RNA–Protein interactions for RNA: YLR347W-A

YLR347W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR347W-A, Length 141 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR347W-AYLR347W-A SAM1P10659 382 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A SAM2P19358 384 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A RPC53P25441 422 aa3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A GEX1P25596 615 aa3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A TIP1P27654 210 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A STB6P36085 766 aa3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A MST28P39552 234 aa3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A YPI1P43587 155 aa3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A RRP46P53256 223 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A BNI5P53890 448 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A SKO1Q02100 647 aa3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A YDR131CQ03899 556 aa3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A ROY1Q04847 553 aa3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A DON1Q05610 365 aa3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A MDM30Q05930 598 aa3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A YPR022CQ12139 1133 aa3.36□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A PDX1P16451 410 aa3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A SRV2P17555 526 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A RHB1P25378 209 aa3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A BEM1P29366 551 aa3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A HIR2P32480 875 aa3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A MIX23P38162 196 aa3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A YIL067CP40514 678 aa3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A YFL067WP43537 175 aa3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A GOR1P53839 350 aa3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.35□□□□□ -1.87not detected
YLR347W-AYLR347W-A ESA1Q08649 445 aa3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A TIM18Q08749 192 aa3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A RSA1Q08932 381 aa3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A AFI1Q99222 893 aa3.35□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A SNF2P22082 1703 aa3.34□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A RIM15P43565 1770 aa3.34□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A URA7P28274 579 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A HSP104P31539 908 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data3.34□□□□□ -1.87not detected
YLR347W-AYLR347W-A OST1P41543 476 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A SPG5P42933 373 aa3.34□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A LAM5P43560 674 aa3.34□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A MPP10P47083 593 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A FRE4P53746 719 aa3.34□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A RRN11Q04712 507 aa3.34□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A RAD61Q99359 647 aa3.34□□□□□ -1.87
YLR347W-AYLR347W-A RSF2P46974 1380 aa3.34□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A SCEIP03882 235 aa3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A ARG4P04076 463 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A SPT15P13393 240 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A SPS22P25380 463 aa3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A ITR1P30605 584 aa3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A MPE1P35728 441 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A YBR139WP38109 508 aa3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A RIB5P38145 238 aa3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A RFS1P38234 210 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A RTR1P40084 226 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A YNR048WP53740 393 aa3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A ERB1Q04660 807 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A PBA1Q05778 276 aa3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A SGT1Q08446 395 aa3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A YOR387CQ08910 206 aa3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A YLR108CQ12259 485 aa3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A ERV2Q12284 196 aa3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A ORT1Q12375 292 aa3.33□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A CPR4P25334 318 aa3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A CTR86P25355 563 aa3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A LSB5P25369 354 aa3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A YBL059WP34224 193 aa3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A SOR1P35497 357 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A FAA2P39518 744 aa3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A HMS2P47175 358 aa3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A YGL242CP53066 181 aa3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A ELP3Q02908 557 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A RMT2Q03305 412 aa3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A YDL144CQ07589 356 aa3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A SOR2Q07786 357 aa3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A REX4Q08237 289 aa3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A RMD5Q12508 421 aa3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A RPO41P13433 1351 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A HHF1P02309 103 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A TEF1P02994 458 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A ILV5P06168 395 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A URA4P20051 364 aa3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A OSM1P21375 501 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A CLB1P24868 471 aa3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A DEG1P31115 442 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A TFB1P32776 642 aa3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A YOX1P34161 385 aa3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A APE3P37302 537 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A MMS4P38257 691 aa3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A NDT80P38830 627 aa3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A CAK1P43568 368 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A YMR181CQ03231 154 aa3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A TAF12Q03761 539 aa3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A ACL4Q03771 387 aa3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A ROM2P51862 1356 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YLR347W-AYLR347W-A CLN1P20437 546 aa3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.7 ms