RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W NOP9P47077 666 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SWP1Q02795 286 aa3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MSC1Q03104 513 aa3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ASA1Q06822 443 aa3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data3.82□□□□□ -1.8not detected
SPC105YGL093W PEX6P33760 1030 aa3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W FES1P38260 290 aa3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W PEX18P38855 283 aa3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SER3P40054 469 aa3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W HOL1P53389 586 aa3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RSA1Q08932 381 aa3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RIB3Q99258 208 aa3.82□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W DPH5P32469 300 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YHR210CP38893 341 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data3.81□□□□□ -1.8not detected
SPC105YGL093W SNL1P40548 159 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W FAR7P43592 221 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MDE1P47095 244 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RMR1P53060 241 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ERP6P53198 216 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YGR067CP53243 804 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YGR079WP53249 370 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RHO5P53879 331 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YDL211CQ12121 372 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W PSY3Q12318 242 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SKS1Q12505 502 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W CDC4P07834 779 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ATR1P13090 542 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W GRR1P24814 1151 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MEF1P25039 761 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YCR102CP25608 368 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MPM1P40364 252 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W TED1P40533 473 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W COG5P53951 403 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SPR6Q01684 191 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YSA1Q01976 231 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ATP25Q03153 612 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W KRE28Q04431 385 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W DCR2Q05924 578 aa3.81□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MF(ALPHA)1P01149 165 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RPL24AP04449 155 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W HAP4P14064 554 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MCK1P21965 375 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MDJ1P35191 511 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ECM15P35195 104 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SPC34P36131 295 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W EXO84P38261 753 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SMK1P41808 388 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SHR5P41912 237 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W NUP57P48837 541 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YGR168CP53293 376 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W NCE101Q02820 53 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W TFB3Q03290 321 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SPC19Q03954 165 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W NAT4Q04751 285 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RAX1Q08760 435 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W TPO4Q12256 659 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W CAR2P07991 424 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W TFS1P14306 219 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YAK1P14680 807 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RPT5P33297 434 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W BCK2P33306 851 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W AST1P35183 429 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YLF2P38746 405 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ALP1P38971 573 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YEL020CP39994 560 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W UTP25P40498 721 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W PKP1P40530 394 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MET28P40573 187 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YJR142WP47173 342 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W IMD4P50094 524 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W EXG2P52911 562 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W LSG1P53145 640 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MPC1P53157 130 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SUR7P54003 302 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YLR446WQ06204 433 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YIM1P28625 365 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W LHP1P33399 275 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W TOD6P34219 525 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SPC42P36094 363 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YEL068CP39977 110 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ISC1P40015 477 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ZRG8P40021 1076 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SPO73P40031 143 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W CHA4P43634 648 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W CDH1P53197 566 aa3.8□□□□□ -1.8
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