RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C GAS2Q06135 555 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GMC2Q06201 188 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR446WQ06204 433 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HDA2Q06629 674 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GPI11Q06636 219 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YDL218WQ07629 317 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YLL007CQ07799 665 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data0.63□□□□□ -2.31not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C NOP12Q08208 459 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C BRX1Q08235 291 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SGT1Q08446 395 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PUS7Q08647 676 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YOR376WQ08900 122 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RDR1Q08904 546 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NIP7Q08962 181 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SLF1Q12034 447 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MDM32Q12171 622 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RLM1Q12224 676 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YDL177CQ12257 170 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HER1Q12276 1246 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YOR214CQ12282 236 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NTO1Q12311 748 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SFM1Q12314 213 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPN6Q12377 434 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SWM1Q12379 170 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SNF8Q12483 233 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YOR343CQ12484 108 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PSF1Q12488 208 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YOL159C-AQ3E769 90 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MHF2Q3E829 80 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MDM12Q92328 271 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SRN2Q99176 213 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TSC13Q99190 310 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C DFG16Q99234 619 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YOL087CQ99247 1116 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C UBR1P19812 1950 aa0.63□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C BEM2P39960 2167 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C THP2O13539 261 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR358CO13565 187 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SCEIP03882 235 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C OPI3P05375 206 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HEM4P06174 275 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SIR3P06701 978 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PDE2P06776 526 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HTS1P07263 546 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PEP4P07267 405 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPC40P07703 335 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC4P07834 779 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PBS2P08018 668 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SUI3P09064 285 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YOL162WP0CF19 215 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YHR214C-DP0CX93 97 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ARF1P11076 181 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MCM1P11746 286 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HMG1P12683 1054 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SNF4P12904 322 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ATR1P13090 542 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C STE12P13574 688 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CTA1P15202 515 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YPK2P18961 677 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PHO80P20052 293 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PRP4P20053 465 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPB8P20436 146 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NUP1P20676 1076 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MDH2P22133 377 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GAS1P22146 559 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MAK32P23060 363 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CNA1P23287 553 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YCK1P23291 538 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CLB4P24871 460 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RVS161P25343 265 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPC19P28000 142 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CAM1P29547 415 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ERG9P29704 444 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ITR2P30606 609 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ZIP1P31111 875 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ASF2P32448 525 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GSH1P32477 678 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data0.62□□□□□ -2.31not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C RPN2P32565 945 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YEF1P32622 495 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data0.62□□□□□ -2.31not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C YOX1P34161 385 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TOD6P34219 525 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MTR2P34232 184 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TEF4P36008 412 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MAE1P36013 669 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GPX1P36014 167 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YKL071WP36086 256 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C KAE1P36132 386 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C FLO10P36170 1169 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL39P36533 70 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C AHP1P38013 176 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PDX3P38075 228 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TAT1P38085 619 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ECM8P38246 354 aa0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.5 ms