RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL047WYLL047W DDC1Q08949 612 aa3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W MAS1P10507 462 aa3.34□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W RAD23P32628 398 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W RBG1P39729 369 aa3.34□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W YMR134WP40207 237 aa3.34□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W MOB2P43563 287 aa3.34□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W VEL1P53058 206 aa3.34□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W CDH1P53197 566 aa3.34□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W HST1P53685 503 aa3.34□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W SUR7P54003 302 aa3.34□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W MRX11Q03079 207 aa3.34□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W TRM82Q03774 444 aa3.34□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W PHO84P25297 587 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W TIP20P33891 701 aa3.33□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W RCK2P38623 610 aa3.33□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W FRT2P39734 528 aa3.33□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W YOL075CQ08234 1294 aa3.33□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W FRE8Q12209 686 aa3.33□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W STE2D6VTK4 431 aa3.32□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W ARF2P19146 181 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W ERG9P29704 444 aa3.32□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W ZIP1P31111 875 aa3.32□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W ADH5P38113 351 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W IST2P38250 946 aa3.32□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W STB1P42845 420 aa3.32□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W SLF1Q12034 447 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W CKA2P19454 339 aa3.31□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W CKI1P20485 582 aa3.31□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W MRPS5P33759 307 aa3.31□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W PEX32P38292 413 aa3.31□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W GGC1P38988 300 aa3.31□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W FHL1P39521 936 aa3.31□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W RRT13P40042 185 aa3.31□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W PRM7Q12459 698 aa3.31□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W FRE6Q12473 712 aa3.31□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W YNL320WP42840 284 aa3.3□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W PFS2P42841 465 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W YHC3P47040 408 aa3.3□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W LSG1P53145 640 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W SMP3Q04174 516 aa3.3□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W URA10P30402 227 aa3.29□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W FMT1P32785 401 aa3.29□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W FRM2P37261 193 aa3.29□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W ATG7P38862 630 aa3.29□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W UFE1P41834 346 aa3.29□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W YNL143CP53908 130 aa3.29□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W SCS7Q03529 384 aa3.29□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W VTI1Q04338 217 aa3.29□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W API2Q04413 109 aa3.29□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W APC4Q04601 652 aa3.29□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W CSM3Q04659 317 aa3.29□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W APC5Q08683 685 aa3.29□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W BGL2P15703 313 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W YKL071WP36086 256 aa3.28□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W PCH2P38126 564 aa3.28□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W TRR2P38816 342 aa3.28□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W NAT4Q04751 285 aa3.28□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W MMT2Q08970 484 aa3.28□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W GLE1Q12315 538 aa3.28□□□□□ -1.88
YLL047WYLL047W AUS1Q08409 1394 aa3.27□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W FUS3P16892 353 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W DCC1P25559 380 aa3.27□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W MXR2P25566 168 aa3.27□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W MKK1P32490 508 aa3.27□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W YIR035CP40579 254 aa3.27□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W NAS6P50086 228 aa3.27□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W HST4P53688 370 aa3.27□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W FAR10Q06001 478 aa3.27□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W YAL067W-AQ8TGK6 75 aa3.27□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W BI3Q9ZZW7 517 aa3.27□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W DBP7P36120 742 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W APE4P38821 490 aa3.26□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W PRM1P53835 661 aa3.26□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W MRX8Q05473 314 aa3.26□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W SPH1Q06160 661 aa3.26□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W YDR018CQ12185 396 aa3.26□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W YCH1P42937 148 aa3.25□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W YFR018CP43599 363 aa3.25□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W INP2Q03824 705 aa3.25□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W YPS3Q12303 508 aa3.25□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W RGS2Q99188 309 aa3.25□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W RAD1P06777 1100 aa3.24□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W SAG1P20840 650 aa3.24□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W UTR1P21373 530 aa3.24□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W YEL043WP32618 956 aa3.24□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W ZRG17P53735 605 aa3.24□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W AQR1P53943 586 aa3.24□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W GMC1Q04399 608 aa3.24□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W APC2Q12440 853 aa3.24□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W VPS63O13549 108 aa3.23□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data3.23□□□□□ -1.89not detected
YLL047WYLL047W YOL029CQ08187 201 aa3.23□□□□□ -1.89
YLL047WYLL047W TAF10Q12030 206 aa3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.7 ms