RNA–Protein interactions for RNA: YHR120W

MSH1, Transcript of DNA-binding protein of the mitochondria, yeast

Gene MSH1, Length 2,880 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSH1	YHR120W	YIL086C	P40503	102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	APQ12	P40532	138 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	FAR7	P43592	221 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	GTO1	P48239	356 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	RSC9	Q03124	581 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	TRS23	Q03784	219 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	MLH3	Q12083	715 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	FRE7	Q12333	620 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	MET17	P06106	444 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	GAL3	P13045	520 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	SRB5	P32585	307 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	MRPL15	P36523	253 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	YRO2	P38079	344 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	MNL1	P38888	796 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	MET12	P46151	657 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	BIT61	P47041	543 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	IBA57	P47158	497 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	SDH1	Q00711	640 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	MDM12	Q92328	271 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	TRX3	P25372	127 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	YCL049C	P25577	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	YBR071W	P38243	211 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	BMT2	P38278	337 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	JLP2	P40206	208 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	DAM1	P53267	343 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	RRN5	Q02983	363 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSH1	YHR120W	PBS2	P08018	668 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	HCS1	P34243	683 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	CBP4	P37267	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	BAP2	P38084	609 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	YAR028W	P39548	234 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	DDI1	P40087	428 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	PMT3	P47190	753 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	TRM9	P49957	279 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	ROM1	P53046	1155 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	YGR266W	P53326	701 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	MPS1	P54199	764 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	GIC2	Q06648	383 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	THP1	Q08231	455 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	CDC5	P32562	705 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	APT2	P36973	181 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	RSM10	Q03201	203 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	RCF1	Q03713	159 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	MDM36	Q06820	579 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	MCA1	Q08601	432 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	RPN6	Q12377	434 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	AI4	P03878	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	ARG81	P05085	880 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	FAU1	P40099	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	GRX3	Q03835	250 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	BSC2	Q05611	235 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	VID22	Q05934	901 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	NSI1	Q12457	570 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	RPN13	O13563	156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	ACH1	P32316	526 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	YHR210C	P38893	341 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	YEL020C	P39994	560 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	MAD2	P40958	196 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	ASK10	P48361	1146 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	TOM22	P49334	152 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	APC4	Q04601	652 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSH1	YHR120W	TEN1	Q07921	160 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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