RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C YCR087C-AP37263 153 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ASC1P38011 319 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SCO2P38072 301 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ROT2P38138 954 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BMT2P38278 337 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TSC10P38342 320 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PHO89P38361 574 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RIM11P38615 370 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C STP2P38704 541 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C INM1P38710 295 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS27BP38711 82 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C EFM1P38732 585 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YHL008CP38750 627 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C REV7P38927 245 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ALP1P38971 573 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PLB1P39105 664 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CIN4P39110 191 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PRP39P39682 629 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C FRT2P39734 528 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PZF1P39933 429 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RSP5P39940 809 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SER3P40054 469 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C UTP18P40362 594 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C AYR1P40471 297 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YIL067CP40514 678 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C APQ12P40532 138 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CFD1P40558 293 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C DSN1P40568 576 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C AXL1P40851 1208 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GAB1P41733 394 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C FKH2P41813 862 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TDA10P42938 290 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ALR2P43553 858 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data0.67□□□□□ -2.3not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C UBX6P47049 396 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C AIM22P47051 409 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YJL043WP47053 257 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YJR154WP47181 346 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ASK10P48361 1146 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RAD17P48581 401 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MUP1P50276 574 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YPT32P51996 222 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C AIF1P52923 378 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MIG2P53035 382 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TAF6P53040 516 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C IMA1P53051 589 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ZIP2P53061 704 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ROG1P53118 685 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ATF2P53296 535 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RNH70P53331 553 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HST2P53686 357 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CPR6P53691 371 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ESF2P53743 316 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C IST1P53843 298 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C IBD2P53892 351 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C DOS2P54858 310 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C REG1Q00816 1014 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SED5Q01590 340 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MRS2Q01926 470 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C OSH6Q02201 448 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RMI1Q02685 241 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C REC102Q02721 264 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RPM2Q02773 1202 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SLU7Q02775 382 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PEX25Q02969 394 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL109CQ02981 657 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ATP25Q03153 612 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C VPS16Q03308 798 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TY2A-DR2Q03483 438 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR209CQ03648 457 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TVP15Q03860 143 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ARX1Q03862 593 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CSN9Q03981 162 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SMA2Q04658 369 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RSF1Q05043 376 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR338CQ05497 695 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RIF2Q06208 395 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C VPS74Q06385 345 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RSC3Q06639 885 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C REH1Q06709 432 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YEH1Q07804 573 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TEN1Q07921 160 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YEH2Q07950 538 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YOL024WQ08172 172 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NBA1Q08229 501 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NOB1Q08444 459 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ESA1Q08649 445 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RPN8Q08723 338 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C UAF30Q08747 228 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RAX1Q08760 435 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SNX3Q08826 162 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C IOC2Q12072 812 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MLH3Q12083 715 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C REX3Q12090 404 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR049CQ12110 428 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BSC1Q12140 328 aa0.67□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.5 ms