RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	LAS17	Q12446	633 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	RIP1	P08067	215 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	PDE1	P22434	369 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	CNA1	P23287	553 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	CTR86	P25355	563 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.68	□□□□□ -1.82	not detected
PAM18	YLR008C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	MRPL7	P36519	292 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	FZO1	P38297	855 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	RPP1	P38786	293 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	CYC2	P38909	366 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	SEO1	P39709	593 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ECM10	P39987	644 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	RPC17	P47076	161 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	PKP2	P53170	491 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	SPC98	P53540	846 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	GOR1	P53839	350 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ASI2	P53895	289 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YNL140C	P53910	189 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YMR087W	Q04299	284 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	BUR2	Q05949	395 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	DXO1	Q06349	442 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	RSA1	Q08932	381 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	PER33	Q12144	273 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	SNF8	Q12483	233 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	CLN3	P13365	580 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	GAC1	P28006	793 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ACH1	P32316	526 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	VPH2	P32341	215 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	REC114	P32841	428 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	SSO1	P32867	290 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	PDR3	P33200	976 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	CPR5	P35176	225 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	MCH2	P36032	473 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	MED8	P38304	223 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	VHC1	P38329	1120 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	HIS2	P38635	335 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	STP2	P38704	541 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	TRM5	P38793	499 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ELO1	P39540	310 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ECM1	P39715	212 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	GET2	P40056	285 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ATG27	P46989	271 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YGL082W	P53155	381 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	FHN1	P53279	174 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YGR168C	P53293	376 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	GND2	P53319	492 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	SUN4	P53616	420 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	SLG1	P54867	378 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	OST6	Q03723	332 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	UBX2	Q04228	584 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	KRE28	Q04431	385 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	PEX10	Q05568	337 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YOL159C	Q08300	171 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	DAS2	Q12084	232 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	RUP1	Q12242	671 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ARP6	Q12509	438 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YLR415C	O13578	112 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	PUT1	P09368	476 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ATP10	P18496	279 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	MAK31	P23059	88 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	POP5	P28005	173 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	MSK1	P32048	576 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	NDC1	P32500	655 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	IES6	P32617	166 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	RGT1	P32862	1170 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YKL063C	P35725	167 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ECM8	P38246	354 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	ICS2	P38284	255 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	DER1	P38307	211 aa		3.66	□□□□□ -1.82

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