RNA–Protein interactions for RNA: YNL198C

YNL198C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL198C, Length 303 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL198C	YNL198C	MUM2	P38236	366 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	MET14	Q02196	202 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	MSM1	P22438	575 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	PTP2	P29461	750 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	GYP6	P32806	458 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	MSR1	P38714	643 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	PFS1	P38872	237 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	YIL029C	P40538	142 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	MNN5	P46982	586 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	ECM27	P47144	725 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	SGS1	P35187	1447 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	GAL1	P04385	528 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	PEP3	P27801	918 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	EGT2	P42835	1041 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	VID30	P53076	958 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	FOL1	P53848	824 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	VPS54	Q12071	889 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	CEX1	Q12453	761 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	ZIP1	P31111	875 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	MAL33	P38157	468 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	CLD1	P53264	445 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	FRE4	P53746	719 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	VTI1	Q04338	217 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	BCH1	Q05029	724 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	FRM2	P37261	193 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	YHL041W	P38730	149 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	AZR1	P50080	613 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	LDS2	Q08218	356 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	NYV1	Q12255	253 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL198C	YNL198C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	INP2	Q03824	705 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	VPS38	Q05919	439 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	BLS1	Q06071	122 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	SBE22	P38814	852 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	0.2	□□□□□ -2.38	not detected
YNL198C	YNL198C	ACA1	P39970	489 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	ALG5	P40350	334 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	YIL059C	P40520	121 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	TRM8	Q12009	286 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	YOL087C	Q99247	1116 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	YOL085C	Q99345	113 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	PRE8	P23639	250 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	COX13	P32799	129 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	VHS2	P40463	436 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	PET130	P47065	347 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	DSL1	P53847	754 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	IPI3	P53877	555 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	YML037C	Q03703	340 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	FIN1	Q03898	291 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	YLR345W	Q06137	509 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	FRE8	Q12209	686 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	RAD57	P25301	460 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	TKL2	P33315	681 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	SKT5	P34226	696 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	COX14	P39103	70 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	PEX22	P39718	180 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	VID22	Q05934	901 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	CDD1	Q06549	142 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	RIM20	Q12033	661 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	RMD5	Q12508	421 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	ECM34	P38728	170 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	HAC1	P41546	238 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	SIP4	P46954	829 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	SFH5	P47008	294 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	MIX17	Q03667	156 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	SPE4	Q12455	300 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	STE7	P06784	515 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	BNA1	P47096	177 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	MRM2	P53123	320 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	RAD30	Q04049	632 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	YDR387C	Q04162	555 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	MFG1	Q07684	458 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	DDC1	Q08949	612 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	ORT1	Q12375	292 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL198C	YNL198C	PHA2	P32452	334 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YNL198C	YNL198C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
YNL198C	YNL198C	YER010C	P40011	234 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YNL198C	YNL198C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
YNL198C	YNL198C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
YNL198C	YNL198C	MAM33	P40513	266 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YNL198C	YNL198C	DOS2	P54858	310 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YNL198C	YNL198C	BET5	Q03630	159 aa		0.15	□□□□□ -2.39

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.5 ms