RNA–Protein interactions for RNA: YOR304W

ISW2, Transcript of ATP-dependent DNA translocase involved in chromatin remodeling, yeast

Gene ISW2, Length 3,363 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ISW2	YOR304W	FPK1	P53739	893 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	IOC3	P43596	787 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	UBX5	Q06682	500 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	RNH70	P53331	553 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	YGR273C	P53329	174 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	YHL050C	P38721	697 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	YHR219W	P38900	624 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	SCY1	P53009	804 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	ESS1	P22696	170 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	SEC8	P32855	1065 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	ASF1	P32447	279 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	PRY3	P47033	881 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	POL32	P47110	350 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	YJR107W	P47145	328 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	NNF1	P47149	201 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	RTS3	P53289	263 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	CIT2	P08679	460 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	SEC20	P28791	383 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	PPX1	P38698	397 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	SIT4	P20604	311 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	BUD6	P41697	788 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	SVF1	Q05515	481 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ISW2	YOR304W	SIS2	P36024	562 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	MET4	P32389	672 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	FRT1	Q99332	602 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	ALD3	P54114	506 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	BOL3	P39724	118 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	ECM23	Q02710	187 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	TAT2	P38967	592 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	MNL2	Q12205	849 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	RAD54	P32863	898 aa		5	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	OSW7	P43611	510 aa		5	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	PDR1	P12383	1068 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	GUT1	P32190	709 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	TOM20	P35180	183 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	MMP1	Q12372	583 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	YOR238W	Q08634	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	MET1	P36150	593 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	FYV10	P40492	516 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	ALG12	P53730	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	GRX4	P32642	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	GAL2	P13181	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	NUT2	Q06213	157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	VAC8	P39968	578 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	RPN4	Q03465	531 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ISW2	YOR304W	KAR5	Q04746	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	KIC1	P38692	1080 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	UBX7	P38349	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	ATG1	P53104	897 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	ARG8	P18544	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	MTO1	P53070	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	TSR4	P25040	408 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	ROM1	P53046	1155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	VPS16	Q03308	798 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	CLB5	P30283	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	KTR7	P40504	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	ATH1	P48016	1211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	RTF1	P53064	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	MDG1	P53885	366 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	SPR28	Q04921	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	MCM16	Q12262	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	PPM2	Q08282	695 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	SAM3	Q08986	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	PIN2	Q12057	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	NSE3	Q05541	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	ISF1	P32488	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	APL6	P46682	809 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	PIB1	Q06651	286 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	VPS72	Q03388	795 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	PNP1	Q05788	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ISW2	YOR304W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected

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