RNA–Protein interactions for RNA: YKR021W

ALY1, Transcript of Alpha arrestin, substrate of calcineurin, yeast

Gene ALY1, Length 2,748 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ALY1	YKR021W	YML002W	P0CF17	737 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	TRS65	P32893	560 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RRN10	P38204	145 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	GPI15	P53961	229 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	DAP1	Q12091	152 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	AYT1	Q12226	474 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ORT1	Q12375	292 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	GDB1	Q06625	1536 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	DAP2	P18962	818 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YCR100C	P25606	316 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.61	□□□□□ -1.99	not detected
ALY1	YKR021W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	CAJ1	P39101	391 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	SHO1	P40073	367 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	GAT2	P40209	560 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	URH1	Q04179	340 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	BUG1	Q12191	341 aa		2.61	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ATR1	P13090	542 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ALG1	P16661	449 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	TMT1	P32643	299 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	PTR2	P32901	601 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	AVT4	P50944	713 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	GIP3	Q03016	1276 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YDR286C	Q05530	114 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	FRE6	Q12473	712 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	PMR1	P13586	950 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	NDI1	P32340	513 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YSW1	P38280	609 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YNR048W	P53740	393 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	FRE4	P53746	719 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	PGC1	Q08959	321 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	HEM2	P05373	342 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	YCR041W	P37265	110 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	GPI16	P38875	610 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	RPH1	P39956	796 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	ELP2	P42935	788 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	NDD1	Q08887	554 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ALY1	YKR021W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	PMU1	P36069	295 aa		2.59	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	MST28	P39552	234 aa		2.59	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	CHS6	P40955	746 aa		2.59	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	HAP1	P0CE41	1502 aa		2.59	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	CYB2	P00175	591 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	SPO12	P17123	173 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	RGT1	P32862	1170 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	PFF1	P38244	976 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	STP2	P38704	541 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
ALY1	YKR021W	NAS2	P40555	220 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	GRX3	Q03835	250 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	ATG34	Q12292	412 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	LSB5	P25369	354 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	DAD2	P36162	133 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	RRF1	P38771	230 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	HMS2	P47175	358 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	GPI8	P49018	411 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	TOF1	P53840	1238 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	MRP51	Q02950	344 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	SGT1	Q08446	395 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	NFI1	Q12216	726 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	RUP1	Q12242	671 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	SET6	Q12529	373 aa		2.58	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	CHS1	P08004	1131 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	IMA3	P0CW40	589 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	IMA4	P0CW41	589 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	YAR066W	P0CX18	203 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	YHR214W	P0CX19	203 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	RSM22	P36056	628 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	RTT107	P38850	1070 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	SAD1	P43589	448 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	YDL186W	P48568	277 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	PIR3	Q03180	325 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	GRS2	Q06817	618 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	IMA2	Q08295	589 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	STH1	P32597	1359 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	IQG1	Q12280	1495 aa		2.57	□□□□□ -2
ALY1	YKR021W	DNF3	Q12674	1656 aa		2.57	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.6 ms