RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	MSK1	P32048	576 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	AST1	P35183	429 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	PEX7	P39108	375 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	PHM8	P40025	321 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	BAP3	P41815	604 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	SCW11	P53189	542 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	ORC3	P54790	616 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	UBP16	Q02863	499 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	FMP30	Q02883	468 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YMR087W	Q04299	284 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	SPO77	Q06134	477 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	SEC10	Q06245	871 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	SOR2	Q07786	357 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	REX4	Q08237	289 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	GRE1	Q08969	168 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	RAD1	P06777	1100 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	ACH1	P32316	526 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	TAF6	P53040	516 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YGL159W	P53110	370 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	VAC7	P53950	1165 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	CDC123	Q05791	360 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	DCR2	Q05924	578 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	THI7	Q05998	598 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	ATG17	Q06410	417 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	CDA2	Q06703	312 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	MSH5	Q12175	901 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	TRM13	Q12383	476 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	RGS2	Q99188	309 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	TRP3	P00937	484 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	GAL10	P04397	699 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	ATP10	P18496	279 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	DAL82	P21705	255 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	CNA1	P23287	553 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	ERG9	P29704	444 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	ELF1	P36053	145 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	MIC12	P38341	106 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	DBP8	P38719	431 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YPT11	P48559	417 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	STB4	P50104	949 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YGR168C	P53293	376 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	ARP10	Q04549	284 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	DUS4	Q06063	367 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	RRI1	Q12468	440 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	FSH3	Q99369	266 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	SWR1	Q05471	1514 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	SEN2	P16658	377 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	LIP5	P32875	414 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	CTP1	P38152	299 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	HIS2	P38635	335 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	STP2	P38704	541 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	ERG28	P40030	148 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YMR134W	P40207	237 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	MTQ1	P53944	314 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	KRE28	Q04431	385 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YML053C	Q04978	212 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YDL057W	Q07379	328 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	GPM2	Q12008	311 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	FRE7	Q12333	620 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	MAS2	P11914	482 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	MRPL8	P22353	238 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YKL162C	P36052	402 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	NDC80	P40460	691 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YPS6	P40583	537 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	PHO86	P46956	311 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	BUD17	P53727	317 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	ATG4	P53867	494 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	YNL092W	P53934	400 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TOP1	YOL006C	RSM23	Q01163	450 aa		3.18	□□□□□ -1.9

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