RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	THI13	Q07748	340 aa		14.47	□□□□□ -0.09
DDR2	YOL052C-A	PSK1	P31374	1356 aa		14.47	□□□□□ -0.09
DDR2	YOL052C-A	SPT7	P35177	1332 aa		14.45	□□□□□ -0.1
DDR2	YOL052C-A	CPS1	P27614	576 aa		14.45	□□□□□ -0.1
DDR2	YOL052C-A	FKH1	P40466	484 aa		14.45	□□□□□ -0.1
DDR2	YOL052C-A	PPH3	P32345	308 aa		14.42	□□□□□ -0.1
DDR2	YOL052C-A	RTG3	P38165	486 aa		14.39	□□□□□ -0.11
DDR2	YOL052C-A	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	14.39	□□□□□ -0.11
DDR2	YOL052C-A	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	14.38	□□□□□ -0.11
DDR2	YOL052C-A	YFR006W	P43590	535 aa		14.37	□□□□□ -0.11
DDR2	YOL052C-A	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	14.35	□□□□□ -0.11
DDR2	YOL052C-A	YML133C	Q03099	1374 aa		14.34	□□□□□ -0.11
DDR2	YOL052C-A	YLL067C	Q07888	1374 aa		14.34	□□□□□ -0.11
DDR2	YOL052C-A	YLL066C	Q99208	1374 aa		14.34	□□□□□ -0.11
DDR2	YOL052C-A	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	14.32	□□□□□ -0.12
DDR2	YOL052C-A	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	14.28	□□□□□ -0.12
DDR2	YOL052C-A	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	14.28	□□□□□ -0.12
DDR2	YOL052C-A	LEU3	P08638	886 aa		14.26	□□□□□ -0.13
DDR2	YOL052C-A	NST1	P53935	1240 aa		14.25	□□□□□ -0.13
DDR2	YOL052C-A	TAP42	Q04372	366 aa		14.24	□□□□□ -0.13
DDR2	YOL052C-A	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	14.23	□□□□□ -0.13
DDR2	YOL052C-A	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	14.23	□□□□□ -0.13	not detected
DDR2	YOL052C-A	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		14.22	□□□□□ -0.13
DDR2	YOL052C-A	TY4B-J	P47024	1803 aa		14.22	□□□□□ -0.13
DDR2	YOL052C-A	IOC4	Q04213	475 aa		14.22	□□□□□ -0.13
DDR2	YOL052C-A	PTP3	P40048	928 aa		14.21	□□□□□ -0.13
DDR2	YOL052C-A	RTF1	P53064	558 aa		14.21	□□□□□ -0.13
DDR2	YOL052C-A	CSE4	P36012	229 aa		14.2	□□□□□ -0.14
DDR2	YOL052C-A	GRX4	P32642	244 aa		14.19	□□□□□ -0.14
DDR2	YOL052C-A	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
DDR2	YOL052C-A	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	14.17	□□□□□ -0.14
DDR2	YOL052C-A	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	14.17	□□□□□ -0.14
DDR2	YOL052C-A	TRK1	P12685	1235 aa		14.13	□□□□□ -0.15
DDR2	YOL052C-A	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
DDR2	YOL052C-A	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	14.12	□□□□□ -0.15
DDR2	YOL052C-A	AUS1	Q08409	1394 aa		14.1	□□□□□ -0.15
DDR2	YOL052C-A	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	14.1	□□□□□ -0.15
DDR2	YOL052C-A	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
DDR2	YOL052C-A	HIM1	Q06674	414 aa		14.09	□□□□□ -0.15
DDR2	YOL052C-A	GAS4	Q08271	471 aa		14.07	□□□□□ -0.16
DDR2	YOL052C-A	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	14.06	□□□□□ -0.16
DDR2	YOL052C-A	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	14.04	□□□□□ -0.16
DDR2	YOL052C-A	SNF2	P22082	1703 aa		14.04	□□□□□ -0.16
DDR2	YOL052C-A	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
DDR2	YOL052C-A	YIL177C	P40434	1758 aa		14.03	□□□□□ -0.16
DDR2	YOL052C-A	YJL225C	P40889	1758 aa		14.03	□□□□□ -0.16
DDR2	YOL052C-A	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	YRF1-2	P40105	1681 aa		14.01	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	SLM3	Q12093	417 aa		14.01	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	FKS3	Q04952	1785 aa		13.99	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	APC1	P53886	1748 aa		13.98	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	ENT1	Q12518	454 aa		13.98	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	REB1	P21538	810 aa		13.97	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	YDL144C	Q07589	356 aa		13.96	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	TCB1	Q12466	1186 aa		13.96	□□□□□ -0.17
DDR2	YOL052C-A	CDC45	Q08032	650 aa		13.94	□□□□□ -0.18
DDR2	YOL052C-A	PRD1	P25375	712 aa		13.91	□□□□□ -0.18
DDR2	YOL052C-A	ENV9	Q08651	330 aa		13.91	□□□□□ -0.18
DDR2	YOL052C-A	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
DDR2	YOL052C-A	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.9	□□□□□ -0.18	not detected
DDR2	YOL052C-A	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
DDR2	YOL052C-A	APP1	P53933	587 aa		13.9	□□□□□ -0.18
DDR2	YOL052C-A	RSF2	P46974	1380 aa		13.89	□□□□□ -0.19
DDR2	YOL052C-A	XKS1	P42826	600 aa		13.88	□□□□□ -0.19
DDR2	YOL052C-A	DSD1	P53095	428 aa		13.88	□□□□□ -0.19
DDR2	YOL052C-A	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		13.87	□□□□□ -0.19
DDR2	YOL052C-A	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		13.87	□□□□□ -0.19
DDR2	YOL052C-A	YRF1-6	P53819	1859 aa		13.87	□□□□□ -0.19
DDR2	YOL052C-A	CTF4	Q01454	927 aa		13.86	□□□□□ -0.19
DDR2	YOL052C-A	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
DDR2	YOL052C-A	YRF1-4	O13559	1382 aa		13.84	□□□□□ -0.19
DDR2	YOL052C-A	IES2	P40154	320 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DDR2	YOL052C-A	THI22	Q06490	572 aa		13.83	□□□□□ -0.2
DDR2	YOL052C-A	RCR1	P38212	213 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DDR2	YOL052C-A	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
DDR2	YOL052C-A	SIR4	P11978	1358 aa		13.82	□□□□□ -0.2
DDR2	YOL052C-A	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
DDR2	YOL052C-A	SAP155	P43612	1002 aa		13.81	□□□□□ -0.2
DDR2	YOL052C-A	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
DDR2	YOL052C-A	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
DDR2	YOL052C-A	YNL050C	P53952	270 aa		13.8	□□□□□ -0.2
DDR2	YOL052C-A	NTH2	P35172	780 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DDR2	YOL052C-A	AOS1	Q06624	347 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DDR2	YOL052C-A	MEC3	Q02574	474 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDR2	YOL052C-A	TPD3	P31383	635 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDR2	YOL052C-A	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
DDR2	YOL052C-A	MAM1	P40065	302 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDR2	YOL052C-A	RTT109	Q07794	436 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDR2	YOL052C-A	YKL133C	P36066	463 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDR2	YOL052C-A	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
DDR2	YOL052C-A	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
DDR2	YOL052C-A	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
DDR2	YOL052C-A	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.73	□□□□□ -0.21	RIP-Chip

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37 ms