RNA–Protein interactions for RNA: YJL198W

PHO90, Transcript of Low-affinity phosphate transporter, yeast

Gene PHO90, Length 2,646 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PHO90	YJL198W	DMC1	P25453	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	PEX34	P25584	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	ERG9	P29704	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	NTG1	P31378	399 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	ECM25	P32525	599 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	MRPL3	P36516	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	GIP2	P40036	548 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	PRM2	P40534	656 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
PHO90	YJL198W	YJL043W	P47053	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	PEX25	Q02969	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	TRM82	Q03774	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	ASM4	Q05166	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	INM2	Q05533	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YPD1	Q07688	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	AAD4	Q07747	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	NMD4	Q12129	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	ISA2	Q12425	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SET6	Q12529	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	MRPL8	P22353	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	VMA16	P23968	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	PTP1	P25044	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SED4	P25365	1065 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	MRP20	P32387	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SDH3	P33421	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YBR056W	P38081	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	TOS1	P38288	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	PCA1	P38360	1216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	UME6	P39001	836 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	FHL1	P39521	936 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	VRG4	P40107	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	NSE4	P43124	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	BST1	P43571	1029 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	PTR3	P43606	678 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YGL117W	P53133	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YGR111W	P53265	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	AEP3	Q12089	606 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	NSL1	Q12143	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	OSW2	Q12202	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	LCB4	Q12246	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	RBD2	Q12270	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	FRE6	Q12473	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	DAL81	P21657	970 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YCK1	P23291	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	KRE6	P32486	720 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SCM4	P32564	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SPO23	P33757	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SRB2	P34162	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SPC34	P36131	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	CST26	P38226	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SPR6	Q01684	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	HSP31	Q04432	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	FRE5	Q08908	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	PPZ1	P26570	692 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	GAC1	P28006	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SCO2	P38072	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YHR131C	P38835	850 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	ACO2	P39533	789 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	TAH11	P47112	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	PMT5	P52867	743 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YNR061C	P53747	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	REG1	Q00816	1014 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	IRC4	Q03036	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SEN15	Q04675	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	AIM32	Q04689	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	COX17	Q12287	69 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	CHS2	P14180	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YPT7	P32939	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SRO77	P38163	1010 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YNR068C	P53754	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	PRM6	Q04705	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	TRI1	Q05024	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	RAD34	Q06665	692 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	FBP1	P09201	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	DAL2	P25335	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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