RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	RIM13	Q03792	727 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	NAT4	Q04751	285 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	GSH2	Q08220	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	MRP13	P12686	339 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	STE12	P13574	688 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	ARE1	P25628	610 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	PMT2	P31382	759 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	SPT10	P35208	640 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	YGR201C	P42936	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	URA6	P15700	204 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	ACB1	P31787	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	ECM34	P38728	170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	LRO1	P40345	661 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	NIT2	P47016	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	SWP1	Q02795	286 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	ADD37	Q03233	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	YBR242W	P38331	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	ERV46	P39727	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	JAC1	P53193	184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	PEX25	Q02969	394 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	HLR1	Q04429	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	MFG1	Q07684	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	TEN1	Q07921	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	FRE3	Q08905	711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	STE14	P32584	239 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	AFR1	P33304	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	NSG1	P38837	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	DSS1	P39112	969 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	COG3	P40094	801 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	PCL7	P40186	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	VID22	Q05934	901 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	MET17	P06106	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	IMG1	P25626	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	DCG1	P32460	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	TAF14	P35189	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	KKQ8	P36004	724 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
PDR10	YOR328W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	ECM18	Q04623	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	YFH1	Q07540	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	YRM1	Q12340	786 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	CDC4	P07834	779 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	MDL1	P33310	695 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	SOL2	P37262	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	CTF8	P38877	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	SSN8	P47821	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	MTM1	P53320	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	TAF3	Q12297	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	RRI1	Q12468	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	ATP6	P00854	259 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	YSR3	P23501	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	LOT5	P34234	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	YEL057C	P39983	233 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	BUL1	P48524	976 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	NAS6	P50086	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	MGA1	P53050	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	GIS1	Q03833	894 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	RAD30	Q04049	632 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	DCR2	Q05924	578 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	CRT10	Q08226	957 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	PSF1	Q12488	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	RPB5	P20434	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	VPS17	P32913	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	MDM31	P38880	579 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	RIM21	P48565	533 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	MDM36	Q06820	579 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR10	YOR328W	IRC25	Q07951	179 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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