RNA–Protein interactions for RNA: YGR165W

MRPS35, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS35, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS35	YGR165W	FMP45	Q07651	309 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	APE1	P14904	514 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	CLB1	P24868	471 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	PPZ1	P26570	692 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	RML2	P32611	393 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	HCS1	P34243	683 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	ASK1	P35734	292 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	AZF1	P41696	914 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	ZIM17	P42844	174 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	SLG1	P54867	378 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	GLO2	Q05584	274 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	MLH2	Q07980	695 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	RAD14	P28519	371 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	YER130C	P39959	443 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	YJR154W	P47181	346 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	MSS11	Q03825	758 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	SNA4	Q07549	140 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	DSE3	Q08729	430 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	SUC2	P00724	532 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	TYR1	P20049	452 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	ACH1	P32316	526 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	THI2	P38141	450 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	YIL152W	P40455	235 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	POP1	P41812	875 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	RSF1	Q05043	376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	PHO92	Q06390	306 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	NRT1	Q08485	598 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	ATP11	P32453	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	TFB1	P32776	642 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	YME2	P32843	850 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	SPC34	P36131	295 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	SPC97	P38863	823 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	SYG1	P40528	902 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	RIP-Chip
MRPS35	YGR165W	YML6	P51998	286 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	ALT2	P52892	507 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	SAM50	P53969	484 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	RBA50	Q04418	439 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	SOV1	Q04748	898 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	RGT2	Q12300	763 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	RRD2	Q12461	358 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	ARP6	Q12509	438 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPS35	YGR165W	SPS4	P09937	338 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	ATP10	P18496	279 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	HNM1	P19807	563 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	SEC62	P21825	274 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	YCR043C	P25361	127 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	ATO2	P32907	282 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	EFM2	P38347	419 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	SEC5	P89102	971 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	SLD5	Q03406	294 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	IVY1	Q04934	453 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	THI20	Q08224	551 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	RKM5	Q12367	367 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	RHO2	P06781	192 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	CLC1	P17891	233 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	GLN3	P18494	730 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	SNT1	P25357	1226 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	FRE1	P32791	686 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	PEX5	P35056	612 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	MET30	P39014	640 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	VPS52	P39904	641 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	YIL169C	P40442	995 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	GUF1	P46943	645 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	TCB2	P48231	1178 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	YGL138C	P53122	345 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	GYL1	Q04322	720 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	AFT2	Q08957	416 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 65.5 ms