RNA–Protein interactions for RNA: YBL069W

AST1, Transcript of Lipid raft associated protein, yeast

Gene AST1, Length 1,290 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AST1	YBL069W	CLN3	P13365	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	YCL068C	P25593	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	INM1	P38710	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	PAN6	P40459	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	BRO1	P48582	844 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	ROG1	P53118	685 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	VPS9	P54787	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	RAD50	P12753	1312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	ALG1	P16661	449 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	PHO91	P27514	894 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	POP5	P28005	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	BTN2	P53286	410 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	CCE1	Q03702	353 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	NCA2	Q12374	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	FLO1	P32768	1537 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	MDL1	P33310	695 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	SWD3	P38123	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	SIM1	P40472	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	RAX1	Q08760	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	REV1	P12689	985 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	NAM2	P11325	894 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	KAR9	P32526	644 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
AST1	YBL069W	SKN1	P33336	771 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	QDR3	P38227	689 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	YIL029C	P40538	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	TOS3	P43637	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	SBE22	P38814	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	COX14	P39103	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	VAB2	P40003	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	JEM1	P40358	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	MEH1	Q02205	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	NDE2	Q07500	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	HRT3	Q12347	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AST1	YBL069W	CAP2	P13517	287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	YEL045C	P32616	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	SDS24	P38314	527 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	MDE1	P47095	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	PEX25	Q02969	394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	CEX1	Q12453	761 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	OPI3	P05375	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	YSC83	P32792	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	COX13	P32799	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	NSE1	Q07913	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	AHC1	Q12433	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	OPI1	P21957	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	MRM2	P53123	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	RNH203	Q12338	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	PHA2	P32452	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	UIP5	P36137	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	MRPL10	P36520	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	YHR131C	P38835	850 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	MNL1	P38888	796 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	MTQ1	P53944	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	ECM7	Q06200	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	NDL1	Q06568	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	MDM36	Q06820	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	FDH1	Q08911	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	RBD2	Q12270	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	CSE2	P33308	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	PAC11	P40960	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	IRC25	Q07951	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	RXT2	P38255	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	MLH1	P38920	769 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	ATM1	P40416	690 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	LCB3	P47013	409 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	TOS2	P50078	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	PMT5	P52867	743 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	SDT1	P53078	280 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	YIP5	P53108	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	SPR6	Q01684	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AST1	YBL069W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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