RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	MXR2	P25566	168 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.15	□□□□□ -1.9	not detected
TOP1	YOL006C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	GDA1	P32621	518 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	TMT1	P32643	299 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	MYO3	P36006	1272 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	BNA4	P38169	460 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	FIG1	P38224	298 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	RPH1	P39956	796 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	COG2	P53271	262 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	ZRG17	P53735	605 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	HSP31	Q04432	237 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	SNF8	Q12483	233 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	QCR7	P00128	127 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	RAS1	P01119	309 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	QCR2	P07257	368 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	POP5	P28005	173 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	ICE2	P40499	491 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	SYG1	P40528	902 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	AGP3	P43548	558 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	AIM24	P47127	394 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YIP3	P53633	176 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	GIP3	Q03016	1276 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	OST6	Q03723	332 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	PLM2	Q04383	521 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	IMA3	P0CW40	589 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	IMA4	P0CW41	589 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	IES6	P32617	166 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	NUF2	P33895	451 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	CHK1	P38147	527 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YER121W	P40076	114 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	POG1	P40473	351 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	POP1	P41812	875 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YGR210C	P42942	411 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	SSN8	P47821	323 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YDL086W	Q07505	273 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	IMA2	Q08295	589 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YPQ1	Q12010	308 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	PER33	Q12144	273 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	TYR1	P20049	452 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	GIT1	P25346	518 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	PPZ1	P26570	692 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	SSO1	P32867	290 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	FZO1	P38297	855 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	TRM5	P38793	499 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	SLM1	P40485	686 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YKE4	P40544	346 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YIR016W	P40572	265 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	PKP2	P53170	491 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	AAT1	Q01802	451 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	VPS60	Q03390	229 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	LDS2	Q08218	356 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	ERP3	Q12403	225 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	SNA3	P14359	133 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	CTR86	P25355	563 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	NDC1	P32500	655 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	RAD24	P32641	659 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	MSN2	P33748	704 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	MRPS5	P33759	307 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	CBP4	P37267	147 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YBR053C	P38235	358 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	COX15	P40086	486 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	HOC1	P47124	396 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	YJR149W	P47177	404 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	NAS6	P50086	228 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	UBP8	P50102	471 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	UBC11	P52492	156 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	RIM8	P53179	542 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	DUG3	P53871	357 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	MMT1	Q03218	510 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	ROT1	Q03691	256 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	TRS23	Q03784	219 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	TMN2	Q04562	672 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	NAT4	Q04751	285 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	PEX10	Q05568	337 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	ASA1	Q06822	443 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	NDE2	Q07500	545 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	MLH3	Q12083	715 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	RKI1	Q12189	258 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	ECM5	Q03214	1411 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TOP1	YOL006C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91

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