RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	CTR86	P25355	563 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SIN4	P32259	974 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	HCS1	P34243	683 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	BYE1	P36106	594 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	FHL1	P39521	936 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	MOB1	P40484	314 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	MND1	P53102	219 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	YDR131C	Q03899	556 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	ARO80	Q04052	950 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	GYL1	Q04322	720 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	YDR222W	Q04925	415 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	DDC1	Q08949	612 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	YPQ1	Q12010	308 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	NFU1	P32860	256 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	COY1	P34237	679 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	YKL097C	P34245	136 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	KDX1	P36005	433 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	AVT2	P39981	480 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	YER189W	P40104	122 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	JLP2	P40206	208 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	YDR278C	Q05612	105 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	REX4	Q08237	289 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	TAF10	Q12030	206 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	PEX34	P25584	144 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	RML2	P32611	393 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	PCH2	P38126	564 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	MIG3	P39943	394 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	YGR111W	P53265	400 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SFI1	Q12369	946 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	EMP46	Q12396	444 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	IZH2	Q12442	317 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	JIP3	O13555	125 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	PUT4	P15380	627 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	CLC1	P17891	233 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	RHB1	P25378	209 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	BEM1	P29366	551 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SRB2	P34162	210 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	MID2	P36027	376 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	ARA1	P38115	344 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	ECM13	P38195	257 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	HIS2	P38635	335 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SEC9	P40357	651 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	EFM4	P40516	257 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SNZ3	P43545	298 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	MDE1	P47095	244 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	HOP2	P53187	214 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SNZ2	P53824	298 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	NUP116	Q02630	1113 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SPC19	Q03954	165 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	AIM32	Q04689	311 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	TAF9	Q05027	157 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	BCH1	Q05029	724 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	YLR345W	Q06137	509 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	VTA1	Q06263	330 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.67	□□□□□ -1.98	not detected
PEX18	YHR160C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	RAD10	P06838	210 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	NAM2	P11325	894 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	PDX1	P16451	410 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	CLB3	P24870	427 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	HIR2	P32480	875 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	RCK2	P38623	610 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	TCD1	P38756	429 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	MED6	P38782	295 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	GPI15	P53961	229 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	KTR6	P54070	446 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	OAZ1	Q02803	292 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SOR2	Q07786	357 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	DAS2	Q12084	232 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	SPO7	P18410	259 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	GEX1	P25596	615 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	YCR051W	P25631	222 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	ERV1	P27882	189 aa		2.66	□□□□□ -1.98
PEX18	YHR160C	DBF4	P32325	704 aa		2.66	□□□□□ -1.98

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