RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W SIA1Q12212 622 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MTR10Q99189 972 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W PET9P18239 318 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W NTG1P31378 399 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W NIC96P34077 839 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W TPO5P36029 618 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ARN2P38724 620 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W PZF1P39933 429 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W DLD3P39976 496 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W RIO2P40160 425 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W BPL1P48445 690 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W DAM1P53267 343 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W RBG2P53295 368 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YPQ2Q06328 317 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ENB1Q08299 606 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MHF1Q3E835 90 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W EMP70P32802 667 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W IES5P40060 125 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W LAS21P40367 830 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W BAP3P41815 604 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W GCN20P43535 752 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MNN5P46982 586 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MRK1P50873 501 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W PRM8P53174 237 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YDR209CQ03480 137 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W NUP53Q03790 475 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W VPS36Q06696 566 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W COQ10Q08058 207 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W BDS1Q08347 646 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W DCI1Q08558 271 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W RDR1Q08904 546 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W NFI1Q12216 726 aa3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W CYR1P08678 2026 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W FAS1P07149 2051 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W HFA1P32874 2273 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W RPL7AP05737 244 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ARF1P11076 181 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YAP1P19880 650 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W NUP1P20676 1076 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W PRP21P32524 280 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W SEC61P32915 480 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MOH1P38191 138 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W CTF8P38877 133 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W HXT9P40885 567 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ASI2P53895 289 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W HXT11P54862 567 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YPL068CQ02749 293 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YDR541CQ03049 344 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MRPL1Q04599 285 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YPR097WQ06839 1073 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W CYK3Q07533 885 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YDL109CQ12103 647 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data3.75□□□□□ -1.81not detected
SPC105YGL093W RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W DFG16Q99234 619 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W VCX1Q99385 411 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YHR214C-DP0CX93 97 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W RPN2P32565 945 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MAE1P36013 669 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W JEN1P36035 616 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YKL071WP36086 256 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ECM8P38246 354 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W NTA1P40354 457 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W CIN1P40987 1014 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YJR115WP47152 169 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W COS10P52924 374 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YKR011CQ02209 353 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YPL039WQ03080 316 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W TMS1Q12116 473 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W SFG1Q12507 346 aa3.75□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W TPK3P05986 398 aa3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W PEP4P07267 405 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YOL162WP0CF19 215 aa3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W SEC12P11655 471 aa3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W AIM17P23180 465 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ADH7P25377 361 aa3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W NAM9P27929 486 aa3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W LYP1P32487 611 aa3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ECM1P39715 212 aa3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W GDI1P39958 451 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W BUR6P40096 142 aa3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W GVP36P40531 326 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W HMS2P47175 358 aa3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W PGU1P47180 361 aa3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W PBP1P53297 722 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MPA43P53583 542 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ARV1Q06541 321 aa3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W LOT6Q07923 191 aa3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W NTG2Q08214 380 aa3.74□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W UIP4Q08926 304 aa3.74□□□□□ -1.81
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