RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	CSI1	Q04368	295 aa		1.44	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	ECM19	Q06011	112 aa		1.44	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	YLH47	Q06493	454 aa		1.44	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	RPB9	P27999	122 aa		1.43	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	FAD1	P38913	306 aa		1.43	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	1.43	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	MRPL8	P22353	238 aa		1.42	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	1.42	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	1.42	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	1.42	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	MOB2	P43563	287 aa		1.42	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	RTT102	P53330	157 aa		1.42	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	YLR287C	Q05881	355 aa		1.42	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	PEX30	Q06169	523 aa		1.42	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	1.42	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	CTA1	P15202	515 aa		1.41	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	NDE1	P40215	560 aa		1.41	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	DXO1	Q06349	442 aa		1.41	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	1.41	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	YPL264C	Q08980	353 aa		1.41	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	1.41	□□□□□ -2.18
VAR1	Q0140	ADK2	P26364	225 aa		1.4	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	INO2	P26798	304 aa		1.4	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	RCK1	P38622	512 aa		1.4	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	SUR7	P54003	302 aa		1.4	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	1.4	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	AAD15	Q08361	143 aa		1.4	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	SLM3	Q12093	417 aa		1.4	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	MED8	P38304	223 aa		1.39	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	RRG9	P40156	214 aa		1.39	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	YCH1	P42937	148 aa		1.39	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	INP1	Q03694	420 aa		1.39	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	YMR244W	Q04018	355 aa		1.39	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	CPR2	P23285	205 aa		1.38	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	URA10	P30402	227 aa		1.38	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	ZRT3	P34240	503 aa		1.38	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	VPS72	Q03388	795 aa		1.38	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	1.37	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	YER084W	P40057	128 aa		1.37	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	YIL054W	P40524	105 aa		1.37	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	MIC19	P43594	170 aa		1.37	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	YFR018C	P43599	363 aa		1.37	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	YFR045W	P43617	309 aa		1.37	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	TCB2	P48231	1178 aa		1.37	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	TRM82	Q03774	444 aa		1.37	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	1.37	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	SHS1	Q07657	551 aa		1.37	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	FEX1	Q08913	375 aa		1.37	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	FEX2	Q08991	375 aa		1.37	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	VPS63	O13549	108 aa		1.36	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	PDE2	P06776	526 aa		1.36	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	1.36	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	IST2	P38250	946 aa		1.36	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	CAX4	P53223	239 aa		1.36	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	ALE1	Q08548	619 aa		1.36	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	UAF30	Q08747	228 aa		1.36	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	YKL071W	P36086	256 aa		1.35	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	ECO1	P43605	281 aa		1.35	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	YDR541C	Q03049	344 aa		1.35	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	1.35	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	SCM3	Q12334	223 aa		1.35	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	UBA3	Q99344	299 aa		1.35	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	YNL095C	P53932	642 aa		1.34	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	NDL1	Q06568	189 aa		1.34	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	YDL121C	Q07541	149 aa		1.34	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	MRX4	Q12467	430 aa		1.34	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	1.34	□□□□□ -2.19
VAR1	Q0140	ITR2	P30606	609 aa		1.33	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	PEX5	P35056	612 aa		1.33	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	HIT1	P46973	164 aa		1.33	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	1.33	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	YHR182W	P38870	785 aa		1.32	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	YGR111W	P53265	400 aa		1.32	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	IES3	Q12345	250 aa		1.32	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	1.31	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	CTM1	P38818	585 aa		1.3	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	1.3	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	MDM1	Q01846	1127 aa		1.3	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	1.29	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	YHR177W	P38867	453 aa		1.29	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	YER188W	P40103	239 aa		1.29	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	ZIM17	P42844	174 aa		1.29	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	YGL118C	P53132	145 aa		1.29	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	FMP48	P53233	369 aa		1.29	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	MEH1	Q02205	184 aa		1.29	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	1.28	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	1.28	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	YEL043W	P32618	956 aa		1.28	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	1.28	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	DCI1	Q08558	271 aa		1.28	□□□□□ -2.2
VAR1	Q0140	VAM7	P32912	316 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VAR1	Q0140	PCH2	P38126	564 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VAR1	Q0140	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	1.27	□□□□□ -2.21
VAR1	Q0140	MNL1	P38888	796 aa		1.27	□□□□□ -2.21
VAR1	Q0140	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	1.27	□□□□□ -2.21
VAR1	Q0140	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	1.27	□□□□□ -2.21
VAR1	Q0140	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	1.25	□□□□□ -2.21
VAR1	Q0140	LTV1	P34078	463 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VAR1	Q0140	SMF2	P38778	549 aa		1.25	□□□□□ -2.21
VAR1	Q0140	SLM1	P40485	686 aa		1.25	□□□□□ -2.21

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