RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217402.2

CHMP4B-201, Transcript of charged multivesicular body protein 4B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHMP4B, Length 1,646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4B-201ENST00000217402 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
CHMP4B-201ENST00000217402 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.61■■■■■ 4.099e-10■■■■□ 26.3
CHMP4B-201ENST00000217402 DEPDC5O75140 1603 aa40.59■■■■■ 4.09
CHMP4B-201ENST00000217402 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.58■■■■■ 4.09
CHMP4B-201ENST00000217402 UNC13BO14795 1591 aa40.58■■■■■ 4.09
CHMP4B-201ENST00000217402 TRIM52Q96A61 297 aa40.55■■■■■ 4.08
CHMP4B-201ENST00000217402 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
CHMP4B-201ENST00000217402 NUP155O75694 1391 aa40.51■■■■■ 4.08
CHMP4B-201ENST00000217402 HRCP23327 699 aa40.49■■■■■ 4.07
CHMP4B-201ENST00000217402 KANK1Q14678 1352 aa40.48■■■■■ 4.07
CHMP4B-201ENST00000217402 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.42■■■■■ 4.06
CHMP4B-201ENST00000217402 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.42■■■■■ 4.06
CHMP4B-201ENST00000217402 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.42■■■■■ 4.06
CHMP4B-201ENST00000217402 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.41■■■■■ 4.06
CHMP4B-201ENST00000217402 ABCC3O15438 1527 aa40.4■■■■■ 4.06
CHMP4B-201ENST00000217402 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.4■■■■■ 4.06
CHMP4B-201ENST00000217402 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
CHMP4B-201ENST00000217402 CEP152O94986 1710 aa40.39■■■■■ 4.06
CHMP4B-201ENST00000217402 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
CHMP4B-201ENST00000217402 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.37■■■■■ 4.05
CHMP4B-201ENST00000217402 PZPP20742 1482 aa40.37■■■■■ 4.05
CHMP4B-201ENST00000217402 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
CHMP4B-201ENST00000217402 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
CHMP4B-201ENST00000217402 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.34■■■■■ 4.05
CHMP4B-201ENST00000217402 MADDQ8WXG6 1647 aa40.34■■■■■ 4.05
CHMP4B-201ENST00000217402 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.33■■■■■ 4.05
CHMP4B-201ENST00000217402 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
CHMP4B-201ENST00000217402 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.31■■■■■ 4.04
CHMP4B-201ENST00000217402 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.27■■■■■ 4.04
CHMP4B-201ENST00000217402 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.27■■■■■ 4.04
CHMP4B-201ENST00000217402 TET3O43151 1660 aa40.27■■■■■ 4.04
CHMP4B-201ENST00000217402 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.27■■■■■ 4.04
CHMP4B-201ENST00000217402 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.25■■■■■ 4.03
CHMP4B-201ENST00000217402 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
CHMP4B-201ENST00000217402 PKD2Q13563 968 aa40.2■■■■■ 4.03
CHMP4B-201ENST00000217402 MROH2AA6NES4 1674 aa40.18■■■■■ 4.02
CHMP4B-201ENST00000217402 ZMYM3Q14202 1370 aa40.18■■■■■ 4.02
CHMP4B-201ENST00000217402 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
CHMP4B-201ENST00000217402 E9PCH4 1651 aa40.16■■■■■ 4.02
CHMP4B-201ENST00000217402 NPATQ14207 1427 aa40.16■■■■■ 4.02
CHMP4B-201ENST00000217402 FOXD1Q16676 465 aa40.16■■■■■ 4.02
CHMP4B-201ENST00000217402 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.13■■■■■ 4.02
CHMP4B-201ENST00000217402 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.13■■■■■ 4.01
CHMP4B-201ENST00000217402 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.13■■■■■ 4.01
CHMP4B-201ENST00000217402 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
CHMP4B-201ENST00000217402 C3P01024 1663 aa40.09■■■■■ 4.01
CHMP4B-201ENST00000217402 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
CHMP4B-201ENST00000217402 PTPRMP28827 1452 aa40.05■■■■■ 4
CHMP4B-201ENST00000217402 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
CHMP4B-201ENST00000217402 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
CHMP4B-201ENST00000217402 PREX1Q8TCU6 1659 aa40■■■■□ 3.99
CHMP4B-201ENST00000217402 ERVK-7P63135 1459 aa40■■■■□ 3.99
CHMP4B-201ENST00000217402 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa39.96■■■■□ 3.99
CHMP4B-201ENST00000217402 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.95■■■■□ 3.99
CHMP4B-201ENST00000217402 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.99
CHMP4B-201ENST00000217402 NOS1P29475 1434 aa39.94■■■■□ 3.98
CHMP4B-201ENST00000217402 PLA2R1Q13018 1463 aa39.93■■■■□ 3.98
CHMP4B-201ENST00000217402 PTPRTO14522 1441 aa39.92■■■■□ 3.98
CHMP4B-201ENST00000217402 SYNMO15061 1565 aa39.91■■■■□ 3.98
CHMP4B-201ENST00000217402 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.9■■■■□ 3.98
CHMP4B-201ENST00000217402 TRPM2O94759 1503 aa39.9■■■■□ 3.98
CHMP4B-201ENST00000217402 TNRQ92752 1358 aa39.88■■■■□ 3.97
CHMP4B-201ENST00000217402 UGGT1Q9NYU2 1555 aa39.86■■■■□ 3.97
CHMP4B-201ENST00000217402 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.81■■■■□ 3.96
CHMP4B-201ENST00000217402 CLTCL1P53675 1640 aa39.79■■■■□ 3.96
CHMP4B-201ENST00000217402 PIK3C2BO00750 1634 aa39.76■■■■□ 3.95
CHMP4B-201ENST00000217402 IDI1Q13907 227 aa39.73■■■■□ 3.95
CHMP4B-201ENST00000217402 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.73■■■■□ 3.95
CHMP4B-201ENST00000217402 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.73■■■■□ 3.95
CHMP4B-201ENST00000217402 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.73■■■■□ 3.95
CHMP4B-201ENST00000217402 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.7■■■■□ 3.95
CHMP4B-201ENST00000217402 NLRP1Q9C000 1473 aa39.69■■■■□ 3.94
CHMP4B-201ENST00000217402 NEUROD1Q13562 356 aa39.67■■■■□ 3.94
CHMP4B-201ENST00000217402 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
CHMP4B-201ENST00000217402 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.63■■■■□ 3.93
CHMP4B-201ENST00000217402 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.62■■■■□ 3.93
CHMP4B-201ENST00000217402 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.61■■■■□ 3.93
CHMP4B-201ENST00000217402 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.61■■■■□ 3.93
CHMP4B-201ENST00000217402 ADGRB3O60242 1522 aa39.6■■■■□ 3.93
CHMP4B-201ENST00000217402 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.59■■■■□ 3.93
CHMP4B-201ENST00000217402 KIF1BO60333 1816 aa39.59■■■■□ 3.93
CHMP4B-201ENST00000217402 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.57■■■■□ 3.92
CHMP4B-201ENST00000217402 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
CHMP4B-201ENST00000217402 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.54■■■■□ 3.92
CHMP4B-201ENST00000217402 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.54■■■■□ 3.92
CHMP4B-201ENST00000217402 RGL3Q3MIN7 710 aa39.52■■■■□ 3.92
CHMP4B-201ENST00000217402 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.51■■■■□ 3.92
CHMP4B-201ENST00000217402 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
CHMP4B-201ENST00000217402 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
CHMP4B-201ENST00000217402 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.45■■■■□ 3.91
CHMP4B-201ENST00000217402 TONSLQ96HA7 1378 aa39.43■■■■□ 3.9
CHMP4B-201ENST00000217402 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.43■■■■□ 3.9
CHMP4B-201ENST00000217402 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
CHMP4B-201ENST00000217402 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.37■■■■□ 3.89
CHMP4B-201ENST00000217402 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
CHMP4B-201ENST00000217402 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.36■■■■□ 3.89
CHMP4B-201ENST00000217402 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.34■■■■□ 3.89
CHMP4B-201ENST00000217402 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa39.34■■■■□ 3.89
CHMP4B-201ENST00000217402 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
CHMP4B-201ENST00000217402 HSPA2P54652 639 aa39.32■■■■□ 3.89
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