RNA–Protein interactions for RNA: YLR347W-A

YLR347W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR347W-A, Length 141 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR347W-AYLR347W-A YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa3.58□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A CAR1P00812 333 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A NDC1P32500 655 aa3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A FRE1P32791 686 aa3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A VID24P38263 362 aa3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A MBB1P39534 108 aa3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A TWF1P53250 332 aa3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A ZPR1P53303 486 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A JJJ1P53863 590 aa3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A MRPL19P53875 158 aa3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A SLG1P54867 378 aa3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A RLI1Q03195 608 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A PHO92Q06390 306 aa3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A ATG29Q12092 213 aa3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A YDL009CQ12210 107 aa3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A YMR230W-AQ3E7B5 62 aa3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A BCK1Q01389 1478 aa3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A RPL15AP05748 204 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A CDC31P06704 161 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A CKA1P15790 372 aa3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A GPI10P30777 616 aa3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A PTR2P32901 601 aa3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A SEC66P33754 206 aa3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A CMC1P36064 111 aa3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A RTT101P47050 842 aa3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A GPI1P53306 609 aa3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A MDM1Q01846 1127 aa3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A PDS5Q04264 1277 aa3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A ERP1Q05359 219 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A RBS1Q05672 457 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A RIM20Q12033 661 aa3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A LSP1Q12230 341 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A GRX6Q12438 231 aa3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A MET17P06106 444 aa3.55□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A PHO2P07269 559 aa3.55□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A MTF1P14908 341 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A ROX1P25042 368 aa3.55□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A BUD14P27637 709 aa3.55□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A MDM31P38880 579 aa3.55□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A HAP1P0CE41 1502 aa3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A MES1P00958 751 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A INH1P01097 85 aa3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A EXO70P19658 623 aa3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A PRO3P32263 286 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A SPC110P32380 944 aa3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A ATP11P32453 318 aa3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A PMT1P33775 817 aa3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A RPR2P40571 144 aa3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A HXT14P42833 540 aa3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A TAF11Q04226 346 aa3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A TAP42Q04372 366 aa3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A RQC1Q05468 723 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A RTT103Q05543 409 aa3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A YBR298C-AQ8TGK4 73 aa3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A YML133CQ03099 1374 aa3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A YLL067CQ07888 1374 aa3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A YLL066CQ99208 1374 aa3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A GLK1P17709 500 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A ATS1P31386 333 aa3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A MTC4P38335 694 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A KEL1P38853 1164 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A SMF1P38925 575 aa3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A CCT4P39078 528 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A RPH1P39956 796 aa3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A IRC15Q02733 499 aa3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A VPS74Q06385 345 aa3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A PPT2Q12036 173 aa3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A SET6Q12529 373 aa3.53□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A RED1P14291 827 aa3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A YCR022CP25620 114 aa3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A MFT1P33441 392 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A YMR147WP40218 223 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A URB2P47108 1174 aa3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A SRB7P47822 140 aa3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A YDL186WP48568 277 aa3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A COS10P52924 374 aa3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A YGL108CP53139 140 aa3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A AYT1Q12226 474 aa3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A RKM5Q12367 367 aa3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A RTN2Q12443 393 aa3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A CYB2P00175 591 aa3.51□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A SHO1P40073 367 aa3.51□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A SYG1P40528 902 aa3.51□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A YJL213WP40896 331 aa3.51□□□□□ -1.85
YLR347W-AYLR347W-A OCA1P50946 238 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.6 ms