RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	RIM21	P48565	533 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YGR079W	P53249	370 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	ATF2	P53296	535 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RSC9	Q03124	581 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RIM13	Q03792	727 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	DIC1	Q06143	298 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	REH1	Q06709	432 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	NKP1	Q12493	238 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	CTR86	P25355	563 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YGR012W	P53206	393 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	REC102	Q02721	264 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	SWP1	Q02795	286 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RAD30	Q04049	632 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	KRE28	Q04431	385 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RSF1	Q05043	376 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	GIC2	Q06648	383 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	FDH1	Q08911	376 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	MRX4	Q12467	430 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YIM1	P28625	365 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	BIG1	P38813	335 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YNL181W	P53878	407 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	ARO10	Q06408	635 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	OPT2	Q06593	877 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	BSC1	Q12140	328 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	SKS1	Q12505	502 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	FMP27	Q06179	2628 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	IMG1	P25626	169 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YME2	P32843	850 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	MSN2	P33748	704 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	LHS1	P36016	881 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	SIC1	P38634	284 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	SPO73	P40031	143 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	SNM1	P40993	198 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	TWF1	P53250	332 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	DAM1	P53267	343 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	SWA2	Q06677	668 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	SKM1	Q12469	655 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	TUL1	P36096	758 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	ECM8	P38246	354 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	RCY1	P39531	840 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	TED1	P40533	473 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	MSS2	P40990	351 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	BIT61	P47041	543 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	AAD10	P47182	288 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	PRM8	P53174	237 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	CDH1	P53197	566 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	COG5	P53951	403 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	GLE1	Q12315	538 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	MHF1	Q3E835	90 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	YOR019W	Q99248	730 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDR2	YOL052C-A	TPK3	P05986	398 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	MRPL32	P25348	183 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.2	□□□□□ -0.78	not detected
DDR2	YOL052C-A	PET112	P33893	541 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	DCI1	Q08558	271 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YPL066W	Q12194	479 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	SEC2	P17065	759 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	AAC3	P18238	307 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	CNA1	P23287	553 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	RHB1	P25378	209 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	GOS1	P38736	223 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	COG3	P40094	801 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	MET28	P40573	187 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YFL066C	P43538	392 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	TIM54	P47045	478 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YLR456W	Q06199	204 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YPR172W	Q06608	200 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	BSC6	Q08280	497 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	CBS1	P14066	229 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	GSH1	P32477	678 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	MRPL15	P36523	253 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YLF2	P38746	405 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	CFD1	P40558	293 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	RNH70	P53331	553 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	SIZ1	Q04195	904 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YPR091C	Q06833	770 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	APN1	P22936	367 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YBR138C	P38277	524 aa		10.17	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms