RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	CEM1	P39525	442 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	AFG3	P39925	761 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	RPH1	P39956	796 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YEL020C	P39994	560 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	NTA1	P40354	457 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SER33	P40510	469 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	BIT61	P47041	543 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	AIM22	P47051	409 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	NNF1	P47149	201 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	TIS11	P47977	285 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	RIM21	P48565	533 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YNL260C	P53846	198 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	IGO1	P53897	168 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MPS1	P54199	764 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SDH1	Q00711	640 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	RPN4	Q03465	531 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	CCE1	Q03702	353 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YPR114W	Q06107	315 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	GRS2	Q06817	618 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	IRC10	Q08118	586 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	BUD7	Q08754	746 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	PNS1	Q12412	539 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SNF8	Q12483	233 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	TIM9	O74700	87 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	STE3	P06783	470 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	DAL81	P21657	970 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PPH22	P23595	377 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	RHB1	P25378	209 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ADK2	P26364	225 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ALY1	P36117	915 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	BAP2	P38084	609 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YBR071W	P38243	211 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YHR219W	P38900	624 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	DUN1	P39009	513 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SSN3	P39073	555 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	GAT1	P43574	510 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	CSN12	P47130	423 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	AMA1	P50082	593 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SPC105	P53148	917 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	KXD1	P53158	218 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PRM8	P53174	237 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	COQ6	P53318	479 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	VPS74	Q06385	345 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	RAD34	Q06665	692 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YOL131W	Q08270	108 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	TRM8	Q12009	286 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	RBD2	Q12270	262 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SFM1	Q12314	213 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PRC1	P00729	532 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PBS2	P08018	668 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	UNG1	P12887	359 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	IDI1	P15496	288 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	STF2	P16965	84 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	GEX1	P25596	615 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MRPL9	P31334	269 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SEC17	P32602	292 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SDH3	P33421	198 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PHO11	P35842	467 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	GEX2	P36173	615 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	GPX2	P38143	162 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PHO12	P38693	467 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	VMA22	P38784	181 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	EXO1	P39875	702 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	COG3	P40094	801 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	BUR6	P40096	142 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MPM1	P40364	252 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PAN6	P40459	309 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
UBX7	YBR273C	ALR2	P43553	858 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MSE1	P48525	536 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MDM34	P53083	459 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	AIM14	P53109	570 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YGR168C	P53293	376 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SNF12	P53628	566 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YNL140C	P53910	189 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	NUP49	Q02199	472 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	FMP30	Q02883	468 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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