RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C CDC1P40986 491 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C QRI7P43122 407 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SNZ3P43545 298 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C VPS25P47142 202 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PMT3P47190 753 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C BRO1P48582 844 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C BTN2P53286 410 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SNZ2P53824 298 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SLG1P54867 378 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YAT1P80235 687 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C NGL3Q03210 505 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C HER2Q03557 464 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C ATG16Q03818 150 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C SXM1Q04175 944 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
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GCN4YEL009C ERV41Q04651 352 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C TAF9Q05027 157 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YDR278CQ05612 105 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C PIG1Q06216 648 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C APC5Q08683 685 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C DDC1Q08949 612 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C NBP2Q12163 236 aa2.28□□□□□ -2.04
GCN4YEL009C YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa2.28□□□□□ -2.04
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GCN4YEL009C YLR462WO13556 202 aa2.27□□□□□ -2.05
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GCN4YEL009C SAN1P22470 610 aa2.27□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C MNN2P38069 597 aa2.27□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C SWC5P38326 303 aa2.27□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YHL049CP38722 271 aa2.27□□□□□ -2.05
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GCN4YEL009C FHL1P39521 936 aa2.27□□□□□ -2.05
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GCN4YEL009C ASG1P40467 964 aa2.27□□□□□ -2.05
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GCN4YEL009C SAP185P40856 1058 aa2.27□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YFL064CP43540 174 aa2.27□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C GUF1P46943 645 aa2.27□□□□□ -2.05
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GCN4YEL009C YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
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GCN4YEL009C AIM32Q04689 311 aa2.27□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C IVY1Q04934 453 aa2.27□□□□□ -2.05
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GCN4YEL009C THI20Q08224 551 aa2.27□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C SPE3Q12074 293 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YBL111CQ3E7Y5 667 aa2.27□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C LAA1P39526 2014 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data2.26□□□□□ -2.05 RIP-Chip
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GCN4YEL009C PMS1P14242 873 aa2.26□□□□□ -2.05
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GCN4YEL009C DPB3P27344 201 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C PAP1P29468 568 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C PRE2P30656 287 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C RAD16P31244 790 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C BYE1P36106 594 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YBR225WP38321 900 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YHR131CP38835 850 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C LCP5P40079 357 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C GPP2P40106 250 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
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GCN4YEL009C RPC17P47076 161 aa2.26□□□□□ -2.05
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GCN4YEL009C PEX31P53203 462 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YNL247WP53852 767 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C KTR6P54070 446 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C VPS60Q03390 229 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C URH1Q04179 340 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C ECI1Q05871 280 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C KAP95Q06142 861 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YPQ1Q12010 308 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C ARP7Q12406 477 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C RRD2Q12461 358 aa2.26□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C RAD10P06838 210 aa2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C MTF1P14908 341 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C MET16P18408 261 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C SLY1P22213 666 aa2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YIH1P25637 258 aa2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C MEI4P29467 408 aa2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C HXT3P32466 567 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C YEL043WP32618 956 aa2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C GCG1P32656 232 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C DUG2P38149 878 aa2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C ECM13P38195 257 aa2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C MMS21P38632 267 aa2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C END3P39013 349 aa2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C PRM9P39551 298 aa2.25□□□□□ -2.05
GCN4YEL009C ERP2P39704 215 aa2.25□□□□□ -2.05
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