RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
SYF2-201ENST00000236273 ERBINQ96RT1 1412 aa34.09■■■■□ 3.05
SYF2-201ENST00000236273 C3P01024 1663 aa34.09■■■■□ 3.05
SYF2-201ENST00000236273 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
SYF2-201ENST00000236273 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
SYF2-201ENST00000236273 ZMYM3Q14202 1370 aa34.08■■■■□ 3.05
SYF2-201ENST00000236273 MROH2AA6NES4 1674 aa34.07■■■■□ 3.04
SYF2-201ENST00000236273 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.06■■■■□ 3.04
SYF2-201ENST00000236273 ITGAEP38570 1179 aa34.05■■■■□ 3.04
SYF2-201ENST00000236273 ROCK1Q13464 1354 aa34.05■■■■□ 3.04
SYF2-201ENST00000236273 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.99■■■■□ 3.03
SYF2-201ENST00000236273 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.98■■■■□ 3.03
SYF2-201ENST00000236273 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa33.98■■■■□ 3.03
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.97■■■■□ 3.03
SYF2-201ENST00000236273 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
SYF2-201ENST00000236273 DEPDC5O75140 1603 aa33.95■■■■□ 3.03
SYF2-201ENST00000236273 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.94■■■■□ 3.02
SYF2-201ENST00000236273 ABCC3O15438 1527 aa33.93■■■■□ 3.02
SYF2-201ENST00000236273 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
SYF2-201ENST00000236273 NPATQ14207 1427 aa33.9■■■■□ 3.02
SYF2-201ENST00000236273 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP33.87■■■■□ 3.015e-8■■■□□ 16
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
SYF2-201ENST00000236273 VWDEQ8N2E2 1590 aa33.86■■■■□ 3.01
SYF2-201ENST00000236273 CEP152O94986 1710 aa33.86■■■■□ 3.01
SYF2-201ENST00000236273 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
SYF2-201ENST00000236273 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.85■■■■□ 3.01
SYF2-201ENST00000236273 PZPP20742 1482 aa33.85■■■■□ 3.01
SYF2-201ENST00000236273 NAIPQ13075 1403 aa33.79■■■■□ 3
SYF2-201ENST00000236273 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.79■■■■□ 3
SYF2-201ENST00000236273 HSPA2P54652 639 aa33.79■■■■□ 3
SYF2-201ENST00000236273 LMTK2Q8IWU2 1503 aa33.78■■■■□ 3
SYF2-201ENST00000236273 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.78■■■■□ 3
SYF2-201ENST00000236273 KANK1Q14678 1352 aa33.76■■■■□ 3
SYF2-201ENST00000236273 UNC13BO14795 1591 aa33.75■■■□□ 2.99
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa33.75■■■□□ 2.99
SYF2-201ENST00000236273 HFM1A2PYH4 1435 aa33.72■■■□□ 2.99
SYF2-201ENST00000236273 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.7■■■□□ 2.99
SYF2-201ENST00000236273 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.98
SYF2-201ENST00000236273 TNRQ92752 1358 aa33.69■■■□□ 2.98
SYF2-201ENST00000236273 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.69■■■□□ 2.98
SYF2-201ENST00000236273 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.69■■■□□ 2.98
SYF2-201ENST00000236273 ERVK-7P63135 1459 aa33.68■■■□□ 2.98
SYF2-201ENST00000236273 EFCAB6Q5THR3 1501 aa33.64■■■□□ 2.98
SYF2-201ENST00000236273 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
SYF2-201ENST00000236273 NUP155O75694 1391 aa33.62■■■□□ 2.97
SYF2-201ENST00000236273 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33.62■■■□□ 2.97
SYF2-201ENST00000236273 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
SYF2-201ENST00000236273 TET3O43151 1660 aa33.6■■■□□ 2.97
SYF2-201ENST00000236273 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.6■■■□□ 2.97
SYF2-201ENST00000236273 NLRP1Q9C000 1473 aa33.56■■■□□ 2.96
SYF2-201ENST00000236273 NOS1P29475 1434 aa33.55■■■□□ 2.96
SYF2-201ENST00000236273 STRCQ7RTU9 1775 aa33.55■■■□□ 2.96
SYF2-201ENST00000236273 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
SYF2-201ENST00000236273 E9PCH4 1651 aa33.51■■■□□ 2.96
SYF2-201ENST00000236273 SYNMO15061 1565 aa33.5■■■□□ 2.95
SYF2-201ENST00000236273 UGGT1Q9NYU2 1555 aa33.45■■■□□ 2.95
SYF2-201ENST00000236273 IDI1Q13907 227 aa33.44■■■□□ 2.94
SYF2-201ENST00000236273 PLA2R1Q13018 1463 aa33.44■■■□□ 2.94
SYF2-201ENST00000236273 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.43■■■□□ 2.94
SYF2-201ENST00000236273 TRIM52Q96A61 297 aa33.41■■■□□ 2.94
SYF2-201ENST00000236273 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP33.4■■■□□ 2.94
SYF2-201ENST00000236273 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.4■■■□□ 2.94
SYF2-201ENST00000236273 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.39■■■□□ 2.94
SYF2-201ENST00000236273 PIK3C2BO00750 1634 aa33.39■■■□□ 2.94
SYF2-201ENST00000236273 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.37■■■□□ 2.93
SYF2-201ENST00000236273 PTPRTO14522 1441 aa33.34■■■□□ 2.93
SYF2-201ENST00000236273 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.34■■■□□ 2.93
SYF2-201ENST00000236273 PKD2Q13563 968 aa33.33■■■□□ 2.93
SYF2-201ENST00000236273 DMRT2Q9Y5R5 561 aa33.31■■■□□ 2.92
SYF2-201ENST00000236273 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
SYF2-201ENST00000236273 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP23Q9P227 1491 aa33.27■■■□□ 2.92
SYF2-201ENST00000236273 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.27■■■□□ 2.92
SYF2-201ENST00000236273 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.26■■■□□ 2.92
SYF2-201ENST00000236273 SLIT1O75093 1534 aa33.26■■■□□ 2.91
SYF2-201ENST00000236273 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.26■■■□□ 2.91
SYF2-201ENST00000236273 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.25■■■□□ 2.91
SYF2-201ENST00000236273 ADGRB3O60242 1522 aa33.24■■■□□ 2.91
SYF2-201ENST00000236273 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
SYF2-201ENST00000236273 LTKP29376 864 aa33.23■■■□□ 2.91
SYF2-201ENST00000236273 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.22■■■□□ 2.91
SYF2-201ENST00000236273 HRCP23327 699 aa33.22■■■□□ 2.91
SYF2-201ENST00000236273 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.22■■■□□ 2.91
SYF2-201ENST00000236273 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
SYF2-201ENST00000236273 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.21■■■□□ 2.91
SYF2-201ENST00000236273 MED14O60244 1454 aa33.21■■■□□ 2.91
SYF2-201ENST00000236273 FOXD1Q16676 465 aa33.2■■■□□ 2.91
SYF2-201ENST00000236273 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.2■■■□□ 2.9
SYF2-201ENST00000236273 TRPM2O94759 1503 aa33.18■■■□□ 2.9
SYF2-201ENST00000236273 TXNDC2Q86VQ3 553 aa33.15■■■□□ 2.9
SYF2-201ENST00000236273 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
SYF2-201ENST00000236273 CLTCL1P53675 1640 aa33.14■■■□□ 2.9
SYF2-201ENST00000236273 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
SYF2-201ENST00000236273 ZFYVE9O95405 1425 aa33.1■■■□□ 2.89
SYF2-201ENST00000236273 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
SYF2-201ENST00000236273 EID1Q9Y6B2 187 aa33.08■■■□□ 2.89
SYF2-201ENST00000236273 IQGAP1P46940 1657 aa33.07■■■□□ 2.88
SYF2-201ENST00000236273 RIMS2Q9UQ26 1411 aa33.05■■■□□ 2.88
SYF2-201ENST00000236273 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.04■■■□□ 2.88
SYF2-201ENST00000236273 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms