RNA–Protein interactions for RNA: YLR347W-A

YLR347W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR347W-A, Length 141 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR347W-AYLR347W-A AVL9Q12500 764 aa3.65□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A GAL80P04387 435 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A PEP4P07267 405 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A ELO2P25358 347 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A PRD1P25375 712 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A VPS17P32913 551 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A ECM15P35195 104 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A MSR1P38714 643 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YJL070CP40361 888 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YJL068CP40363 299 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A DIM1P41819 318 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A RMD8P43620 662 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YJR154WP47181 346 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A ALT2P52892 507 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YGL082WP53155 381 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A DRN1P53255 507 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A RBG2P53295 368 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A FIN1Q03898 291 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A RBA50Q04418 439 aa3.64□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A MRP7P12687 371 aa3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A WBP1P33767 430 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A SPO22P40511 975 aa3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A MET28P40573 187 aa3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A ALK1P43633 760 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A AIM22P47051 409 aa3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A TOF2Q02208 771 aa3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A VPS72Q03388 795 aa3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YMR087WQ04299 284 aa3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YMR317WQ04893 1140 aa3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A GLO2Q05584 274 aa3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A COG4Q06096 861 aa3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A DAP1Q12091 152 aa3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A RAD52P06778 471 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A PMS1P14242 873 aa3.62□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A SEC62P21825 274 aa3.62□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A RPN12P32496 274 aa3.62□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YME1P32795 747 aa3.62□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A SHP1P34223 423 aa3.62□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A MUM2P38236 366 aa3.62□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YEL057CP39983 233 aa3.62□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A ESL1P40456 1118 aa3.62□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A CSM2P40465 213 aa3.62□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A THP1Q08231 455 aa3.62□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A NUP192P47054 1683 aa3.62□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A FOB1O13329 566 aa3.61□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A SUC2P00724 532 aa3.61□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A ARG3P05150 338 aa3.61□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A APE1P14904 514 aa3.61□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A MRE11P32829 692 aa3.61□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YNK1P36010 153 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A OSH3P38713 996 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A TIF4631P39935 952 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A NDE1P40215 560 aa3.61□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A DOT5P40553 215 aa3.61□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A IRC6P43615 237 aa3.61□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A PET130P47065 347 aa3.61□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A KRE5P22023 1365 aa3.61□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A MRS3P10566 314 aa3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A PRP2P20095 876 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A PAP1P29468 568 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A SIP2P34164 415 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A BNA4P38169 460 aa3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data3.6□□□□□ -1.83not detected
YLR347W-AYLR347W-A IKS1P47042 667 aa3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YGL260WP53056 76 aa3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A CRZ1P53968 678 aa3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A RPM2Q02773 1202 aa3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A HCR1Q05775 265 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A TSR2Q06672 205 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A RTP1Q12751 981 aa3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A RAD9P14737 1309 aa3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A RAV1P47104 1357 aa3.6□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YML002WP0CF17 737 aa3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A AMD1P15274 810 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YCR007CP25354 239 aa3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A MSN2P33748 704 aa3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A FMP46P36141 133 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A DUG2P38149 878 aa3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A CST26P38226 397 aa3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A TCM62P38228 572 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A UTP9P38882 575 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A ERP2P39704 215 aa3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A VPS52P39904 641 aa3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A ROK1P45818 564 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.83not detected
YLR347W-AYLR347W-A HEF3P53978 1044 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A SLD5Q03406 294 aa3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A YDR239CQ03780 787 aa3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A BNA5Q05979 453 aa3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A SEC39Q12745 709 aa3.59□□□□□ -1.83
YLR347W-AYLR347W-A COR1P07256 457 aa3.58□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A UTR4P32626 227 aa3.58□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A MET18P40469 1032 aa3.58□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A IVY1Q04934 453 aa3.58□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A MRD1Q06106 887 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A SYO1Q07395 620 aa3.58□□□□□ -1.84
YLR347W-AYLR347W-A TIP41Q12199 356 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms