RNA–Protein interactions for RNA: YHR140W

YHR140W, Transcript of Putative integral membrane protein of unknown function, yeastyeast

Gene YHR140W, Length 720 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WYHR140W YLR281CQ05863 155 aa5.32□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W PMU1P36069 295 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W MST28P39552 234 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W SIM1P40472 476 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W RTT101P47050 842 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W STE24P47154 453 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W ASA1Q06822 443 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W AYT1Q12226 474 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W TUS1Q06412 1307 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W RPC40P07703 335 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W SLY1P22213 666 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W SEC1P30619 724 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W BZZ1P38822 633 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W LIN1P38852 340 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W ATM1P40416 690 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W SNL1P40548 159 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W YPR078CQ06813 372 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W NCB2Q92317 146 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W THR4P16120 514 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W COX13P32799 129 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W KKQ8P36004 724 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W DOA1P36037 715 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W ATP3P38077 311 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W RPR2P40571 144 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W MKT1P40850 830 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W SSN8P47821 323 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W AZR1P50080 613 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W YGL242CP53066 181 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W VPS20Q04272 221 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W LDS2Q08218 356 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W SRL1Q08673 210 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W VPS63O13549 108 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W HEM2P05373 342 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W MAS1P10507 462 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W ARF1P11076 181 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W CDC23P16522 626 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W DBR1P24309 405 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W SPT10P35208 640 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W YBR139WP38109 508 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W ERV25P54837 211 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W DAP1Q12091 152 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W NCA2Q12374 616 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR140WYHR140W TPK3P05986 398 aa5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W ATP1P07251 545 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W RNA1P11745 407 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W MSK1P32048 576 aa5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W RIB5P38145 238 aa5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W ALP1P38971 573 aa5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W OST1P41543 476 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W SAD1P43589 448 aa5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W TOS3P43637 560 aa5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W YPL068CQ02749 293 aa5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W AIM33Q04516 312 aa5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W SET6Q12529 373 aa5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W RAD61Q99359 647 aa5.27□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W HXT2P23585 541 aa5.26□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W PPQ1P32945 549 aa5.26□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W YBR137WP38276 179 aa5.26□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W SPG5P42933 373 aa5.26□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W STE23Q06010 1027 aa5.26□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W ARR1Q06596 294 aa5.26□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W GLE1Q12315 538 aa5.26□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W ATR1P13090 542 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W GRR1P24814 1151 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W RNA14P25298 677 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W DAL80P26343 269 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W HMX1P32339 317 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W FAA2P39518 744 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W SSO2P39926 295 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W RPH1P39956 796 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W RTT105P40063 208 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W AIM20P40451 204 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W YFR018CP43599 363 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W SFH5P47008 294 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W RET3P53600 189 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W CAF40P53829 373 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W WSC2P53832 503 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W GOR1P53839 350 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W SPR6Q01684 191 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W CCE1Q03702 353 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W ERP1Q05359 219 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W RGT2Q12300 763 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W FSH3Q99369 266 aa5.25□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W CDC37P06101 506 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W GAL3P13045 520 aa5.24□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W DBP3P20447 523 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YHR140WYHR140W TOA2P32774 122 aa5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.7 ms