RNA–Protein interactions for RNA: YHL028W

WSC4, Transcript of Endoplasmic reticulum (ER) membrane protein, yeast

Gene WSC4, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSC4	YHL028W	RTC2	P38279	296 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YHR035W	P38769	630 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	NEO1	P40527	1151 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	SNM1	P40993	198 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YPL068C	Q02749	293 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YML096W	Q04489	525 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	VID22	Q05934	901 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YLR224W	Q05947	369 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	FRE5	Q08908	694 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	FAB1	P34756	2278 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	BET2	P20133	325 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	SFC1	P33303	322 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	SRO77	P38163	1010 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	HPA3	P39979	161 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	UBC12	P52491	188 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	FHN1	P53279	174 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ERV29	P53337	310 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	COS1	P53822	381 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YSA1	Q01976	231 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YDR249C	Q03787	373 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	BUR2	Q05949	395 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	BOP2	Q06150	570 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ARV1	Q06541	321 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	GPN3	Q06543	272 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YPR084W	Q06821	456 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	WHI5	Q12416	295 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	BAR1	P12630	587 aa		7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YCR102C	P25608	368 aa		7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	MCM7	P38132	845 aa		7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YJL068C	P40363	299 aa		7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	TOS2	P50078	622 aa		7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	IMO32	P53219	342 aa		7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	BUD17	P53727	317 aa		7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	RSF1	Q05043	376 aa		7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	MLC2	Q06580	163 aa		7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	SFG1	Q12507	346 aa		7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	MPD2	Q99316	277 aa		7.23	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YBR085C-A	O43137	85 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	GCN4	P03069	281 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	SNF6	P18888	332 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	PUP1	P25043	261 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.22	□□□□□ -1.25	not detected
WSC4	YHL028W	YPT7	P32939	208 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YKL151C	P36059	337 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YKL077W	P36081	392 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YBR063C	P38083	404 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ECM31	P38122	312 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	FMC1	P40491	155 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ZIM17	P42844	174 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	CHA4	P43634	648 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	NUP57	P48837	541 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	POP6	P53218	158 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	TDA1	Q03533	586 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ELP6	Q04868	273 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	TPO3	Q06451	622 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	FRE3	Q08905	711 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YOL107W	Q12239	342 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	COX3	P00420	269 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	HIS5	P07172	385 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	PHO80	P20052	293 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	PDR3	P33200	976 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	RRF1	P38771	230 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	GID8	P40208	455 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YTA6	P40328	754 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	PAM16	P42949	149 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	BUD9	P53226	547 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YGR067C	P53243	804 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YLR346C	Q06139	101 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YLR173W	Q06247	608 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	SKM1	Q12469	655 aa		7.22	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
WSC4	YHL028W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
WSC4	YHL028W	RAS1	P01119	309 aa		7.21	□□□□□ -1.26
WSC4	YHL028W	SIR2	P06700	562 aa		7.21	□□□□□ -1.26
WSC4	YHL028W	FUS1	P11710	512 aa		7.21	□□□□□ -1.26
WSC4	YHL028W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
WSC4	YHL028W	NPR1	P22211	790 aa		7.21	□□□□□ -1.26
WSC4	YHL028W	CNB1	P25296	175 aa		7.21	□□□□□ -1.26
WSC4	YHL028W	YCR100C	P25606	316 aa		7.21	□□□□□ -1.26
WSC4	YHL028W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26

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