438 1527 aa25.53■■□□□ 1.68
SRSF1-201ENST00000258962 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.53■■□□□ 1.68
SRSF1-201ENST00000258962 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SRSF1-201ENST00000258962 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.52■■□□□ 1.68
SRSF1-201ENST00000258962 PZPP20742 1482 aa25.51■■□□□ 1.67
SRSF1-201ENST00000258962 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SRSF1-201ENST00000258962 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SRSF1-201ENST00000258962 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SRSF1-201ENST00000258962 DEPDC5O75140 1603 aa25.49■■□□□ 1.67
SRSF1-201ENST00000258962 TRIM52Q96A61 297 aa25.47■■□□□ 1.67
SRSF1-201ENST00000258962 TNRQ92752 1358 aa25.47■■□□□ 1.67
SRSF1-201ENST00000258962 CEP152O94986 1710 aa25.45■■□□□ 1.66
SRSF1-201ENST00000258962 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.42■■□□□ 1.66
SRSF1-201ENST00000258962 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.42■■□□□ 1.66
SRSF1-201ENST00000258962 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.41■■□□□ 1.66
SRSF1-201ENST00000258962 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.41■■□□□ 1.66
SRSF1-201ENST00000258962 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.4■■□□□ 1.66
SRSF1-201ENST00000258962 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.39■■□□□ 1.66
SRSF1-201ENST00000258962 NUP155O75694 1391 aa25.38■■□□□ 1.65
SRSF1-201ENST00000258962 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SRSF1-201ENST00000258962 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.37■■□□□ 1.65
SRSF1-201ENST00000258962 UNC13BO14795 1591 aa25.37■■□□□ 1.65
SRSF1-201ENST00000258962 ERVK-7P63135 1459 aa25.37■■□□□ 1.65
SRSF1-201ENST00000258962 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.35■■□□□ 1.65
SRSF1-201ENST00000258962 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.34■■□□□ 1.65
SRSF1-201ENST00000258962 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SRSF1-201ENST00000258962 NLRP1Q9C000 1473 aa25.34■■□□□ 1.65
SRSF1-201ENST00000258962 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.32■■□□□ 1.64
SRSF1-201ENST00000258962 NEUROD1Q13562 356 aa25.32■■□□□ 1.64
SRSF1-201ENST00000258962 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.31■■□□□ 1.64
SRSF1-201ENST00000258962 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SRSF1-201ENST00000258962 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SRSF1-201ENST00000258962 TET3O43151 1660 aa25.28■■□□□ 1.64
SRSF1-201ENST00000258962 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SRSF1-201ENST00000258962 FOXD1Q16676 465 aa25.27■■□□□ 1.64
SRSF1-201ENST00000258962 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.27■■□□□ 1.64
SRSF1-201ENST00000258962 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.26■■□□□ 1.63
SRSF1-201ENST00000258962 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.26■■□□□ 1.63
SRSF1-201ENST00000258962 PKD2Q13563 968 aa25.25■■□□□ 1.63
SRSF1-201ENST00000258962 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.25■■□□□ 1.63
SRSF1-201ENST00000258962 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.25■■□□□ 1.63
SRSF1-201ENST00000258962 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.24■■□□□ 1.63
SRSF1-201ENST00000258962 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.23■■□□□ 1.63
SRSF1-201ENST00000258962 PLA2R1Q13018 1463 aa25.23■■□□□ 1.63
SRSF1-201ENST00000258962 NOS1P29475 1434 aa25.22■■□□□ 1.63
SRSF1-201ENST00000258962 IDI1Q13907 227 aa25.22■■□□□ 1.63
SRSF1-201ENST00000258962 STRCQ7RTU9 1775 aa25.22■■□□□ 1.63
SRSF1-201ENST00000258962 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.21■■□□□ 1.63
SRSF1-201ENST00000258962 TONSLQ96HA7 1378 aa25.18■■□□□ 1.62
SRSF1-201ENST00000258962 PTPRTO14522 1441 aa25.16■■□□□ 1.62
SRSF1-201ENST00000258962 E9PCH4 1651 aa25.16■■□□□ 1.62
SRSF1-201ENST00000258962 SYNMO15061 1565 aa25.15■■□□□ 1.62
SRSF1-201ENST00000258962 PIK3C2BO00750 1634 aa25.11■■□□□ 1.61
SRSF1-201ENST00000258962 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.11■■□□□ 1.61
SRSF1-201ENST00000258962 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SRSF1-201ENST00000258962 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SRSF1-201ENST00000258962 EID1Q9Y6B2 187 aa25.11■■□□□ 1.61
SRSF1-201ENST00000258962 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.09■■□□□ 1.61
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.06■■□□□ 1.6
SRSF1-201ENST00000258962 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SRSF1-201ENST00000258962 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SRSF1-201ENST00000258962 ADGRB3O60242 1522 aa25.04■■□□□ 1.6
SRSF1-201ENST00000258962 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SRSF1-201ENST00000258962 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.03■■□□□ 1.6
SRSF1-201ENST00000258962 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SRSF1-201ENST00000258962 LTKP29376 864 aa25.03■■□□□ 1.6
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