RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	STE7	P06784	515 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SKN1	P33336	771 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	NAT2	P37293	288 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	FMP52	P40008	231 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	AYR1	P40471	297 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SPT20	P50875	604 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	HOL1	P53389	586 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MEH1	Q02205	184 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	CYK3	Q07533	885 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	TEC1	P18412	486 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
PDR10	YOR328W	OMA1	P36163	345 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MED8	P38304	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YHR033W	P38690	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	AIM2	P39721	246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	STE24	P47154	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	IMA1	P53051	589 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YGR026W	P53217	278 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	ATF2	P53296	535 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	AAH1	P53909	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YML096W	Q04489	525 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	DCI1	Q08558	271 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	GPB1	Q08886	897 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	CDC7	P06243	507 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PPH21	P23594	369 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SWS2	P53937	143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MRX10	Q05648	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	REX4	Q08237	289 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YNG1	Q08465	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MMP1	Q12372	583 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PHO5	P00635	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	OCA4	P25366	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SRP101	P32916	621 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	OAR1	P35731	278 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SAF1	P38352	637 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YHR219W	P38900	624 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	FAA3	P39002	694 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YJL043W	P47053	257 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	TNA1	P53322	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YNR014W	P53719	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	ECM11	Q04110	302 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	ROY1	Q04847	553 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	GIC2	Q06648	383 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	CNA1	P23287	553 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	TIR3	P40552	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	FAR7	P43592	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	NRK1	P53915	240 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MLH3	Q12083	715 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	NMD4	Q12129	218 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PDR3	P33200	976 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PLB1	P39105	664 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SEN34	P39707	275 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	IDP2	P41939	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SNF12	P53628	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	PUN1	Q06991	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	TOP3	P13099	656 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	MER1	P16523	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	DIT1	P21623	536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	RCK1	P38622	512 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	SDP1	P40479	209 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	FET5	P43561	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	TWF1	P53250	332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	OKP1	P53298	406 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YNL095C	P53932	642 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	HTA2	P04912	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PDR10	YOR328W	NAM2	P11325	894 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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