RNA–Protein interactions for RNA: YJL134W

LCB3, Transcript of Long-chain base-1-phosphate phosphatase, yeastyeast

Gene LCB3, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB3YJL134W ZIM17P42844 174 aa5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W SWP82P43554 623 aa5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W SCW11P53189 542 aa5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W YGR079WP53249 370 aa5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W RIM13Q03792 727 aa5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W NEJ1Q06148 342 aa5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W OPT2Q06593 877 aa5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W MDM36Q06820 579 aa5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W XYL2Q07993 356 aa5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W DCI1Q08558 271 aa5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W YOR389WQ08912 624 aa5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W SRO7Q12038 1033 aa5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W DIN7Q12086 430 aa5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W FMP27Q06179 2628 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W MRP10O75012 95 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W ENA1P13587 1091 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W SAM35P14693 329 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W FUR1P18562 216 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W IDP1P21954 428 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W BUB3P26449 341 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data5.9□□□□□ -1.46not detected
LCB3YJL134W SSH4P32343 579 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W ERG1P32476 496 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W TEF4P36008 412 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W TUL1P36096 758 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W PIM1P36775 1133 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W YHR033WP38690 423 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W YAL037WP39728 267 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W VRG4P40107 337 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W TIF34P40217 347 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W BIT61P47041 543 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W TWF1P53250 332 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W YGR168CP53293 376 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W RHO3Q00245 231 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W RHO4Q00246 291 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W ENA2Q01896 1091 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W GRX5Q02784 150 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W YDR444WQ04093 687 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W MGR3Q04472 501 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W YLR345WQ06137 509 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W YDL114WQ07530 308 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W GSH2Q08220 491 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W PUS9Q12069 462 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W YPR022CQ12139 1133 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W NFI1Q12216 726 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W SKS1Q12505 502 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W ENA5Q12691 1091 aa5.9□□□□□ -1.46
LCB3YJL134W COX3P00420 269 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W NTH1P32356 751 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W ASF2P32448 525 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W SEC66P33754 206 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W DOA1P36037 715 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W OMA1P36163 345 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W YBR139WP38109 508 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W EHT1P38295 451 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W ARN2P38724 620 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W CTF8P38877 133 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W RCY1P39531 840 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W AST2P39945 430 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W RRG9P40156 214 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W MET28P40573 187 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W RET2P43621 546 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W STE24P47154 453 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W MNN10P50108 393 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W CIK1Q01649 594 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W NUP49Q02199 472 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W GAL83Q04739 417 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa5.89□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W SIR3P06701 978 aa5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W RPC40P07703 335 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W CUP1-1P0CX80 61 aa5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W CUP1-2P0CX81 61 aa5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W TFS1P14306 219 aa5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W VPS33P20795 691 aa5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W PPH21P23594 369 aa5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W SUI1P32911 108 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W PFS1P38872 237 aa5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data5.88□□□□□ -1.47not detected
LCB3YJL134W SIT1P39980 628 aa5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W AIM20P40451 204 aa5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W SNM1P40993 198 aa5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W HMS2P47175 358 aa5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W HXT16P47185 567 aa5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W EGD1Q02642 157 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
LCB3YJL134W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
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