RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	GET2	P40056	285 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	MPM1	P40364	252 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YIL001W	P40560	513 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	FMP33	P46998	180 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	TRM9	P49957	279 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YGR079W	P53249	370 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YGR266W	P53326	701 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	GOR1	P53839	350 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	RRN11	Q04712	507 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	SWA2	Q06677	668 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	DCI1	Q08558	271 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YOR342C	Q12182	319 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	SKS1	Q12505	502 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YOR019W	Q99248	730 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	GAL3	P13045	520 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	CMK2	P22517	447 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	NTG1	P31378	399 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	RIB1	P38066	345 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	SCO2	P38072	301 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	UME6	P39001	836 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	ILM1	P47155	203 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	PAC10	P48363	199 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YNL181W	P53878	407 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	OAZ1	Q02803	292 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	TRS23	Q03784	219 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	HFD1	Q04458	532 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.57	□□□□□ -1.84	not detected
PPQ1	YPL179W	TAF3	Q12297	353 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	PSY3	Q12318	242 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	PUT2	P07275	575 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	SNF4	P12904	322 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	CDC43	P18898	376 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	STP22	P25604	385 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YPT7	P32939	208 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YBR241C	P38142	488 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	SLM4	P38247	162 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
PPQ1	YPL179W	ELP2	P42935	788 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	HOC1	P47124	396 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	TPC1	P53257	314 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	ATG4	P53867	494 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YNL095C	P53932	642 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	PEX12	Q04370	399 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	COS7	Q07788	383 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	THP1	Q08231	455 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YDL199C	Q12407	687 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	MHF2	Q3E829	80 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YCK1	P23291	538 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	SSH4	P32343	579 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	TAF14	P35189	244 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YPT53	P36019	220 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	MRPL15	P36523	253 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	RBG1	P39729	369 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YNR068C	P53754	272 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YKU80	Q04437	629 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	GLE1	Q12315	538 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	SEC39	Q12745	709 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	RIP1	P08067	215 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	CBS2	P14905	389 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	RPB5	P20434	215 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	APN1	P22936	367 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	PRP28	P23394	588 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	CLB3	P24870	427 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	DMC1	P25453	334 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	UBC8	P28263	218 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	MSN2	P33748	704 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	SWH1	P35845	1188 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	FES1	P38260	290 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	UBS1	P38290	277 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	LEU5	P38702	357 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PPQ1	YPL179W	TOS2	P50078	622 aa		3.55	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 568.6 ms