RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	RIC1	P40395	1056 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	AVT7	P40501	490 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YNL320W	P42840	284 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	AIM22	P47051	409 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	AIF1	P52923	378 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	USA1	Q03714	838 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YDR249C	Q03787	373 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YAP6	Q03935	383 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	COS7	Q07788	383 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	FDH1	Q08911	376 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	NTO1	Q12311	748 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	ALG7	P07286	448 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RAD51	P25454	400 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RPC37	P36121	282 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	AIM2	P39721	246 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	MPH1	P40562	993 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	GDS1	P41913	522 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YJR039W	P47107	1121 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	MSY1	P48527	492 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YNR068C	P53754	272 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	UBX4	P54730	416 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YPL071C	Q02864	156 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RAF1	Q06891	181 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	ROX1	P25042	368 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	COS111	P38308	924 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	MET18	P40469	1032 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	MEP2	P41948	499 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	FMP32	P43557	207 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	NCE101	Q02820	53 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	SPR28	Q04921	423 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	GMC2	Q06201	188 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	SWM1	Q12379	170 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	COS2	P0CX12	379 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	COS3	P0CX13	379 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	PET123	P17558	318 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	OCA4	P25366	362 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	PBN1	P25580	416 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	SSO1	P32867	290 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	PHO89	P38361	574 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YER010C	P40011	234 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	5.16	□□□□□ -1.58	not detected
SYF2	YGR129W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	COS4	P43542	379 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YJR154W	P47181	346 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	MSE1	P48525	536 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	TAF6	P53040	516 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	GTR2	P53290	341 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YNL058C	P53947	316 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	ASI1	P54074	624 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	BUR2	Q05949	395 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YLR040C	Q07988	224 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	ATG34	Q12292	412 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	CBS1	P14066	229 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	NMT1	P14743	455 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	PDX1	P16451	410 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	MRPL25	P23369	157 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	BYE1	P36106	594 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	MTC6	P38849	526 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	YHR177W	P38867	453 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	ECM10	P39987	644 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	SHO1	P40073	367 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	BIT61	P47041	543 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	BIO4	P53630	237 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	IRC15	Q02733	499 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	YOL019W	Q08157	551 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	APC9	Q12107	265 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	YPR096C	O13587	100 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	TFS1	P14306	219 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	MDH2	P22133	377 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	DBF20	P32328	564 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	ANS1	P38832	159 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	NSG1	P38837	291 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	JEM1	P40358	645 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	ZIP2	P53061	704 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	SHR3	Q02774	210 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	MRPL1	Q04599	285 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	YLR224W	Q05947	369 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
SYF2	YGR129W	RPB9	P27999	122 aa		5.13	□□□□□ -1.59

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