RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227520.9

CCDC86-201, Transcript of coiled-coil domain containing 86, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC86, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86-201ENST00000227520 PTPRKQ15262 1439 aa20.67■□□□□ 0.9
CCDC86-201ENST00000227520 ADGRL2O95490 1459 aa20.67■□□□□ 0.9
CCDC86-201ENST00000227520 KIF15Q9NS87 1388 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC86-201ENST00000227520 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
CCDC86-201ENST00000227520 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC86-201ENST00000227520 C3P01024 1663 aa20.65■□□□□ 0.9
CCDC86-201ENST00000227520 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
CCDC86-201ENST00000227520 MROH2AA6NES4 1674 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC86-201ENST00000227520 ITGAEP38570 1179 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC86-201ENST00000227520 NCOA1Q15788 1441 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC86-201ENST00000227520 MIER1Q8N108 512 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC86-201ENST00000227520 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC86-201ENST00000227520 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC86-201ENST00000227520 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC86-201ENST00000227520 KIF3BO15066 747 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC86-201ENST00000227520 GGT6Q6P531 493 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC86-201ENST00000227520 ERBINQ96RT1 1412 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC86-201ENST00000227520 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC86-201ENST00000227520 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC86-201ENST00000227520 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC86-201ENST00000227520 DEPDC5O75140 1603 aa20.58■□□□□ 0.88
CCDC86-201ENST00000227520 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC86-201ENST00000227520 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC86-201ENST00000227520 CEP152O94986 1710 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC86-201ENST00000227520 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC86-201ENST00000227520 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CCDC86-201ENST00000227520 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC86-201ENST00000227520 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CCDC86-201ENST00000227520 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CCDC86-201ENST00000227520 ROCK1Q13464 1354 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC86-201ENST00000227520 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC86-201ENST00000227520 ABCC3O15438 1527 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC86-201ENST00000227520 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC86-201ENST00000227520 ZMYM3Q14202 1370 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC86-201ENST00000227520 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC86-201ENST00000227520 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC86-201ENST00000227520 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC86-201ENST00000227520 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC86-201ENST00000227520 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC86-201ENST00000227520 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC86-201ENST00000227520 UNC13BO14795 1591 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC86-201ENST00000227520 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCDC86-201ENST00000227520 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC86-201ENST00000227520 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CCDC86-201ENST00000227520 PZPP20742 1482 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC86-201ENST00000227520 NPATQ14207 1427 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC86-201ENST00000227520 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC86-201ENST00000227520 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 22.9
CCDC86-201ENST00000227520 NAIPQ13075 1403 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC86-201ENST00000227520 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC86-201ENST00000227520 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CCDC86-201ENST00000227520 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CCDC86-201ENST00000227520 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.39■□□□□ 0.86
CCDC86-201ENST00000227520 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
CCDC86-201ENST00000227520 KANK1Q14678 1352 aa20.39■□□□□ 0.85
CCDC86-201ENST00000227520 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC86-201ENST00000227520 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC86-201ENST00000227520 HFM1A2PYH4 1435 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC86-201ENST00000227520 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC86-201ENST00000227520 TET3O43151 1660 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC86-201ENST00000227520 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCDC86-201ENST00000227520 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCDC86-201ENST00000227520 ERVK-7P63135 1459 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC86-201ENST00000227520 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC86-201ENST00000227520 HSPA2P54652 639 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC86-201ENST00000227520 TNRQ92752 1358 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC86-201ENST00000227520 E9PCH4 1651 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC86-201ENST00000227520 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC86-201ENST00000227520 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC86-201ENST00000227520 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC86-201ENST00000227520 NUP155O75694 1391 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC86-201ENST00000227520 SYNMO15061 1565 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC86-201ENST00000227520 STRCQ7RTU9 1775 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC86-201ENST00000227520 NLRP1Q9C000 1473 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC86-201ENST00000227520 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCDC86-201ENST00000227520 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC86-201ENST00000227520 PIK3C2BO00750 1634 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC86-201ENST00000227520 NOS1P29475 1434 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC86-201ENST00000227520 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC86-201ENST00000227520 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.2■□□□□ 0.82
CCDC86-201ENST00000227520 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCDC86-201ENST00000227520 PLA2R1Q13018 1463 aa20.18■□□□□ 0.82
CCDC86-201ENST00000227520 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCDC86-201ENST00000227520 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCDC86-201ENST00000227520 TRIM52Q96A61 297 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC86-201ENST00000227520 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.16■□□□□ 0.82
CCDC86-201ENST00000227520 ADGRB3O60242 1522 aa20.14■□□□□ 0.82
CCDC86-201ENST00000227520 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC86-201ENST00000227520 IDI1Q13907 227 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC86-201ENST00000227520 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC86-201ENST00000227520 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC86-201ENST00000227520 TRPM2O94759 1503 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC86-201ENST00000227520 PTPRTO14522 1441 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC86-201ENST00000227520 CLTCL1P53675 1640 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC86-201ENST00000227520 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CCDC86-201ENST00000227520 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CCDC86-201ENST00000227520 SLIT1O75093 1534 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC86-201ENST00000227520 TONSLQ96HA7 1378 aa20.08■□□□□ 0.8
CCDC86-201ENST00000227520 PKD2Q13563 968 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC86-201ENST00000227520 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms